RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527952.1

PTPRJ-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRJ, Length 626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-205ENST00000527952 WAPLQ7Z5K2 1190 aa35.86■■■■□ 3.33
PTPRJ-205ENST00000527952 TMEM132EQ6IEE7 984 aa35.85■■■■□ 3.33
PTPRJ-205ENST00000527952 NGLY1Q96IV0 654 aa35.85■■■■□ 3.33
PTPRJ-205ENST00000527952 IFT172Q9UG01 1749 aa35.84■■■■□ 3.33
PTPRJ-205ENST00000527952 NUTM2FA1L443 756 aa35.84■■■■□ 3.33
PTPRJ-205ENST00000527952 ESCO1Q5FWF5 840 aa35.84■■■■□ 3.33
PTPRJ-205ENST00000527952 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP35.8■■■■□ 3.32
PTPRJ-205ENST00000527952 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP35.8■■■■□ 3.32
PTPRJ-205ENST00000527952 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa35.79■■■■□ 3.32
PTPRJ-205ENST00000527952 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa35.78■■■■□ 3.32
PTPRJ-205ENST00000527952 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa35.78■■■■□ 3.32
PTPRJ-205ENST00000527952 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP35.77■■■■□ 3.32
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PTPRJ-205ENST00000527952 RGS12O14924 1447 aa35.76■■■■□ 3.32
PTPRJ-205ENST00000527952 FOXO3O43524 673 aa35.74■■■■□ 3.31
PTPRJ-205ENST00000527952 USP21Q9UK80 565 aa35.72■■■■□ 3.31
PTPRJ-205ENST00000527952 NPHP3Q7Z494 1330 aa35.72■■■■□ 3.31
PTPRJ-205ENST00000527952 TECPR2O15040 1411 aa35.72■■■■□ 3.31
PTPRJ-205ENST00000527952 PIK3C2GO75747 1445 aa35.72■■■■□ 3.31
PTPRJ-205ENST00000527952 ABCC11Q96J66 1382 aa35.7■■■■□ 3.31
PTPRJ-205ENST00000527952 KNDC1Q76NI1 1749 aa35.69■■■■□ 3.3
PTPRJ-205ENST00000527952 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP35.69■■■■□ 3.3
PTPRJ-205ENST00000527952 PXDNQ92626 1479 aa35.69■■■■□ 3.3
PTPRJ-205ENST00000527952 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP35.67■■■■□ 3.3
PTPRJ-205ENST00000527952 MYOM2P54296 1465 aa35.63■■■■□ 3.29
PTPRJ-205ENST00000527952 CFAP70Q5T0N1 1121 aa35.63■■■■□ 3.29
PTPRJ-205ENST00000527952 FMN2Q9NZ56 1722 aa35.63■■■■□ 3.29
PTPRJ-205ENST00000527952 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP35.62■■■■□ 3.29
PTPRJ-205ENST00000527952 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP35.62■■■■□ 3.29
PTPRJ-205ENST00000527952 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP35.61■■■■□ 3.29
PTPRJ-205ENST00000527952 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP35.59■■■■□ 3.29
PTPRJ-205ENST00000527952 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP35.58■■■■□ 3.29
PTPRJ-205ENST00000527952 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP35.57■■■■□ 3.28
PTPRJ-205ENST00000527952 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa35.56■■■■□ 3.28
PTPRJ-205ENST00000527952 ATRNO75882 1429 aa35.56■■■■□ 3.28
PTPRJ-205ENST00000527952 NRXN1Q9ULB1 1477 aa35.54■■■■□ 3.28
PTPRJ-205ENST00000527952 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP35.53■■■■□ 3.28
PTPRJ-205ENST00000527952 PLEKHG5O94827 1062 aa35.52■■■■□ 3.28
PTPRJ-205ENST00000527952 KRT28Q7Z3Y7 464 aa35.52■■■■□ 3.28
PTPRJ-205ENST00000527952 SIRT1Q96EB6 747 aa35.51■■■■□ 3.28
PTPRJ-205ENST00000527952 BCL9LQ86UU0 1499 aa35.51■■■■□ 3.28
PTPRJ-205ENST00000527952 KIF1AQ12756 1690 aa35.5■■■■□ 3.27
PTPRJ-205ENST00000527952 PRAM1Q96QH2 718 aa35.5■■■■□ 3.27
