RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448450.5

HTATSF1-203, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

TSL 5

Gene HTATSF1, Length 1,014 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-203ENST00000448450 ROBO2Q9HCK4 1378 aa36.61■■■■□ 3.45
HTATSF1-203ENST00000448450 IFT172Q9UG01 1749 aa36.59■■■■□ 3.45
HTATSF1-203ENST00000448450 RGS12O14924 1447 aa36.56■■■■□ 3.44
HTATSF1-203ENST00000448450 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP36.55■■■■□ 3.44
HTATSF1-203ENST00000448450 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP36.55■■■■□ 3.44
HTATSF1-203ENST00000448450 ADAMTS2O95450 1211 aa36.52■■■■□ 3.44
HTATSF1-203ENST00000448450 NGLY1Q96IV0 654 aa36.52■■■■□ 3.44
HTATSF1-203ENST00000448450 ORAI2Q96SN7 254 aa36.52■■■■□ 3.44
HTATSF1-203ENST00000448450 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP36.52■■■■□ 3.44
HTATSF1-203ENST00000448450 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa36.48■■■■□ 3.43
HTATSF1-203ENST00000448450 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa36.47■■■■□ 3.43
HTATSF1-203ENST00000448450 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP36.45■■■■□ 3.43
HTATSF1-203ENST00000448450 DCAF11Q8TEB1 546 aa36.45■■■■□ 3.43
HTATSF1-203ENST00000448450 PIK3C2GO75747 1445 aa36.44■■■■□ 3.42
HTATSF1-203ENST00000448450 TMEM132EQ6IEE7 984 aa36.44■■■■□ 3.42
HTATSF1-203ENST00000448450 STK26Q9P289 416 aa36.42■■■■□ 3.42
HTATSF1-203ENST00000448450 MYOM2P54296 1465 aa36.41■■■■□ 3.42
HTATSF1-203ENST00000448450 CFAP70Q5T0N1 1121 aa36.4■■■■□ 3.42
HTATSF1-203ENST00000448450 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP36.39■■■■□ 3.42
HTATSF1-203ENST00000448450 USP21Q9UK80 565 aa36.39■■■■□ 3.42
HTATSF1-203ENST00000448450 NPHP3Q7Z494 1330 aa36.38■■■■□ 3.41
HTATSF1-203ENST00000448450 NRXN1Q9ULB1 1477 aa36.37■■■■□ 3.41
HTATSF1-203ENST00000448450 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP36.36■■■■□ 3.41
HTATSF1-203ENST00000448450 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP36.36■■■■□ 3.41
HTATSF1-203ENST00000448450 ESCO1Q5FWF5 840 aa36.35■■■■□ 3.41
HTATSF1-203ENST00000448450 ATAD2Q6PL18 1390 aa36.34■■■■□ 3.41
HTATSF1-203ENST00000448450 PXDNQ92626 1479 aa36.33■■■■□ 3.41
HTATSF1-203ENST00000448450 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP36.33■■■■□ 3.41
HTATSF1-203ENST00000448450 SIN3AQ96ST3 1273 aa36.33■■■■□ 3.41
HTATSF1-203ENST00000448450 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP36.31■■■■□ 3.4
HTATSF1-203ENST00000448450 TECPR2O15040 1411 aa36.31■■■■□ 3.4
HTATSF1-203ENST00000448450 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP36.3■■■■□ 3.4
HTATSF1-203ENST00000448450 KNDC1Q76NI1 1749 aa36.3■■■■□ 3.4
HTATSF1-203ENST00000448450 ATRNO75882 1429 aa36.29■■■■□ 3.4
HTATSF1-203ENST00000448450 NEUROD1Q13562 356 aa36.28■■■■□ 3.4
HTATSF1-203ENST00000448450 STAC3Q96MF2 364 aa36.27■■■■□ 3.4
HTATSF1-203ENST00000448450 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP36.26■■■■□ 3.4
HTATSF1-203ENST00000448450 WAPLQ7Z5K2 1190 aa36.26■■■■□ 3.4
HTATSF1-203ENST00000448450 EP400Q96L91 3159 aa36.25■■■■□ 3.39
HTATSF1-203ENST00000448450 FOXO3O43524 673 aa36.25■■■■□ 3.39
HTATSF1-203ENST00000448450 ABCC11Q96J66 1382 aa36.24■■■■□ 3.39
HTATSF1-203ENST00000448450 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa36.22■■■■□ 3.39
HTATSF1-203ENST00000448450 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP36.22■■■■□ 3.39
HTATSF1-203ENST00000448450 FMN2Q9NZ56 1722 aa36.21■■■■□ 3.39
HTATSF1-203ENST00000448450 KIF1AQ12756 1690 aa36.2■■■■□ 3.39
HTATSF1-203ENST00000448450 NUTM2FA1L443 756 aa36.2■■■■□ 3.39
HTATSF1-203ENST00000448450 BCL9LQ86UU0 1499 aa36.19■■■■□ 3.38
HTATSF1-203ENST00000448450 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa36.18■■■■□ 3.38
HTATSF1-203ENST00000448450 PCGF6Q9BYE7 350 aa36.16■■■■□ 3.38
