RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479976.5

CHTF18-209, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 2

Gene CHTF18, Length 1,110 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-209ENST00000479976 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP41.9■■■■■ 4.3
CHTF18-209ENST00000479976 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP41.9■■■■■ 4.3
CHTF18-209ENST00000479976 NRXN1Q9ULB1 1477 aa41.87■■■■■ 4.29
CHTF18-209ENST00000479976 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP41.86■■■■■ 4.29
CHTF18-209ENST00000479976 MYOM2P54296 1465 aa41.85■■■■■ 4.29
CHTF18-209ENST00000479976 LAMC1P11047 1609 aa41.85■■■■■ 4.29
CHTF18-209ENST00000479976 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa41.84■■■■■ 4.29
CHTF18-209ENST00000479976 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP41.84■■■■■ 4.29
CHTF18-209ENST00000479976 KNDC1Q76NI1 1749 aa41.83■■■■■ 4.29
CHTF18-209ENST00000479976 CFAP70Q5T0N1 1121 aa41.83■■■■■ 4.29
CHTF18-209ENST00000479976 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP41.82■■■■■ 4.29
CHTF18-209ENST00000479976 PNPLA6Q8IY17 1366 aa41.82■■■■■ 4.29
CHTF18-209ENST00000479976 SIRT1Q96EB6 747 aa41.81■■■■■ 4.28
CHTF18-209ENST00000479976 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa41.8■■■■■ 4.28
CHTF18-209ENST00000479976 ESCO1Q5FWF5 840 aa41.8■■■■■ 4.28
CHTF18-209ENST00000479976 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP41.77■■■■■ 4.28
CHTF18-209ENST00000479976 NUTM2FA1L443 756 aa41.72■■■■■ 4.27
CHTF18-209ENST00000479976 NPHP3Q7Z494 1330 aa41.7■■■■■ 4.27
CHTF18-209ENST00000479976 DCAF11Q8TEB1 546 aa41.68■■■■■ 4.26
CHTF18-209ENST00000479976 AFF2P51816 1311 aa41.68■■■■■ 4.26
CHTF18-209ENST00000479976 FOXO3O43524 673 aa41.67■■■■■ 4.26
CHTF18-209ENST00000479976 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa41.67■■■■■ 4.26
CHTF18-209ENST00000479976 STAC3Q96MF2 364 aa41.65■■■■■ 4.26
CHTF18-209ENST00000479976 C8orf37Q96NL8 207 aa41.65■■■■■ 4.26
CHTF18-209ENST00000479976 FMN2Q9NZ56 1722 aa41.62■■■■■ 4.25
CHTF18-209ENST00000479976 PRAM1Q96QH2 718 aa41.62■■■■■ 4.25
CHTF18-209ENST00000479976 RXRBP28702 533 aa41.61■■■■■ 4.25
CHTF18-209ENST00000479976 ADAMTS2O95450 1211 aa41.6■■■■■ 4.25
CHTF18-209ENST00000479976 PXDNQ92626 1479 aa41.6■■■■■ 4.25
CHTF18-209ENST00000479976 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP41.58■■■■■ 4.25
CHTF18-209ENST00000479976 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP41.58■■■■■ 4.25
CHTF18-209ENST00000479976 POGKQ9P215 609 aa41.57■■■■■ 4.25
CHTF18-209ENST00000479976 DLC1Q96QB1 1528 aa41.56■■■■■ 4.24
CHTF18-209ENST00000479976 NGLY1Q96IV0 654 aa41.56■■■■■ 4.24
CHTF18-209ENST00000479976 ADGRB1O14514 1584 aa41.55■■■■■ 4.24
CHTF18-209ENST00000479976 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP41.53■■■■■ 4.24
CHTF18-209ENST00000479976 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP41.52■■■■■ 4.24
CHTF18-209ENST00000479976 TRAK1Q9UPV9 953 aa41.52■■■■■ 4.24
CHTF18-209ENST00000479976 KIF1AQ12756 1690 aa41.48■■■■■ 4.23
CHTF18-209ENST00000479976 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP41.46■■■■■ 4.23
CHTF18-209ENST00000479976 PHF8Q9UPP1 1060 aa41.46■■■■■ 4.23
CHTF18-209ENST00000479976 KRT28Q7Z3Y7 464 aa41.45■■■■■ 4.23
CHTF18-209ENST00000479976 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP41.44■■■■■ 4.22
CHTF18-209ENST00000479976 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP41.42■■■■■ 4.22
CHTF18-209ENST00000479976 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa41.42■■■■■ 4.22
CHTF18-209ENST00000479976 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP41.41■■■■■ 4.22
CHTF18-209ENST00000479976 USP21Q9UK80 565 aa41.4■■■■■ 4.22
CHTF18-209ENST00000479976 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP41.38■■■■■ 4.21
