RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468045.5

PREB-208, Transcript of prolactin regulatory element binding, humanhuman

TSL 2

Gene PREB, Length 3,057 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREB-208ENST00000468045 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
PREB-208ENST00000468045 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
PREB-208ENST00000468045 RUNDC1Q96C34 613 aa22.51■■□□□ 1.19
PREB-208ENST00000468045 IQGAP3Q86VI3 1631 aa22.51■■□□□ 1.19
PREB-208ENST00000468045 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
PREB-208ENST00000468045 MORC1Q86VD1 984 aa22.49■■□□□ 1.19
PREB-208ENST00000468045 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.49■■□□□ 1.19
PREB-208ENST00000468045 DDX11L8A8MPP1 907 aa22.49■■□□□ 1.19
PREB-208ENST00000468045 PLXNC1O60486 1568 aa22.48■■□□□ 1.19
PREB-208ENST00000468045 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
PREB-208ENST00000468045 NGEFQ8N5V2 710 aa22.46■■□□□ 1.19
PREB-208ENST00000468045 ATP10AO60312 1499 aa22.46■■□□□ 1.19
PREB-208ENST00000468045 ITPRIPQ8IWB1 547 aa22.46■■□□□ 1.19
PREB-208ENST00000468045 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa22.45■■□□□ 1.18
PREB-208ENST00000468045 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
PREB-208ENST00000468045 PREX2Q70Z35 1606 aa22.44■■□□□ 1.18
PREB-208ENST00000468045 MTHFSP49914 203 aa22.44■■□□□ 1.18
PREB-208ENST00000468045 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa22.44■■□□□ 1.18
PREB-208ENST00000468045 ERVK-7P63135 1459 aa22.44■■□□□ 1.18
PREB-208ENST00000468045 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
PREB-208ENST00000468045 DDIT3P35638 169 aa22.43■■□□□ 1.18
PREB-208ENST00000468045 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
PREB-208ENST00000468045 SMC4Q9NTJ3 1288 aa22.42■■□□□ 1.18
PREB-208ENST00000468045 TRIM27P14373 513 aa22.42■■□□□ 1.18
PREB-208ENST00000468045 WDR63Q8IWG1 891 aa22.42■■□□□ 1.18
PREB-208ENST00000468045 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
PREB-208ENST00000468045 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
PREB-208ENST00000468045 AAMPQ13685 434 aa22.42■■□□□ 1.18
PREB-208ENST00000468045 LNPKQ9C0E8 428 aa22.42■■□□□ 1.18
PREB-208ENST00000468045 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.41■■□□□ 1.18
PREB-208ENST00000468045 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa22.41■■□□□ 1.18
PREB-208ENST00000468045 ZMYM3Q14202 1370 aa22.41■■□□□ 1.18
PREB-208ENST00000468045 CEP152O94986 1710 aa22.41■■□□□ 1.18
PREB-208ENST00000468045 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.4■■□□□ 1.18
PREB-208ENST00000468045 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
PREB-208ENST00000468045 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.4■■□□□ 1.18
PREB-208ENST00000468045 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
PREB-208ENST00000468045 NSD3Q9BZ95 1437 aa22.39■■□□□ 1.18
PREB-208ENST00000468045 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
PREB-208ENST00000468045 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.39■■□□□ 1.17
PREB-208ENST00000468045 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa22.39■■□□□ 1.17
PREB-208ENST00000468045 SSH1Q8WYL5 1049 aa22.38■■□□□ 1.17
PREB-208ENST00000468045 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
PREB-208ENST00000468045 RBM10P98175 930 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
PREB-208ENST00000468045 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
PREB-208ENST00000468045 DUOX2Q9NRD8 1548 aa22.36■■□□□ 1.17
PREB-208ENST00000468045 SHPRHQ149N8 1683 aa22.36■■□□□ 1.17
PREB-208ENST00000468045 SSFA2P28290 1259 aa22.36■■□□□ 1.17
