RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477216.1

SKIL-208, Transcript of SKI like proto-oncogene, humanhuman

TSL 4

Gene SKIL, Length 554 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIL-208ENST00000477216 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP36.47■■■■□ 3.43
SKIL-208ENST00000477216 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP36.45■■■■□ 3.43
SKIL-208ENST00000477216 ADAMTS2O95450 1211 aa36.45■■■■□ 3.43
SKIL-208ENST00000477216 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP36.43■■■■□ 3.42
SKIL-208ENST00000477216 USP21Q9UK80 565 aa36.43■■■■□ 3.42
SKIL-208ENST00000477216 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa36.41■■■■□ 3.42
SKIL-208ENST00000477216 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa36.4■■■■□ 3.42
SKIL-208ENST00000477216 PRAG1Q86YV5 1406 aa36.4■■■■□ 3.42
SKIL-208ENST00000477216 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP36.38■■■■□ 3.41
SKIL-208ENST00000477216 CCDC125Q86Z20 511 aa36.36■■■■□ 3.41
SKIL-208ENST00000477216 NPHP3Q7Z494 1330 aa36.34■■■■□ 3.41
SKIL-208ENST00000477216 RGL3Q3MIN7 710 aa36.32■■■■□ 3.4
SKIL-208ENST00000477216 ORAI2Q96SN7 254 aa36.31■■■■□ 3.4
SKIL-208ENST00000477216 ZRANB1Q9UGI0 708 aa36.31■■■■□ 3.4
SKIL-208ENST00000477216 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP36.3■■■■□ 3.4
SKIL-208ENST00000477216 ROBO2Q9HCK4 1378 aa36.3■■■■□ 3.4
SKIL-208ENST00000477216 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP36.29■■■■□ 3.4
SKIL-208ENST00000477216 ATRNO75882 1429 aa36.27■■■■□ 3.4
SKIL-208ENST00000477216 ESCO1Q5FWF5 840 aa36.22■■■■□ 3.39
SKIL-208ENST00000477216 SIN3AQ96ST3 1273 aa36.22■■■■□ 3.39
SKIL-208ENST00000477216 PPLO60437 1756 aa36.21■■■■□ 3.39
SKIL-208ENST00000477216 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa36.2■■■■□ 3.39
SKIL-208ENST00000477216 MYOM2P54296 1465 aa36.18■■■■□ 3.38
SKIL-208ENST00000477216 IFT172Q9UG01 1749 aa36.17■■■■□ 3.38
SKIL-208ENST00000477216 NEUROD1Q13562 356 aa36.15■■■■□ 3.38
SKIL-208ENST00000477216 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP36.13■■■■□ 3.37
SKIL-208ENST00000477216 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP36.13■■■■□ 3.37
SKIL-208ENST00000477216 BCL9LQ86UU0 1499 aa36.11■■■■□ 3.37
SKIL-208ENST00000477216 PXDNQ92626 1479 aa36.11■■■■□ 3.37
SKIL-208ENST00000477216 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa36.1■■■■□ 3.37
SKIL-208ENST00000477216 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa36.1■■■■□ 3.37
SKIL-208ENST00000477216 FOXO3O43524 673 aa36.08■■■■□ 3.37
SKIL-208ENST00000477216 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP36.08■■■■□ 3.37
SKIL-208ENST00000477216 DCAF11Q8TEB1 546 aa36.07■■■■□ 3.36
SKIL-208ENST00000477216 CLSPNQ9HAW4 1339 aa36.07■■■■□ 3.36
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SKIL-208ENST00000477216 TECPR2O15040 1411 aa36.04■■■■□ 3.36
SKIL-208ENST00000477216 UNC5CLQ8IV45 518 aa36.04■■■■□ 3.36
SKIL-208ENST00000477216 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa36.03■■■■□ 3.36
SKIL-208ENST00000477216 STAC3Q96MF2 364 aa36.02■■■■□ 3.36
SKIL-208ENST00000477216 NRXN1Q9ULB1 1477 aa36.02■■■■□ 3.36
SKIL-208ENST00000477216 EP400Q96L91 3159 aa36.01■■■■□ 3.35
SKIL-208ENST00000477216 PIK3C2GO75747 1445 aa36■■■■□ 3.35
SKIL-208ENST00000477216 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP36■■■■□ 3.35
SKIL-208ENST00000477216 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP35.99■■■■□ 3.35
SKIL-208ENST00000477216 L3MBTL2Q969R5 705 aa35.99■■■■□ 3.35
SKIL-208ENST00000477216 ABCC11Q96J66 1382 aa35.99■■■■□ 3.35