CHTF18-209ENST00000479976 ADGRB2O60241 1585 aa41.37■■■■■ 4.21
CHTF18-209ENST00000479976 PSME1Q06323 249 aa41.37■■■■■ 4.21
CHTF18-209ENST00000479976 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP41.36■■■■■ 4.21
CHTF18-209ENST00000479976 ANKARQ7Z5J8 1434 aa41.35■■■■■ 4.21
CHTF18-209ENST00000479976 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP41.32■■■■■ 4.21
CHTF18-209ENST00000479976 USP32Q8NFA0 1604 aa41.31■■■■■ 4.2
CHTF18-209ENST00000479976 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa41.31■■■■■ 4.2
CHTF18-209ENST00000479976 WASLO00401 505 aaPredicted RBP41.29■■■■■ 4.2
CHTF18-209ENST00000479976 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP41.29■■■■■ 4.2
CHTF18-209ENST00000479976 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP41.29■■■■■ 4.2
CHTF18-209ENST00000479976 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP41.27■■■■■ 4.2
CHTF18-209ENST00000479976 RGS12O14924 1447 aa41.27■■■■■ 4.2
CHTF18-209ENST00000479976 TNS3Q68CZ2 1445 aa41.27■■■■■ 4.2
CHTF18-209ENST00000479976 SBNO1A3KN83 1393 aa41.26■■■■■ 4.2
CHTF18-209ENST00000479976 PRR36Q9H6K5 1346 aa41.23■■■■■ 4.19
CHTF18-209ENST00000479976 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP41.23■■■■■ 4.19
CHTF18-209ENST00000479976 BCL9LQ86UU0 1499 aa41.22■■■■■ 4.19
CHTF18-209ENST00000479976 ATRNO75882 1429 aa41.22■■■■■ 4.19
CHTF18-209ENST00000479976 TULP4Q9NRJ4 1543 aa41.21■■■■■ 4.19
CHTF18-209ENST00000479976 LMOD2Q6P5Q4 547 aa41.2■■■■■ 4.19
CHTF18-209ENST00000479976 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa41.2■■■■■ 4.19
CHTF18-209ENST00000479976 ARHGEF10O15013 1369 aa41.18■■■■■ 4.18
CHTF18-209ENST00000479976 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP41.17■■■■■ 4.18
CHTF18-209ENST00000479976 CABLES1Q8TDN4 633 aa41.17■■■■■ 4.18
CHTF18-209ENST00000479976 NBPF1Q3BBV0 1214 aa41.16■■■■■ 4.18
CHTF18-209ENST00000479976 GPRASP1Q5JY77 1395 aa41.14■■■■■ 4.18
CHTF18-209ENST00000479976 PLEKHG5O94827 1062 aa41.12■■■■■ 4.17
CHTF18-209ENST00000479976 UNC5CLQ8IV45 518 aa41.11■■■■■ 4.17
CHTF18-209ENST00000479976 SLIT2O94813 1529 aa41.11■■■■■ 4.17
CHTF18-209ENST00000479976 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP41.1■■■■■ 4.17
CHTF18-209ENST00000479976 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP41.1■■■■■ 4.17
CHTF18-209ENST00000479976 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP41.1■■■■■ 4.17
CHTF18-209ENST00000479976 L3MBTL2Q969R5 705 aa41.08■■■■■ 4.17
CHTF18-209ENST00000479976 CDK19Q9BWU1 502 aa41.08■■■■■ 4.17
CHTF18-209ENST00000479976 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP41.07■■■■■ 4.17
CHTF18-209ENST00000479976 SIN3AQ96ST3 1273 aa41.06■■■■■ 4.16
CHTF18-209ENST00000479976 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP41.06■■■■■ 4.16
CHTF18-209ENST00000479976 ATP7BP35670 1465 aa41.04■■■■■ 4.16
CHTF18-209ENST00000479976 ITSN1Q15811 1721 aa41.01■■■■■ 4.16
CHTF18-209ENST00000479976 ABCA3Q99758 1704 aa41.01■■■■■ 4.16
CHTF18-209ENST00000479976 ALS2Q96Q42 1657 aa41■■■■■ 4.15
CHTF18-209ENST00000479976 ATAD2Q6PL18 1390 aa40.99■■■■■ 4.15
CHTF18-209ENST00000479976 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP40.98■■■■■ 4.15
CHTF18-209ENST00000479976 NEUROD1Q13562 356 aa40.98■■■■■ 4.15
CHTF18-209ENST00000479976 FAM83GA6ND36 823 aa40.97■■■■■ 4.15
CHTF18-209ENST00000479976 CCDC61Q9Y6R9 512 aa40.97■■■■■ 4.15
CHTF18-209ENST00000479976 RALGAPBQ86X10 1494 aa40.95■■■■■ 4.15
CHTF18-209ENST00000479976 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP40.94■■■■■ 4.15
CHTF18-209ENST00000479976 VPS72Q15906 364 aa40.92■■■■■ 4.14
CHTF18-209ENST00000479976 NWD2Q9ULI1 1742 aa40.92■■■■■ 4.14
CHTF18-209ENST00000479976 PLCH1Q4KWH8 1693 aa40.91■■■■■ 4.14
CHTF18-209ENST00000479976 GLI3P10071 1580 aa40.91■■■■■ 4.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.8 ms