RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480739.2

RPL13AP23-201, Transcript of ribosomal protein L13a pseudogene 23, humanhuman

BASIC

Gene RPL13AP23, Length 586 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL13AP23-201ENST00000480739 ESCO1Q5FWF5 840 aa25.54■■□□□ 1.68
RPL13AP23-201ENST00000480739 IFT172Q9UG01 1749 aa25.53■■□□□ 1.68
RPL13AP23-201ENST00000480739 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
RPL13AP23-201ENST00000480739 ADAMTS2O95450 1211 aa25.51■■□□□ 1.67
RPL13AP23-201ENST00000480739 ABCC11Q96J66 1382 aa25.51■■□□□ 1.67
RPL13AP23-201ENST00000480739 NUTM2FA1L443 756 aa25.5■■□□□ 1.67
RPL13AP23-201ENST00000480739 LAMC1P11047 1609 aa25.5■■□□□ 1.67
RPL13AP23-201ENST00000480739 PIK3C2GO75747 1445 aa25.49■■□□□ 1.67
RPL13AP23-201ENST00000480739 NGLY1Q96IV0 654 aa25.49■■□□□ 1.67
RPL13AP23-201ENST00000480739 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
RPL13AP23-201ENST00000480739 TECPR2O15040 1411 aa25.48■■□□□ 1.67
RPL13AP23-201ENST00000480739 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.48■■□□□ 1.67
RPL13AP23-201ENST00000480739 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
RPL13AP23-201ENST00000480739 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa25.47■■□□□ 1.67
RPL13AP23-201ENST00000480739 FOXO3O43524 673 aa25.47■■□□□ 1.67
RPL13AP23-201ENST00000480739 NPHP3Q7Z494 1330 aa25.46■■□□□ 1.67
RPL13AP23-201ENST00000480739 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa25.45■■□□□ 1.66
RPL13AP23-201ENST00000480739 CFAP70Q5T0N1 1121 aa25.45■■□□□ 1.66
RPL13AP23-201ENST00000480739 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
RPL13AP23-201ENST00000480739 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
RPL13AP23-201ENST00000480739 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP25.43■■□□□ 1.66
RPL13AP23-201ENST00000480739 SIRT1Q96EB6 747 aa25.43■■□□□ 1.66
RPL13AP23-201ENST00000480739 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
RPL13AP23-201ENST00000480739 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
RPL13AP23-201ENST00000480739 KNDC1Q76NI1 1749 aa25.4■■□□□ 1.66
RPL13AP23-201ENST00000480739 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.65
RPL13AP23-201ENST00000480739 USP21Q9UK80 565 aa25.38■■□□□ 1.65
RPL13AP23-201ENST00000480739 NRXN1Q9ULB1 1477 aa25.38■■□□□ 1.65
RPL13AP23-201ENST00000480739 PXDNQ92626 1479 aa25.37■■□□□ 1.65
RPL13AP23-201ENST00000480739 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP25.36■■□□□ 1.65
RPL13AP23-201ENST00000480739 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
RPL13AP23-201ENST00000480739 MYOM2P54296 1465 aa25.35■■□□□ 1.65
RPL13AP23-201ENST00000480739 PRAM1Q96QH2 718 aa25.35■■□□□ 1.65
RPL13AP23-201ENST00000480739 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa25.35■■□□□ 1.65
RPL13AP23-201ENST00000480739 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
RPL13AP23-201ENST00000480739 FMN2Q9NZ56 1722 aa25.32■■□□□ 1.64
RPL13AP23-201ENST00000480739 KRT28Q7Z3Y7 464 aa25.32■■□□□ 1.64
RPL13AP23-201ENST00000480739 POGKQ9P215 609 aa25.32■■□□□ 1.64
RPL13AP23-201ENST00000480739 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
RPL13AP23-201ENST00000480739 HRCP23327 699 aa25.31■■□□□ 1.64
RPL13AP23-201ENST00000480739 DCAF11Q8TEB1 546 aa25.31■■□□□ 1.64
RPL13AP23-201ENST00000480739 RGS12O14924 1447 aa25.3■■□□□ 1.64
RPL13AP23-201ENST00000480739 PHF8Q9UPP1 1060 aa25.3■■□□□ 1.64
RPL13AP23-201ENST00000480739 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
RPL13AP23-201ENST00000480739 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa25.29■■□□□ 1.64
RPL13AP23-201ENST00000480739 TRAK1Q9UPV9 953 aa25.28■■□□□ 1.64
RPL13AP23-201ENST00000480739 PSME1Q06323 249 aa25.26■■□□□ 1.63
