RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490316.6

MTMR1-211, Transcript of myotubularin related protein 1, human

TSL 3

Gene MTMR1, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MTMR1-211	ENST00000490316	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	42.87	■■■■■ 4.45
MTMR1-211	ENST00000490316	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		42.87	■■■■■ 4.45
MTMR1-211	ENST00000490316	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	42.86	■■■■■ 4.45
MTMR1-211	ENST00000490316	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		42.86	■■■■■ 4.45
MTMR1-211	ENST00000490316	LAMC1	P11047	1609 aa		42.84	■■■■■ 4.45
MTMR1-211	ENST00000490316	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		42.82	■■■■■ 4.45
MTMR1-211	ENST00000490316	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	42.8	■■■■■ 4.44
MTMR1-211	ENST00000490316	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	42.8	■■■■■ 4.44
MTMR1-211	ENST00000490316	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	42.8	■■■■■ 4.44
MTMR1-211	ENST00000490316	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		42.78	■■■■■ 4.44
MTMR1-211	ENST00000490316	SIRT1	Q96EB6	747 aa		42.77	■■■■■ 4.44
MTMR1-211	ENST00000490316	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	42.77	■■■■■ 4.44
MTMR1-211	ENST00000490316	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		42.76	■■■■■ 4.44
MTMR1-211	ENST00000490316	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	42.75	■■■■■ 4.43
MTMR1-211	ENST00000490316	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		42.73	■■■■■ 4.43
MTMR1-211	ENST00000490316	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	42.72	■■■■■ 4.43
MTMR1-211	ENST00000490316	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		42.67	■■■■■ 4.42
MTMR1-211	ENST00000490316	NUTM2F	A1L443	756 aa		42.66	■■■■■ 4.42
MTMR1-211	ENST00000490316	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		42.66	■■■■■ 4.42
MTMR1-211	ENST00000490316	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		42.65	■■■■■ 4.42
MTMR1-211	ENST00000490316	STAC3	Q96MF2	364 aa		42.64	■■■■■ 4.42
MTMR1-211	ENST00000490316	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		42.63	■■■■■ 4.42
MTMR1-211	ENST00000490316	FOXO3	O43524	673 aa		42.59	■■■■■ 4.41
MTMR1-211	ENST00000490316	PRAM1	Q96QH2	718 aa		42.59	■■■■■ 4.41
MTMR1-211	ENST00000490316	ADGRB1	O14514	1584 aa		42.59	■■■■■ 4.41
MTMR1-211	ENST00000490316	DLC1	Q96QB1	1528 aa		42.58	■■■■■ 4.41
MTMR1-211	ENST00000490316	AFF2	P51816	1311 aa		42.57	■■■■■ 4.41
MTMR1-211	ENST00000490316	PXDN	Q92626	1479 aa		42.55	■■■■■ 4.4
MTMR1-211	ENST00000490316	C8orf37	Q96NL8	207 aa		42.55	■■■■■ 4.4
MTMR1-211	ENST00000490316	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	42.54	■■■■■ 4.4	1e-7	■□□□□ 9.6
MTMR1-211	ENST00000490316	POGK	Q9P215	609 aa		42.53	■■■■■ 4.4
MTMR1-211	ENST00000490316	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	42.51	■■■■■ 4.4
MTMR1-211	ENST00000490316	ADAMTS2	O95450	1211 aa		42.5	■■■■■ 4.39
MTMR1-211	ENST00000490316	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	42.5	■■■■■ 4.39
MTMR1-211	ENST00000490316	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		42.49	■■■■■ 4.39
MTMR1-211	ENST00000490316	KIF1A	Q12756	1690 aa		42.49	■■■■■ 4.39
MTMR1-211	ENST00000490316	RXRB	P28702	533 aa		42.47	■■■■■ 4.39
MTMR1-211	ENST00000490316	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	42.45	■■■■■ 4.39
MTMR1-211	ENST00000490316	NGLY1	Q96IV0	654 aa		42.44	■■■■■ 4.38
MTMR1-211	ENST00000490316	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		42.41	■■■■■ 4.38
MTMR1-211	ENST00000490316	ADGRB2	O60241	1585 aa		42.4	■■■■■ 4.38
MTMR1-211	ENST00000490316	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	42.38	■■■■■ 4.37
MTMR1-211	ENST00000490316	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		42.37	■■■■■ 4.37
MTMR1-211	ENST00000490316	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		42.35	■■■■■ 4.37
MTMR1-211	ENST00000490316	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		42.35	■■■■■ 4.37
MTMR1-211	ENST00000490316	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	42.35	■■■■■ 4.37
MTMR1-211	ENST00000490316	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	42.34	■■■■■ 4.37
MTMR1-211	ENST00000490316	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	42.33	■■■■■ 4.37
MTMR1-211	ENST00000490316	USP32	Q8NFA0	1604 aa		42.32	■■■■■ 4.37
MTMR1-211	ENST00000490316	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	42.3	■■■■■ 4.36