HTATSF1-203ENST00000448450 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP36.16■■■■□ 3.38
HTATSF1-203ENST00000448450 L3MBTL2Q969R5 705 aa36.15■■■■□ 3.38
HTATSF1-203ENST00000448450 TRAK1Q9UPV9 953 aa36.12■■■■□ 3.37
HTATSF1-203ENST00000448450 SIRT1Q96EB6 747 aa36.11■■■■□ 3.37
HTATSF1-203ENST00000448450 ADGRB1O14514 1584 aa36.1■■■■□ 3.37
HTATSF1-203ENST00000448450 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP36.1■■■■□ 3.37
HTATSF1-203ENST00000448450 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP36.09■■■■□ 3.37
HTATSF1-203ENST00000448450 PRAM1Q96QH2 718 aa36.09■■■■□ 3.37
HTATSF1-203ENST00000448450 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa36.08■■■■□ 3.37
HTATSF1-203ENST00000448450 POGKQ9P215 609 aa36.07■■■■□ 3.36
HTATSF1-203ENST00000448450 USP32Q8NFA0 1604 aa36.07■■■■□ 3.36
HTATSF1-203ENST00000448450 CCDC125Q86Z20 511 aa36.04■■■■□ 3.36
HTATSF1-203ENST00000448450 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP36.04■■■■□ 3.36
HTATSF1-203ENST00000448450 SLIT2O94813 1529 aa36.03■■■■□ 3.36
HTATSF1-203ENST00000448450 NBPF1Q3BBV0 1214 aa36.01■■■■□ 3.36
HTATSF1-203ENST00000448450 KRT28Q7Z3Y7 464 aa36.01■■■■□ 3.36
HTATSF1-203ENST00000448450 UNC5CLQ8IV45 518 aa36.01■■■■□ 3.36
HTATSF1-203ENST00000448450 ZRANB1Q9UGI0 708 aa36.01■■■■□ 3.36
HTATSF1-203ENST00000448450 GLI3P10071 1580 aa36.01■■■■□ 3.35
HTATSF1-203ENST00000448450 RALGAPBQ86X10 1494 aa36■■■■□ 3.35
HTATSF1-203ENST00000448450 TNS3Q68CZ2 1445 aa36■■■■□ 3.35
HTATSF1-203ENST00000448450 DLC1Q96QB1 1528 aa35.99■■■■□ 3.35
HTATSF1-203ENST00000448450 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP35.97■■■■□ 3.35
HTATSF1-203ENST00000448450 PHF8Q9UPP1 1060 aa35.97■■■■□ 3.35
HTATSF1-203ENST00000448450 PSME1Q06323 249 aa35.95■■■■□ 3.35
HTATSF1-203ENST00000448450 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa35.94■■■■□ 3.34
HTATSF1-203ENST00000448450 ABCA3Q99758 1704 aa35.93■■■■□ 3.34
HTATSF1-203ENST00000448450 PLCH1Q4KWH8 1693 aa35.93■■■■□ 3.34
HTATSF1-203ENST00000448450 NWD2Q9ULI1 1742 aa35.92■■■■□ 3.34
HTATSF1-203ENST00000448450 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP35.92■■■■□ 3.34
HTATSF1-203ENST00000448450 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP35.91■■■■□ 3.34
HTATSF1-203ENST00000448450 BRWD3Q6RI45 1802 aa35.91■■■■□ 3.34
HTATSF1-203ENST00000448450 SBNO1A3KN83 1393 aa35.89■■■■□ 3.34
HTATSF1-203ENST00000448450 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP35.89■■■■□ 3.34
HTATSF1-203ENST00000448450 ARHGEF10O15013 1369 aa35.89■■■■□ 3.34
HTATSF1-203ENST00000448450 TONSLQ96HA7 1378 aa35.89■■■■□ 3.34
HTATSF1-203ENST00000448450 ANKARQ7Z5J8 1434 aa35.86■■■■□ 3.33
HTATSF1-203ENST00000448450 CABLES1Q8TDN4 633 aa35.86■■■■□ 3.33
HTATSF1-203ENST00000448450 ADGRB2O60241 1585 aa35.85■■■■□ 3.33
HTATSF1-203ENST00000448450 LMOD2Q6P5Q4 547 aa35.85■■■■□ 3.33
HTATSF1-203ENST00000448450 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP35.85■■■■□ 3.33
HTATSF1-203ENST00000448450 NBPF8Q3BBV2 869 aa35.84■■■■□ 3.33
HTATSF1-203ENST00000448450 PLEKHG5O94827 1062 aa35.83■■■■□ 3.33
HTATSF1-203ENST00000448450 VPS72Q15906 364 aa35.83■■■■□ 3.33
HTATSF1-203ENST00000448450 SEPT12Q8IYM1 358 aa35.8■■■■□ 3.32
HTATSF1-203ENST00000448450 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP35.8■■■■□ 3.32
HTATSF1-203ENST00000448450 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa35.79■■■■□ 3.32
HTATSF1-203ENST00000448450 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa35.77■■■■□ 3.32
HTATSF1-203ENST00000448450 WASLO00401 505 aaPredicted RBP35.76■■■■□ 3.32
HTATSF1-203ENST00000448450 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP35.76■■■■□ 3.32
HTATSF1-203ENST00000448450 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP35.76■■■■□ 3.31
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