PREB-208ENST00000468045 TMEM57Q8N5G2 664 aa22.36■■□□□ 1.17
PREB-208ENST00000468045 IQSEC2Q5JU85 1478 aa22.35■■□□□ 1.17
PREB-208ENST00000468045 RAB3GAP1Q15042 981 aa22.35■■□□□ 1.17
PREB-208ENST00000468045 GBP4Q96PP9 640 aa22.35■■□□□ 1.17
PREB-208ENST00000468045 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa22.35■■□□□ 1.17
PREB-208ENST00000468045 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
PREB-208ENST00000468045 SMC5Q8IY18 1101 aa22.34■■□□□ 1.17
PREB-208ENST00000468045 TRAK1Q9UPV9 953 aa22.34■■□□□ 1.17
PREB-208ENST00000468045 KIF2CQ99661 725 aa22.34■■□□□ 1.17
PREB-208ENST00000468045 RBM25P49756 843 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
PREB-208ENST00000468045 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa22.33■■□□□ 1.17
PREB-208ENST00000468045 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.33■■□□□ 1.166e-6■■□□□ 13.3
PREB-208ENST00000468045 CLTCL1P53675 1640 aa22.32■■□□□ 1.16
PREB-208ENST00000468045 ERCC6Q03468 1493 aa22.32■■□□□ 1.16
PREB-208ENST00000468045 NASPP49321 788 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
PREB-208ENST00000468045 AFAP1Q8N556 730 aa22.32■■□□□ 1.16
PREB-208ENST00000468045 SNX21Q969T3 373 aa22.31■■□□□ 1.16
PREB-208ENST00000468045 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
PREB-208ENST00000468045 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa22.3■■□□□ 1.16
PREB-208ENST00000468045 DDX19BQ9UMR2 479 aa22.3■■□□□ 1.16
PREB-208ENST00000468045 GAS2L2Q8NHY3 880 aa22.3■■□□□ 1.16
PREB-208ENST00000468045 TPM2P07951 284 aa22.29■■□□□ 1.16
PREB-208ENST00000468045 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.29■■□□□ 1.16
PREB-208ENST00000468045 CCDC27Q2M243 656 aa22.28■■□□□ 1.16
PREB-208ENST00000468045 UGGT1Q9NYU2 1555 aa22.28■■□□□ 1.16
PREB-208ENST00000468045 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
PREB-208ENST00000468045 C1orf115Q9H7X2 142 aa22.28■■□□□ 1.16
PREB-208ENST00000468045 NUCB1Q02818 461 aa22.27■■□□□ 1.16
PREB-208ENST00000468045 ARID3AQ99856 593 aa22.27■■□□□ 1.16
PREB-208ENST00000468045 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa22.27■■□□□ 1.16
PREB-208ENST00000468045 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
PREB-208ENST00000468045 CFAP53Q96M91 514 aa22.27■■□□□ 1.16
PREB-208ENST00000468045 NCLP19338 710 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.15
PREB-208ENST00000468045 TMEM132EQ6IEE7 984 aa22.26■■□□□ 1.15
PREB-208ENST00000468045 TRPM2O94759 1503 aa22.26■■□□□ 1.15
PREB-208ENST00000468045 CHGAP10645 457 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
PREB-208ENST00000468045 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
PREB-208ENST00000468045 CHD1LQ86WJ1 897 aa22.26■■□□□ 1.15
PREB-208ENST00000468045 PTPRTO14522 1441 aa22.26■■□□□ 1.15
PREB-208ENST00000468045 ANKRD45Q5TZF3 282 aa22.25■■□□□ 1.15
PREB-208ENST00000468045 PDCL3Q9H2J4 239 aa22.25■■□□□ 1.15
PREB-208ENST00000468045 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
PREB-208ENST00000468045 CCDC173Q0VFZ6 552 aa22.25■■□□□ 1.15
PREB-208ENST00000468045 ZSCAN30Q86W11 494 aa22.25■■□□□ 1.15
PREB-208ENST00000468045 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
PREB-208ENST00000468045 AK9Q5TCS8 1911 aa22.25■■□□□ 1.15
PREB-208ENST00000468045 RIPK4P57078 832 aa22.25■■□□□ 1.15
PREB-208ENST00000468045 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
PREB-208ENST00000468045 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.23■■□□□ 1.15
PREB-208ENST00000468045 PPP1R9BQ96SB3 815 aa22.23■■□□□ 1.15
PREB-208ENST00000468045 TRIM35Q9UPQ4 493 aa22.23■■□□□ 1.15
PREB-208ENST00000468045 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
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