RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536159.2

CITED2-202, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene CITED2, Length 1,797 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2-202ENST00000536159 TMC1Q8TDI8 760 aa29.26■■■□□ 2.27
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CITED2-202ENST00000536159 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa29.24■■■□□ 2.27
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CITED2-202ENST00000536159 CDK19Q9BWU1 502 aa29.22■■■□□ 2.27
CITED2-202ENST00000536159 DIP2AQ14689 1571 aa29.22■■■□□ 2.27
CITED2-202ENST00000536159 ROBO2Q9HCK4 1378 aa29.21■■■□□ 2.27
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CITED2-202ENST00000536159 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa29.21■■■□□ 2.27
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CITED2-202ENST00000536159 MYOM1P52179 1685 aa29.19■■■□□ 2.26
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CITED2-202ENST00000536159 PIK3R4Q99570 1358 aa29.15■■■□□ 2.26
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CITED2-202ENST00000536159 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
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CITED2-202ENST00000536159 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa29.04■■■□□ 2.24
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CITED2-202ENST00000536159 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
CITED2-202ENST00000536159 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa29.01■■■□□ 2.23
CITED2-202ENST00000536159 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
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CITED2-202ENST00000536159 A0A1W2PP64 1363 aa28.97■■■□□ 2.23
CITED2-202ENST00000536159 CCDC61Q9Y6R9 512 aa28.97■■■□□ 2.23
CITED2-202ENST00000536159 NLRP13Q86W25 1043 aa28.96■■■□□ 2.23
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CITED2-202ENST00000536159 NUTM2FA1L443 756 aa28.94■■■□□ 2.22
CITED2-202ENST00000536159 CGNL1Q0VF96 1302 aa28.94■■■□□ 2.22
CITED2-202ENST00000536159 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa28.93■■■□□ 2.22
CITED2-202ENST00000536159 FAM9BQ8IZU0 186 aa28.93■■■□□ 2.22
CITED2-202ENST00000536159 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
CITED2-202ENST00000536159 PRR36Q9H6K5 1346 aa28.93■■■□□ 2.22
CITED2-202ENST00000536159 CD163L1Q9NR16 1453 aa28.92■■■□□ 2.22
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CITED2-202ENST00000536159 MORC1Q86VD1 984 aa28.88■■■□□ 2.21
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CITED2-202ENST00000536159 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
CITED2-202ENST00000536159 USP32Q8NFA0 1604 aa28.83■■■□□ 2.21
CITED2-202ENST00000536159 NSD2O96028 1365 aa28.83■■■□□ 2.21
CITED2-202ENST00000536159 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.2
CITED2-202ENST00000536159 PLEKHG3A1L390 1219 aa28.82■■■□□ 2.2
CITED2-202ENST00000536159 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP28.82■■■□□ 2.2
CITED2-202ENST00000536159 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP28.81■■■□□ 2.2
CITED2-202ENST00000536159 NWD1Q149M9 1564 aa28.81■■■□□ 2.2
CITED2-202ENST00000536159 FYB1O15117 783 aa28.8■■■□□ 2.2
CITED2-202ENST00000536159 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
CITED2-202ENST00000536159 GGNBP2Q9H3C7 697 aa28.8■■■□□ 2.2
CITED2-202ENST00000536159 ACEP12821 1306 aa28.79■■■□□ 2.2
CITED2-202ENST00000536159 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa28.78■■■□□ 2.2
CITED2-202ENST00000536159 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa28.77■■■□□ 2.2
CITED2-202ENST00000536159 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa28.77■■■□□ 2.2
CITED2-202ENST00000536159 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP28.76■■■□□ 2.19
CITED2-202ENST00000536159 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
CITED2-202ENST00000536159 ANKARQ7Z5J8 1434 aa28.75■■■□□ 2.19
CITED2-202ENST00000536159 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
CITED2-202ENST00000536159 STRCQ7RTU9 1775 aa28.73■■■□□ 2.19
CITED2-202ENST00000536159 NALCNQ8IZF0 1738 aa28.73■■■□□ 2.19
CITED2-202ENST00000536159 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
CITED2-202ENST00000536159 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa28.72■■■□□ 2.19
CITED2-202ENST00000536159 FMN2Q9NZ56 1722 aa28.69■■■□□ 2.18
CITED2-202ENST00000536159 NME9Q86XW9 330 aa28.68■■■□□ 2.18
CITED2-202ENST00000536159 C19orf44Q9H6X5 657 aa28.68■■■□□ 2.18
CITED2-202ENST00000536159 TMEM94Q12767 1356 aa28.67■■■□□ 2.18
CITED2-202ENST00000536159 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa28.66■■■□□ 2.18
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CITED2-202ENST00000536159 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP28.65■■■□□ 2.18
CITED2-202ENST00000536159 MTHFSP49914 203 aa28.65■■■□□ 2.18
CITED2-202ENST00000536159 USP6P35125 1406 aa28.65■■■□□ 2.18
CITED2-202ENST00000536159 AKAP12Q02952 1782 aa28.65■■■□□ 2.18
CITED2-202ENST00000536159 ESCO1Q5FWF5 840 aa28.64■■■□□ 2.18
CITED2-202ENST00000536159 PHF8Q9UPP1 1060 aa28.64■■■□□ 2.18
CITED2-202ENST00000536159 MON2Q7Z3U7 1717 aa28.63■■■□□ 2.17
CITED2-202ENST00000536159 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP28.63■■■□□ 2.17
CITED2-202ENST00000536159 ZRANB1Q9UGI0 708 aa28.63■■■□□ 2.17
CITED2-202ENST00000536159 DMRT2Q9Y5R5 561 aa28.63■■■□□ 2.17
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