MTMR1-211	ENST00000490316	PSME1	Q06323	249 aa		42.3	■■■■■ 4.36
MTMR1-211	ENST00000490316	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	42.29	■■■■■ 4.36
MTMR1-211	ENST00000490316	USP21	Q9UK80	565 aa		42.29	■■■■■ 4.36
MTMR1-211	ENST00000490316	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	42.27	■■■■■ 4.36
MTMR1-211	ENST00000490316	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	42.27	■■■■■ 4.36
MTMR1-211	ENST00000490316	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		42.26	■■■■■ 4.36
MTMR1-211	ENST00000490316	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	42.26	■■■■■ 4.35
MTMR1-211	ENST00000490316	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	42.25	■■■■■ 4.35
MTMR1-211	ENST00000490316	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		42.25	■■■■■ 4.35
MTMR1-211	ENST00000490316	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		42.23	■■■■■ 4.35
MTMR1-211	ENST00000490316	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		42.22	■■■■■ 4.35
MTMR1-211	ENST00000490316	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	42.21	■■■■■ 4.35
MTMR1-211	ENST00000490316	SBNO1	A3KN83	1393 aa		42.21	■■■■■ 4.35
MTMR1-211	ENST00000490316	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		42.2	■■■■■ 4.35
MTMR1-211	ENST00000490316	RGS12	O14924	1447 aa		42.17	■■■■■ 4.34
MTMR1-211	ENST00000490316	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		42.14	■■■■■ 4.34
MTMR1-211	ENST00000490316	ATRN	O75882	1429 aa		42.13	■■■■■ 4.34
MTMR1-211	ENST00000490316	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		42.13	■■■■■ 4.34
MTMR1-211	ENST00000490316	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	42.13	■■■■■ 4.33
MTMR1-211	ENST00000490316	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		42.12	■■■■■ 4.33
MTMR1-211	ENST00000490316	ARHGEF10	O15013	1369 aa		42.12	■■■■■ 4.33
MTMR1-211	ENST00000490316	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	42.09	■■■■■ 4.33
MTMR1-211	ENST00000490316	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		42.09	■■■■■ 4.33
MTMR1-211	ENST00000490316	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		42.08	■■■■■ 4.33
MTMR1-211	ENST00000490316	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		42.08	■■■■■ 4.33
MTMR1-211	ENST00000490316	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		42.08	■■■■■ 4.33
MTMR1-211	ENST00000490316	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	42.06	■■■■■ 4.32
MTMR1-211	ENST00000490316	ITSN1	Q15811	1721 aa		42.04	■■■■■ 4.32
MTMR1-211	ENST00000490316	PLEKHG5	O94827	1062 aa		42.04	■■■■■ 4.32
MTMR1-211	ENST00000490316	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	42.04	■■■■■ 4.32
MTMR1-211	ENST00000490316	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	42.04	■■■■■ 4.32
MTMR1-211	ENST00000490316	SLIT2	O94813	1529 aa		42.04	■■■■■ 4.32
MTMR1-211	ENST00000490316	ATP7B	P35670	1465 aa		42.04	■■■■■ 4.32
MTMR1-211	ENST00000490316	CDK19	Q9BWU1	502 aa		42.03	■■■■■ 4.32
MTMR1-211	ENST00000490316	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	42.02	■■■■■ 4.32
MTMR1-211	ENST00000490316	ABCA3	Q99758	1704 aa		42.01	■■■■■ 4.32
MTMR1-211	ENST00000490316	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		42	■■■■■ 4.31
MTMR1-211	ENST00000490316	NEUROD1	Q13562	356 aa		41.99	■■■■■ 4.31
MTMR1-211	ENST00000490316	ALS2	Q96Q42	1657 aa		41.99	■■■■■ 4.31
MTMR1-211	ENST00000490316	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	41.98	■■■■■ 4.31
MTMR1-211	ENST00000490316	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	41.93	■■■■■ 4.3
MTMR1-211	ENST00000490316	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	41.91	■■■■■ 4.3
MTMR1-211	ENST00000490316	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		41.91	■■■■■ 4.3
MTMR1-211	ENST00000490316	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		41.9	■■■■■ 4.3
MTMR1-211	ENST00000490316	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		41.9	■■■■■ 4.3
MTMR1-211	ENST00000490316	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		41.88	■■■■■ 4.3
MTMR1-211	ENST00000490316	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		41.88	■■■■■ 4.29
MTMR1-211	ENST00000490316	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		41.87	■■■■■ 4.29
MTMR1-211	ENST00000490316	FAM83G	A6ND36	823 aa		41.86	■■■■■ 4.29
MTMR1-211	ENST00000490316	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		41.85	■■■■■ 4.29

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