PTPRJ-205ENST00000527952 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa35.5■■■■□ 3.27
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PTPRJ-205ENST00000527952 ATAD2Q6PL18 1390 aa35.46■■■■□ 3.27
PTPRJ-205ENST00000527952 POGKQ9P215 609 aa35.43■■■■□ 3.26
PTPRJ-205ENST00000527952 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa35.43■■■■□ 3.26
PTPRJ-205ENST00000527952 CABLES1Q8TDN4 633 aa35.42■■■■□ 3.26
PTPRJ-205ENST00000527952 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP35.41■■■■□ 3.26
PTPRJ-205ENST00000527952 TRAK1Q9UPV9 953 aa35.4■■■■□ 3.26
PTPRJ-205ENST00000527952 LMOD2Q6P5Q4 547 aa35.39■■■■□ 3.26
PTPRJ-205ENST00000527952 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa35.39■■■■□ 3.26
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PTPRJ-205ENST00000527952 PSME1Q06323 249 aa35.37■■■■□ 3.25
PTPRJ-205ENST00000527952 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP35.37■■■■□ 3.25
PTPRJ-205ENST00000527952 TNS3Q68CZ2 1445 aa35.37■■■■□ 3.25
PTPRJ-205ENST00000527952 UNC5CLQ8IV45 518 aa35.36■■■■□ 3.25
PTPRJ-205ENST00000527952 USP32Q8NFA0 1604 aa35.35■■■■□ 3.25
PTPRJ-205ENST00000527952 DCAF11Q8TEB1 546 aa35.35■■■■□ 3.25
PTPRJ-205ENST00000527952 SLIT2O94813 1529 aa35.35■■■■□ 3.25
PTPRJ-205ENST00000527952 DLC1Q96QB1 1528 aa35.35■■■■□ 3.25
PTPRJ-205ENST00000527952 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP35.35■■■■□ 3.25
PTPRJ-205ENST00000527952 ADGRB1O14514 1584 aa35.34■■■■□ 3.25
PTPRJ-205ENST00000527952 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP35.32■■■■□ 3.25
PTPRJ-205ENST00000527952 GLI3P10071 1580 aa35.32■■■■□ 3.24
PTPRJ-205ENST00000527952 RALGAPBQ86X10 1494 aa35.31■■■■□ 3.24
PTPRJ-205ENST00000527952 SBNO1A3KN83 1393 aa35.28■■■■□ 3.24
PTPRJ-205ENST00000527952 ABCA3Q99758 1704 aa35.26■■■■□ 3.24
PTPRJ-205ENST00000527952 ADGRB2O60241 1585 aa35.25■■■■□ 3.23
PTPRJ-205ENST00000527952 ANKARQ7Z5J8 1434 aa35.24■■■■□ 3.23
PTPRJ-205ENST00000527952 PLCH1Q4KWH8 1693 aa35.24■■■■□ 3.23
PTPRJ-205ENST00000527952 PRR36Q9H6K5 1346 aa35.24■■■■□ 3.23
PTPRJ-205ENST00000527952 EP400Q96L91 3159 aa35.23■■■■□ 3.23
PTPRJ-205ENST00000527952 BRWD3Q6RI45 1802 aa35.23■■■■□ 3.23
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PTPRJ-205ENST00000527952 VPS72Q15906 364 aa35.17■■■■□ 3.22
PTPRJ-205ENST00000527952 SEPT12Q8IYM1 358 aa35.17■■■■□ 3.22
PTPRJ-205ENST00000527952 NWD2Q9ULI1 1742 aa35.15■■■■□ 3.22
PTPRJ-205ENST00000527952 TULP4Q9NRJ4 1543 aa35.15■■■■□ 3.22
PTPRJ-205ENST00000527952 CCDC125Q86Z20 511 aa35.14■■■■□ 3.22
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PTPRJ-205ENST00000527952 ZRANB1Q9UGI0 708 aa35.12■■■■□ 3.21
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PTPRJ-205ENST00000527952 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP35.1■■■■□ 3.21
PTPRJ-205ENST00000527952 HRCP23327 699 aa35.1■■■■□ 3.21
PTPRJ-205ENST00000527952 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP35.1■■■■□ 3.21
PTPRJ-205ENST00000527952 BTG4Q9NY30 223 aa35.08■■■■□ 3.21
PTPRJ-205ENST00000527952 STAC3Q96MF2 364 aa35.07■■■■□ 3.2
PTPRJ-205ENST00000527952 A0A0G2JS52 829 aa35.06■■■■□ 3.2
PTPRJ-205ENST00000527952 MYT1Q01538 1121 aa35.06■■■■□ 3.2
PTPRJ-205ENST00000527952 DEFB132Q7Z7B7 95 aa35.06■■■■□ 3.2
PTPRJ-205ENST00000527952 NRAPQ86VF7 1730 aa35.05■■■■□ 3.2
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