RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478849.1

OPN3-205, Transcript of opsin 3, humanhuman

TSL 3

Gene OPN3, Length 880 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-205ENST00000478849 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP36.65■■■■□ 3.46
OPN3-205ENST00000478849 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP36.65■■■■□ 3.46
OPN3-205ENST00000478849 NPHP3Q7Z494 1330 aa36.61■■■■□ 3.45
OPN3-205ENST00000478849 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa36.61■■■■□ 3.45
OPN3-205ENST00000478849 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP36.61■■■■□ 3.45
OPN3-205ENST00000478849 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa36.59■■■■□ 3.45
OPN3-205ENST00000478849 ATAD2Q6PL18 1390 aa36.59■■■■□ 3.45
OPN3-205ENST00000478849 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP36.58■■■■□ 3.45
OPN3-205ENST00000478849 STK26Q9P289 416 aa36.58■■■■□ 3.45
OPN3-205ENST00000478849 MYOM2P54296 1465 aa36.57■■■■□ 3.45
OPN3-205ENST00000478849 FOXO3O43524 673 aa36.57■■■■□ 3.44
OPN3-205ENST00000478849 ATRNO75882 1429 aa36.57■■■■□ 3.44
OPN3-205ENST00000478849 PXDNQ92626 1479 aa36.56■■■■□ 3.44
OPN3-205ENST00000478849 RGL3Q3MIN7 710 aa36.56■■■■□ 3.44
OPN3-205ENST00000478849 WAPLQ7Z5K2 1190 aa36.56■■■■□ 3.44
OPN3-205ENST00000478849 NUTM2FA1L443 756 aa36.55■■■■□ 3.44
OPN3-205ENST00000478849 CCDC144AA2RUR9 1427 aa36.52■■■■□ 3.44
OPN3-205ENST00000478849 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP36.5■■■■□ 3.43
OPN3-205ENST00000478849 TECPR2O15040 1411 aa36.5■■■■□ 3.43
OPN3-205ENST00000478849 BCL9LQ86UU0 1499 aa36.5■■■■□ 3.43
OPN3-205ENST00000478849 TMEM132EQ6IEE7 984 aa36.49■■■■□ 3.43
OPN3-205ENST00000478849 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa36.49■■■■□ 3.43
OPN3-205ENST00000478849 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa36.47■■■■□ 3.43
OPN3-205ENST00000478849 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa36.46■■■■□ 3.43
OPN3-205ENST00000478849 ABCC11Q96J66 1382 aa36.45■■■■□ 3.43
OPN3-205ENST00000478849 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa36.45■■■■□ 3.43
OPN3-205ENST00000478849 MPHOSPH9Q99550 1183 aa36.43■■■■□ 3.42
OPN3-205ENST00000478849 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP36.42■■■■□ 3.42
OPN3-205ENST00000478849 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP36.41■■■■□ 3.42
OPN3-205ENST00000478849 IFT172Q9UG01 1749 aa36.4■■■■□ 3.42
OPN3-205ENST00000478849 EP400Q96L91 3159 aa36.38■■■■□ 3.41
OPN3-205ENST00000478849 PIK3C2GO75747 1445 aa36.38■■■■□ 3.41
OPN3-205ENST00000478849 KNDC1Q76NI1 1749 aa36.37■■■■□ 3.41
OPN3-205ENST00000478849 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa36.36■■■■□ 3.41
OPN3-205ENST00000478849 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP36.36■■■■□ 3.41
OPN3-205ENST00000478849 FMN2Q9NZ56 1722 aa36.35■■■■□ 3.41
OPN3-205ENST00000478849 KRT28Q7Z3Y7 464 aa36.33■■■■□ 3.41
OPN3-205ENST00000478849 UNC5CLQ8IV45 518 aa36.33■■■■□ 3.41
OPN3-205ENST00000478849 ZRANB1Q9UGI0 708 aa36.33■■■■□ 3.41
OPN3-205ENST00000478849 CCDC125Q86Z20 511 aa36.32■■■■□ 3.4
OPN3-205ENST00000478849 KIF1AQ12756 1690 aa36.29■■■■□ 3.4
OPN3-205ENST00000478849 SLIT2O94813 1529 aa36.29■■■■□ 3.4
OPN3-205ENST00000478849 SIRT1Q96EB6 747 aa36.29■■■■□ 3.4
OPN3-205ENST00000478849 RALGAPBQ86X10 1494 aa36.28■■■■□ 3.4
OPN3-205ENST00000478849 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP36.28■■■■□ 3.4
OPN3-205ENST00000478849 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP36.27■■■■□ 3.4
OPN3-205ENST00000478849 GLI3P10071 1580 aa36.25■■■■□ 3.39
OPN3-205ENST00000478849 PHF8Q9UPP1 1060 aa36.25■■■■□ 3.39
OPN3-205ENST00000478849 CFAP70Q5T0N1 1121 aa36.23■■■■□ 3.39
