RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 KNDC1Q76NI1 1749 aa29.71■■■□□ 2.35
ACTB-212ENST00000484841 LAMC1P11047 1609 aa29.71■■■□□ 2.35
ACTB-212ENST00000484841 ESCO1Q5FWF5 840 aa29.7■■■□□ 2.35
ACTB-212ENST00000484841 WAPLQ7Z5K2 1190 aa29.69■■■□□ 2.34
ACTB-212ENST00000484841 C8orf37Q96NL8 207 aa29.69■■■□□ 2.34
ACTB-212ENST00000484841 TECPR2O15040 1411 aa29.69■■■□□ 2.34
ACTB-212ENST00000484841 AFF2P51816 1311 aa29.69■■■□□ 2.34
ACTB-212ENST00000484841 ABCC11Q96J66 1382 aa29.68■■■□□ 2.34
ACTB-212ENST00000484841 RXRBP28702 533 aa29.68■■■□□ 2.34
ACTB-212ENST00000484841 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP29.68■■■□□ 2.34
ACTB-212ENST00000484841 NPHP3Q7Z494 1330 aa29.66■■■□□ 2.34
ACTB-212ENST00000484841 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
ACTB-212ENST00000484841 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP29.64■■■□□ 2.33
ACTB-212ENST00000484841 ADAMTS2O95450 1211 aa29.63■■■□□ 2.33
ACTB-212ENST00000484841 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP29.63■■■□□ 2.33
ACTB-212ENST00000484841 MYOM2P54296 1465 aa29.62■■■□□ 2.33
ACTB-212ENST00000484841 NUTM2FA1L443 756 aa29.62■■■□□ 2.33
ACTB-212ENST00000484841 NGLY1Q96IV0 654 aa29.62■■■□□ 2.33
ACTB-212ENST00000484841 CFAP70Q5T0N1 1121 aa29.59■■■□□ 2.33
ACTB-212ENST00000484841 SIRT1Q96EB6 747 aa29.59■■■□□ 2.33
ACTB-212ENST00000484841 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa29.59■■■□□ 2.33
ACTB-212ENST00000484841 FOXO3O43524 673 aa29.58■■■□□ 2.33
ACTB-212ENST00000484841 FMN2Q9NZ56 1722 aa29.57■■■□□ 2.32
ACTB-212ENST00000484841 NRXN1Q9ULB1 1477 aa29.56■■■□□ 2.32
ACTB-212ENST00000484841 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
ACTB-212ENST00000484841 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
ACTB-212ENST00000484841 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
ACTB-212ENST00000484841 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
ACTB-212ENST00000484841 KIF1AQ12756 1690 aa29.53■■■□□ 2.32
ACTB-212ENST00000484841 HRCP23327 699 aa29.52■■■□□ 2.32
ACTB-212ENST00000484841 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
ACTB-212ENST00000484841 POGKQ9P215 609 aa29.52■■■□□ 2.32
ACTB-212ENST00000484841 USP21Q9UK80 565 aa29.51■■■□□ 2.31
ACTB-212ENST00000484841 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa29.51■■■□□ 2.31
ACTB-212ENST00000484841 PXDNQ92626 1479 aa29.5■■■□□ 2.31
ACTB-212ENST00000484841 PRAM1Q96QH2 718 aa29.5■■■□□ 2.31
ACTB-212ENST00000484841 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP29.49■■■□□ 2.31
ACTB-212ENST00000484841 DCAF11Q8TEB1 546 aa29.48■■■□□ 2.31
ACTB-212ENST00000484841 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP29.47■■■□□ 2.31
ACTB-212ENST00000484841 STAC3Q96MF2 364 aa29.46■■■□□ 2.31
ACTB-212ENST00000484841 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP29.45■■■□□ 2.31
ACTB-212ENST00000484841 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.31
ACTB-212ENST00000484841 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.3
ACTB-212ENST00000484841 DLC1Q96QB1 1528 aa29.45■■■□□ 2.3
ACTB-212ENST00000484841 PHF8Q9UPP1 1060 aa29.44■■■□□ 2.3
ACTB-212ENST00000484841 PSME1Q06323 249 aa29.43■■■□□ 2.3
ACTB-212ENST00000484841 KRT28Q7Z3Y7 464 aa29.43■■■□□ 2.3
ACTB-212ENST00000484841 TRAK1Q9UPV9 953 aa29.42■■■□□ 2.3
ACTB-212ENST00000484841 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
ACTB-212ENST00000484841 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP29.4■■■□□ 2.3