RPL13AP23-201ENST00000480739 KIF1AQ12756 1690 aa25.25■■□□□ 1.63
RPL13AP23-201ENST00000480739 ATRNO75882 1429 aa25.23■■□□□ 1.63
RPL13AP23-201ENST00000480739 STAC3Q96MF2 364 aa25.23■■□□□ 1.63
RPL13AP23-201ENST00000480739 BCL9LQ86UU0 1499 aa25.22■■□□□ 1.63
RPL13AP23-201ENST00000480739 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
RPL13AP23-201ENST00000480739 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
RPL13AP23-201ENST00000480739 DLC1Q96QB1 1528 aa25.22■■□□□ 1.63
RPL13AP23-201ENST00000480739 PLEKHG5O94827 1062 aa25.21■■□□□ 1.63
RPL13AP23-201ENST00000480739 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa25.21■■□□□ 1.63
RPL13AP23-201ENST00000480739 ADGRB1O14514 1584 aa25.2■■□□□ 1.62
RPL13AP23-201ENST00000480739 LMOD2Q6P5Q4 547 aa25.2■■□□□ 1.62
RPL13AP23-201ENST00000480739 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
RPL13AP23-201ENST00000480739 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
RPL13AP23-201ENST00000480739 CABLES1Q8TDN4 633 aa25.19■■□□□ 1.62
RPL13AP23-201ENST00000480739 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
RPL13AP23-201ENST00000480739 UNC5CLQ8IV45 518 aa25.17■■□□□ 1.62
RPL13AP23-201ENST00000480739 TNS3Q68CZ2 1445 aa25.16■■□□□ 1.62
RPL13AP23-201ENST00000480739 SBNO1A3KN83 1393 aa25.15■■□□□ 1.62
RPL13AP23-201ENST00000480739 ATAD2Q6PL18 1390 aa25.15■■□□□ 1.62
RPL13AP23-201ENST00000480739 ANKARQ7Z5J8 1434 aa25.14■■□□□ 1.62
RPL13AP23-201ENST00000480739 USP32Q8NFA0 1604 aa25.13■■□□□ 1.61
RPL13AP23-201ENST00000480739 WASLO00401 505 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
RPL13AP23-201ENST00000480739 SLIT2O94813 1529 aa25.12■■□□□ 1.61
RPL13AP23-201ENST00000480739 PRR36Q9H6K5 1346 aa25.11■■□□□ 1.61
RPL13AP23-201ENST00000480739 ADGRB2O60241 1585 aa25.1■■□□□ 1.61
RPL13AP23-201ENST00000480739 ARHGEF10O15013 1369 aa25.1■■□□□ 1.61
RPL13AP23-201ENST00000480739 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
RPL13AP23-201ENST00000480739 GPRASP1Q5JY77 1395 aa25.07■■□□□ 1.6
RPL13AP23-201ENST00000480739 FAM83GA6ND36 823 aa25.07■■□□□ 1.6
RPL13AP23-201ENST00000480739 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
RPL13AP23-201ENST00000480739 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
RPL13AP23-201ENST00000480739 RALGAPBQ86X10 1494 aa25.06■■□□□ 1.6
RPL13AP23-201ENST00000480739 EP400Q96L91 3159 aa25.06■■□□□ 1.6
RPL13AP23-201ENST00000480739 TULP4Q9NRJ4 1543 aa25.04■■□□□ 1.6
RPL13AP23-201ENST00000480739 VPS72Q15906 364 aa25.04■■□□□ 1.6
RPL13AP23-201ENST00000480739 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
RPL13AP23-201ENST00000480739 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
RPL13AP23-201ENST00000480739 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
RPL13AP23-201ENST00000480739 GLI3P10071 1580 aa25.01■■□□□ 1.59
RPL13AP23-201ENST00000480739 CCDC125Q86Z20 511 aa25.01■■□□□ 1.59
RPL13AP23-201ENST00000480739 CDK19Q9BWU1 502 aa25.01■■□□□ 1.59
RPL13AP23-201ENST00000480739 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
RPL13AP23-201ENST00000480739 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
RPL13AP23-201ENST00000480739 NBPF1Q3BBV0 1214 aa25■■□□□ 1.59
RPL13AP23-201ENST00000480739 SEPT12Q8IYM1 358 aa25■■□□□ 1.59
RPL13AP23-201ENST00000480739 ABCA3Q99758 1704 aa24.99■■□□□ 1.59
RPL13AP23-201ENST00000480739 NWD2Q9ULI1 1742 aa24.98■■□□□ 1.59
RPL13AP23-201ENST00000480739 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
RPL13AP23-201ENST00000480739 BTG4Q9NY30 223 aa24.97■■□□□ 1.59
RPL13AP23-201ENST00000480739 PLCH1Q4KWH8 1693 aa24.97■■□□□ 1.59
RPL13AP23-201ENST00000480739 ALS2Q96Q42 1657 aa24.97■■□□□ 1.59
RPL13AP23-201ENST00000480739 BRWD3Q6RI45 1802 aa24.95■■□□□ 1.58
RPL13AP23-201ENST00000480739 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.5 ms