OPN3-205ENST00000478849 USP32Q8NFA0 1604 aa36.23■■■■□ 3.39
OPN3-205ENST00000478849 PLEKHG5O94827 1062 aa36.22■■■■□ 3.39
OPN3-205ENST00000478849 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP36.22■■■■□ 3.39
OPN3-205ENST00000478849 CABLES1Q8TDN4 633 aa36.22■■■■□ 3.39
OPN3-205ENST00000478849 PSME1Q06323 249 aa36.21■■■■□ 3.39
OPN3-205ENST00000478849 TNS3Q68CZ2 1445 aa36.2■■■■□ 3.39
OPN3-205ENST00000478849 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP36.2■■■■□ 3.38
OPN3-205ENST00000478849 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP36.19■■■■□ 3.38
OPN3-205ENST00000478849 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP36.19■■■■□ 3.38
OPN3-205ENST00000478849 NRXN1Q9ULB1 1477 aa36.18■■■■□ 3.38
OPN3-205ENST00000478849 PRAM1Q96QH2 718 aa36.17■■■■□ 3.38
OPN3-205ENST00000478849 LMOD2Q6P5Q4 547 aa36.15■■■■□ 3.38
OPN3-205ENST00000478849 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP36.15■■■■□ 3.38
OPN3-205ENST00000478849 SEPT12Q8IYM1 358 aa36.14■■■■□ 3.38
OPN3-205ENST00000478849 VPS72Q15906 364 aa36.13■■■■□ 3.37
OPN3-205ENST00000478849 SBNO1A3KN83 1393 aa36.13■■■■□ 3.37
OPN3-205ENST00000478849 BRWD3Q6RI45 1802 aa36.11■■■■□ 3.37
OPN3-205ENST00000478849 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa36.1■■■■□ 3.37
OPN3-205ENST00000478849 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP36.1■■■■□ 3.37
OPN3-205ENST00000478849 DEFB132Q7Z7B7 95 aa36.09■■■■□ 3.37
OPN3-205ENST00000478849 POGKQ9P215 609 aa36.09■■■■□ 3.37
OPN3-205ENST00000478849 ARHGEF10O15013 1369 aa36.08■■■■□ 3.37
OPN3-205ENST00000478849 PLCH1Q4KWH8 1693 aa36.06■■■■□ 3.36
OPN3-205ENST00000478849 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP36.05■■■■□ 3.36
OPN3-205ENST00000478849 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP36.05■■■■□ 3.36
OPN3-205ENST00000478849 FAM83GA6ND36 823 aa36.04■■■■□ 3.36
OPN3-205ENST00000478849 ABCA3Q99758 1704 aa36.03■■■■□ 3.36
OPN3-205ENST00000478849 NWD2Q9ULI1 1742 aa36.03■■■■□ 3.36
OPN3-205ENST00000478849 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP36.03■■■■□ 3.36
OPN3-205ENST00000478849 DLC1Q96QB1 1528 aa36.03■■■■□ 3.36
OPN3-205ENST00000478849 ANKARQ7Z5J8 1434 aa36.02■■■■□ 3.36
OPN3-205ENST00000478849 KRT27Q7Z3Y8 459 aa36.01■■■■□ 3.36
OPN3-205ENST00000478849 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP35.99■■■■□ 3.35
OPN3-205ENST00000478849 TRAK1Q9UPV9 953 aa35.98■■■■□ 3.35
OPN3-205ENST00000478849 ADGRB1O14514 1584 aa35.96■■■■□ 3.35
OPN3-205ENST00000478849 ADGRB2O60241 1585 aa35.96■■■■□ 3.35
OPN3-205ENST00000478849 A0A0G2JS52 829 aa35.95■■■■□ 3.35
OPN3-205ENST00000478849 MYT1Q01538 1121 aa35.95■■■■□ 3.35
OPN3-205ENST00000478849 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP35.94■■■■□ 3.34
OPN3-205ENST00000478849 PRR36Q9H6K5 1346 aa35.93■■■■□ 3.34
OPN3-205ENST00000478849 BTG4Q9NY30 223 aa35.93■■■■□ 3.34
OPN3-205ENST00000478849 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP35.91■■■■□ 3.34
OPN3-205ENST00000478849 GPRASP1Q5JY77 1395 aa35.91■■■■□ 3.34
OPN3-205ENST00000478849 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP35.91■■■■□ 3.34
OPN3-205ENST00000478849 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa35.9■■■■□ 3.34
OPN3-205ENST00000478849 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa35.9■■■■□ 3.34
OPN3-205ENST00000478849 NRAPQ86VF7 1730 aa35.88■■■■□ 3.33
OPN3-205ENST00000478849 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP35.87■■■■□ 3.33
OPN3-205ENST00000478849 WASLO00401 505 aaPredicted RBP35.86■■■■□ 3.33
OPN3-205ENST00000478849 ALS2Q96Q42 1657 aa35.86■■■■□ 3.33
OPN3-205ENST00000478849 DCAF11Q8TEB1 546 aa35.85■■■■□ 3.33
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