ACTB-212ENST00000484841 RGS12O14924 1447 aa29.39■■■□□ 2.3
ACTB-212ENST00000484841 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa29.39■■■□□ 2.3
ACTB-212ENST00000484841 ADGRB1O14514 1584 aa29.37■■■□□ 2.29
ACTB-212ENST00000484841 LMOD2Q6P5Q4 547 aa29.34■■■□□ 2.29
ACTB-212ENST00000484841 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
ACTB-212ENST00000484841 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP29.33■■■□□ 2.29
ACTB-212ENST00000484841 ANKARQ7Z5J8 1434 aa29.33■■■□□ 2.29
ACTB-212ENST00000484841 ADGRB2O60241 1585 aa29.33■■■□□ 2.29
ACTB-212ENST00000484841 TNS3Q68CZ2 1445 aa29.32■■■□□ 2.28
ACTB-212ENST00000484841 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP29.32■■■□□ 2.28
ACTB-212ENST00000484841 ATRNO75882 1429 aa29.31■■■□□ 2.28
ACTB-212ENST00000484841 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa29.31■■■□□ 2.28
ACTB-212ENST00000484841 PLEKHG5O94827 1062 aa29.3■■■□□ 2.28
ACTB-212ENST00000484841 SBNO1A3KN83 1393 aa29.29■■■□□ 2.28
ACTB-212ENST00000484841 ARHGEF10O15013 1369 aa29.27■■■□□ 2.28
ACTB-212ENST00000484841 ATAD2Q6PL18 1390 aa29.27■■■□□ 2.28
ACTB-212ENST00000484841 USP32Q8NFA0 1604 aa29.27■■■□□ 2.28
ACTB-212ENST00000484841 BCL9LQ86UU0 1499 aa29.27■■■□□ 2.28
ACTB-212ENST00000484841 GPRASP1Q5JY77 1395 aa29.26■■■□□ 2.27
ACTB-212ENST00000484841 WASLO00401 505 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
ACTB-212ENST00000484841 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
ACTB-212ENST00000484841 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
ACTB-212ENST00000484841 UNC5CLQ8IV45 518 aa29.24■■■□□ 2.27
ACTB-212ENST00000484841 TULP4Q9NRJ4 1543 aa29.23■■■□□ 2.27
ACTB-212ENST00000484841 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
ACTB-212ENST00000484841 CABLES1Q8TDN4 633 aa29.22■■■□□ 2.27
ACTB-212ENST00000484841 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.26
ACTB-212ENST00000484841 ITSN1Q15811 1721 aa29.19■■■□□ 2.26
ACTB-212ENST00000484841 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa29.19■■■□□ 2.26
ACTB-212ENST00000484841 SLIT2O94813 1529 aa29.19■■■□□ 2.26
ACTB-212ENST00000484841 PRR36Q9H6K5 1346 aa29.17■■■□□ 2.26
ACTB-212ENST00000484841 ABCA3Q99758 1704 aa29.17■■■□□ 2.26
ACTB-212ENST00000484841 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
ACTB-212ENST00000484841 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
ACTB-212ENST00000484841 PLCH1Q4KWH8 1693 aa29.15■■■□□ 2.26
ACTB-212ENST00000484841 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP29.14■■■□□ 2.26
ACTB-212ENST00000484841 NWD2Q9ULI1 1742 aa29.14■■■□□ 2.25
ACTB-212ENST00000484841 RALGAPBQ86X10 1494 aa29.12■■■□□ 2.25
ACTB-212ENST00000484841 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
ACTB-212ENST00000484841 ALS2Q96Q42 1657 aa29.1■■■□□ 2.25
ACTB-212ENST00000484841 GLI3P10071 1580 aa29.09■■■□□ 2.25
ACTB-212ENST00000484841 VPS72Q15906 364 aa29.09■■■□□ 2.25
ACTB-212ENST00000484841 CDK19Q9BWU1 502 aa29.09■■■□□ 2.25
ACTB-212ENST00000484841 CCDC125Q86Z20 511 aa29.08■■■□□ 2.25
ACTB-212ENST00000484841 ATP7BP35670 1465 aa29.06■■■□□ 2.24
ACTB-212ENST00000484841 FAM83GA6ND36 823 aa29.06■■■□□ 2.24
ACTB-212ENST00000484841 NBPF1Q3BBV0 1214 aa29.05■■■□□ 2.24
ACTB-212ENST00000484841 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
ACTB-212ENST00000484841 A0A0G2JS52 829 aa29.03■■■□□ 2.24
ACTB-212ENST00000484841 MYT1Q01538 1121 aa29.03■■■□□ 2.24
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