RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490322.1

SMYD3-215, Transcript of SET and MYND domain containing 3, human

TSL 3

Gene SMYD3, Length 368 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMYD3-215	ENST00000490322	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SMYD3-215	ENST00000490322	HIC1	Q14526	733 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SMYD3-215	ENST00000490322	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SMYD3-215	ENST00000490322	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SMYD3-215	ENST00000490322	PNMA3	Q9UL41	463 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SMYD3-215	ENST00000490322	ABCC8	Q09428	1581 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SMYD3-215	ENST00000490322	APBB1	O00213	710 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SMYD3-215	ENST00000490322	IRF6	O14896	467 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SMYD3-215	ENST00000490322	TLL1	O43897	1013 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SMYD3-215	ENST00000490322	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SMYD3-215	ENST00000490322	NCAPD3	P42695	1498 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SMYD3-215	ENST00000490322	PRSS12	P56730	875 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SMYD3-215	ENST00000490322	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SMYD3-215	ENST00000490322	PARP9	Q8IXQ6	854 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SMYD3-215	ENST00000490322	ANKLE1	Q8NAG6	615 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SMYD3-215	ENST00000490322	TATDN2	Q93075	761 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SMYD3-215	ENST00000490322	PCMTD1	Q96MG8	357 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SMYD3-215	ENST00000490322	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SMYD3-215	ENST00000490322	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SMYD3-215	ENST00000490322		A6NJR5	290 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SMYD3-215	ENST00000490322	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SMYD3-215	ENST00000490322	SUZ12	Q15022	739 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SMYD3-215	ENST00000490322	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SMYD3-215	ENST00000490322	GRXCR2	A6NFK2	248 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SMYD3-215	ENST00000490322	S1PR4	O95977	384 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SMYD3-215	ENST00000490322	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SMYD3-215	ENST00000490322	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SMYD3-215	ENST00000490322	NECTIN2	Q92692	538 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SMYD3-215	ENST00000490322	BLOC1S3	Q6QNY0	202 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SMYD3-215	ENST00000490322	NUDT18	Q6ZVK8	323 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SMYD3-215	ENST00000490322	SLF2	Q8IX21	1173 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SMYD3-215	ENST00000490322	PCDHB3	Q9Y5E6	796 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SMYD3-215	ENST00000490322	SYNJ1	O43426	1573 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SMYD3-215	ENST00000490322	TOP2B	Q02880	1626 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SMYD3-215	ENST00000490322	AXIN1	O15169	862 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SMYD3-215	ENST00000490322	FOXC1	Q12948	553 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SMYD3-215	ENST00000490322	SWT1	Q5T5J6	900 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SMYD3-215	ENST00000490322	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SMYD3-215	ENST00000490322	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SMYD3-215	ENST00000490322	FAM181B	A6NEQ2	426 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SMYD3-215	ENST00000490322	ARID3C	A6NKF2	412 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SMYD3-215	ENST00000490322	TERT	O14746	1132 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SMYD3-215	ENST00000490322	RAD21	O60216	631 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SMYD3-215	ENST00000490322	TRAK2	O60296	914 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SMYD3-215	ENST00000490322	AVP	P01185	164 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SMYD3-215	ENST00000490322	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SMYD3-215	ENST00000490322	PLA2G2C	Q5R387	149 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SMYD3-215	ENST00000490322	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SMYD3-215	ENST00000490322	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SMYD3-215	ENST00000490322	SNRPB	P14678	240 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SMYD3-215	ENST00000490322	CLCN1	P35523	988 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SMYD3-215	ENST00000490322	MCM6	Q14566	821 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SMYD3-215	ENST00000490322	CERK	Q8TCT0	537 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SMYD3-215	ENST00000490322	CCDC97	Q96F63	343 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SMYD3-215	ENST00000490322	PRR14	Q9BWN1	585 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SMYD3-215	ENST00000490322	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	4.53	□□□□□ -1.68
SMYD3-215	ENST00000490322	OSBP	P22059	807 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SMYD3-215	ENST00000490322	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SMYD3-215	ENST00000490322	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SMYD3-215	ENST00000490322	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SMYD3-215	ENST00000490322	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SMYD3-215	ENST00000490322	HRC	P23327	699 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SMYD3-215	ENST00000490322	SMCP	P49901	116 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SMYD3-215	ENST00000490322	KCTD17	Q8N5Z5	321 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SMYD3-215	ENST00000490322	TOR4A	Q9NXH8	423 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SMYD3-215	ENST00000490322	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SMYD3-215	ENST00000490322	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SMYD3-215	ENST00000490322	CFTR	P13569	1480 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SMYD3-215	ENST00000490322	EEA1	Q15075	1411 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SMYD3-215	ENST00000490322	ADH1B	P00325	375 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SMYD3-215	ENST00000490322	LOR	P23490	312 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
SMYD3-215	ENST00000490322	SLC4A3	P48751	1232 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SMYD3-215	ENST00000490322	PTGDR	Q13258	359 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SMYD3-215	ENST00000490322	WWC1	Q8IX03	1113 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SMYD3-215	ENST00000490322	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SMYD3-215	ENST00000490322	CDHR5	Q9HBB8	845 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SMYD3-215	ENST00000490322	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SMYD3-215	ENST00000490322	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
SMYD3-215	ENST00000490322	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
SMYD3-215	ENST00000490322	KIF21B	O75037	1637 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SMYD3-215	ENST00000490322	MS4A1	P11836	297 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SMYD3-215	ENST00000490322	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
SMYD3-215	ENST00000490322	CYP4X1	Q8N118	509 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SMYD3-215	ENST00000490322	ZSCAN1	Q8NBB4	408 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SMYD3-215	ENST00000490322	TRIM47	Q96LD4	638 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SMYD3-215	ENST00000490322	ATP13A2	Q9NQ11	1180 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SMYD3-215	ENST00000490322	CUX1	P39880	1505 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SMYD3-215	ENST00000490322	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SMYD3-215	ENST00000490322	GMPR	P36959	345 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SMYD3-215	ENST00000490322	PDE4C	Q08493	712 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SMYD3-215	ENST00000490322	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SMYD3-215	ENST00000490322	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
SMYD3-215	ENST00000490322	TRAIP	Q9BWF2	469 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SMYD3-215	ENST00000490322	WDR97	A6NE52	1622 aa		4.47	□□□□□ -1.69
SMYD3-215	ENST00000490322	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		4.47	□□□□□ -1.69
SMYD3-215	ENST00000490322	FECH	P22830	423 aa		4.47	□□□□□ -1.69
SMYD3-215	ENST00000490322	TTC13	Q8NBP0	860 aa		4.47	□□□□□ -1.69
SMYD3-215	ENST00000490322	SLC6A16	Q9GZN6	736 aa		4.47	□□□□□ -1.69
SMYD3-215	ENST00000490322	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		4.47	□□□□□ -1.69
SMYD3-215	ENST00000490322	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		4.46	□□□□□ -1.7

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