RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533507.5

NDUFS3-211, Transcript of NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S3, humanhuman

TSL 2

Gene NDUFS3, Length 1,769 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS3-211ENST00000533507 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa36.79■■■■□ 3.48
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NDUFS3-211ENST00000533507 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP36.76■■■■□ 3.47
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NDUFS3-211ENST00000533507 PTCH1Q13635 1447 aa36.74■■■■□ 3.47
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NDUFS3-211ENST00000533507 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP36.71■■■■□ 3.47
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NDUFS3-211ENST00000533507 C14orf37Q86TY3 774 aa36.65■■■■□ 3.46
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NDUFS3-211ENST00000533507 NWD1Q149M9 1564 aa36.62■■■■□ 3.45
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NDUFS3-211ENST00000533507 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP36.61■■■■□ 3.45
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NDUFS3-211ENST00000533507 ATAD2Q6PL18 1390 aa36.48■■■■□ 3.43
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NDUFS3-211ENST00000533507 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa36.44■■■■□ 3.42
NDUFS3-211ENST00000533507 CABP1Q9NZU7 370 aa36.43■■■■□ 3.42
NDUFS3-211ENST00000533507 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP36.42■■■■□ 3.42
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NDUFS3-211ENST00000533507 PRR36Q9H6K5 1346 aa36.39■■■■□ 3.42
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NDUFS3-211ENST00000533507 NINLQ9Y2I6 1382 aa36.34■■■■□ 3.41
NDUFS3-211ENST00000533507 ATP7BP35670 1465 aa36.34■■■■□ 3.41
NDUFS3-211ENST00000533507 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa36.33■■■■□ 3.41
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NDUFS3-211ENST00000533507 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa36.27■■■■□ 3.4
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NDUFS3-211ENST00000533507 PHF8Q9UPP1 1060 aa36.17■■■■□ 3.38
NDUFS3-211ENST00000533507 LTBP4Q8N2S1 1624 aa36.16■■■■□ 3.38
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NDUFS3-211ENST00000533507 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP36.02■■■■□ 3.36
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NDUFS3-211ENST00000533507 MON2Q7Z3U7 1717 aa36■■■■□ 3.35
NDUFS3-211ENST00000533507 FYB1O15117 783 aa35.98■■■■□ 3.35
NDUFS3-211ENST00000533507 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP35.98■■■■□ 3.35
NDUFS3-211ENST00000533507 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa35.98■■■■□ 3.35
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NDUFS3-211ENST00000533507 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa35.97■■■■□ 3.35
NDUFS3-211ENST00000533507 NME9Q86XW9 330 aa35.96■■■■□ 3.35
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