SKIL-208ENST00000477216 KIF1AQ12756 1690 aa35.98■■■■□ 3.35
SKIL-208ENST00000477216 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP35.96■■■■□ 3.35
SKIL-208ENST00000477216 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa35.96■■■■□ 3.35
SKIL-208ENST00000477216 SLIT2O94813 1529 aa35.94■■■■□ 3.34
SKIL-208ENST00000477216 TONSLQ96HA7 1378 aa35.94■■■■□ 3.34
SKIL-208ENST00000477216 PSME1Q06323 249 aa35.94■■■■□ 3.34
SKIL-208ENST00000477216 STK26Q9P289 416 aa35.94■■■■□ 3.34
SKIL-208ENST00000477216 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP35.93■■■■□ 3.34
SKIL-208ENST00000477216 KNDC1Q76NI1 1749 aa35.92■■■■□ 3.34
SKIL-208ENST00000477216 SIRT1Q96EB6 747 aa35.92■■■■□ 3.34
SKIL-208ENST00000477216 RALGAPBQ86X10 1494 aa35.92■■■■□ 3.34
SKIL-208ENST00000477216 WAPLQ7Z5K2 1190 aa35.9■■■■□ 3.34
SKIL-208ENST00000477216 KRT28Q7Z3Y7 464 aa35.88■■■■□ 3.33
SKIL-208ENST00000477216 NUTM2FA1L443 756 aa35.87■■■■□ 3.33
SKIL-208ENST00000477216 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP35.87■■■■□ 3.33
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SKIL-208ENST00000477216 CFAP70Q5T0N1 1121 aa35.86■■■■□ 3.33
SKIL-208ENST00000477216 GLI3P10071 1580 aa35.85■■■■□ 3.33
SKIL-208ENST00000477216 VPS72Q15906 364 aa35.84■■■■□ 3.33
SKIL-208ENST00000477216 TNS3Q68CZ2 1445 aa35.82■■■■□ 3.32
SKIL-208ENST00000477216 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP35.82■■■■□ 3.32
SKIL-208ENST00000477216 ARHGEF10O15013 1369 aa35.81■■■■□ 3.32
SKIL-208ENST00000477216 PHF8Q9UPP1 1060 aa35.81■■■■□ 3.32
SKIL-208ENST00000477216 SEPT12Q8IYM1 358 aa35.8■■■■□ 3.32
SKIL-208ENST00000477216 SBNO1A3KN83 1393 aa35.79■■■■□ 3.32
SKIL-208ENST00000477216 NWD2Q9ULI1 1742 aa35.79■■■■□ 3.32
SKIL-208ENST00000477216 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP35.78■■■■□ 3.32
SKIL-208ENST00000477216 TMEM132EQ6IEE7 984 aa35.78■■■■□ 3.32
SKIL-208ENST00000477216 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP35.77■■■■□ 3.32
SKIL-208ENST00000477216 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa35.76■■■■□ 3.32
SKIL-208ENST00000477216 KRT27Q7Z3Y8 459 aa35.75■■■■□ 3.31
SKIL-208ENST00000477216 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa35.74■■■■□ 3.31
SKIL-208ENST00000477216 BRWD3Q6RI45 1802 aa35.72■■■■□ 3.31
SKIL-208ENST00000477216 ADGRB1O14514 1584 aa35.72■■■■□ 3.31
SKIL-208ENST00000477216 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa35.71■■■■□ 3.31
SKIL-208ENST00000477216 BAG6P46379 1132 aa35.7■■■■□ 3.31
SKIL-208ENST00000477216 DEFB132Q7Z7B7 95 aa35.69■■■■□ 3.3
SKIL-208ENST00000477216 NBPF8Q3BBV2 869 aa35.68■■■■□ 3.3
SKIL-208ENST00000477216 LMOD2Q6P5Q4 547 aa35.68■■■■□ 3.3
SKIL-208ENST00000477216 LRP5O75197 1615 aa35.68■■■■□ 3.3
SKIL-208ENST00000477216 PLCH1Q4KWH8 1693 aa35.67■■■■□ 3.3
SKIL-208ENST00000477216 ANKARQ7Z5J8 1434 aa35.66■■■■□ 3.3
SKIL-208ENST00000477216 NBPF1Q3BBV0 1214 aa35.64■■■■□ 3.3
SKIL-208ENST00000477216 A0A0G2JS52 829 aa35.63■■■■□ 3.29
SKIL-208ENST00000477216 MYT1Q01538 1121 aa35.63■■■■□ 3.29
SKIL-208ENST00000477216 CABLES1Q8TDN4 633 aa35.63■■■■□ 3.29
SKIL-208ENST00000477216 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa35.63■■■■□ 3.29
SKIL-208ENST00000477216 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP35.63■■■■□ 3.29
SKIL-208ENST00000477216 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP35.61■■■■□ 3.29
SKIL-208ENST00000477216 POGKQ9P215 609 aa35.6■■■■□ 3.29
SKIL-208ENST00000477216 PRAM1Q96QH2 718 aa35.58■■■■□ 3.29
SKIL-208ENST00000477216 GPRASP1Q5JY77 1395 aa35.58■■■■□ 3.29
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