RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 NPHP3Q7Z494 1330 aa17.47■□□□□ 0.39
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PRAME-210ENST00000442481 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa17.27■□□□□ 0.35
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PRAME-210ENST00000442481 SBNO1A3KN83 1393 aa17.21■□□□□ 0.35
PRAME-210ENST00000442481 MPHOSPH9Q99550 1183 aa17.21■□□□□ 0.35
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PRAME-210ENST00000442481 ABCA3Q99758 1704 aa17.2■□□□□ 0.34
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PRAME-210ENST00000442481 LMOD2Q6P5Q4 547 aa17.17■□□□□ 0.34
PRAME-210ENST00000442481 ANKARQ7Z5J8 1434 aa17.17■□□□□ 0.34
PRAME-210ENST00000442481 KRT27Q7Z3Y8 459 aa17.16■□□□□ 0.34
PRAME-210ENST00000442481 POGKQ9P215 609 aa17.15■□□□□ 0.34
PRAME-210ENST00000442481 DLC1Q96QB1 1528 aa17.15■□□□□ 0.34
PRAME-210ENST00000442481 A0A0G2JS52 829 aa17.14■□□□□ 0.33
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PRAME-210ENST00000442481 BAG6P46379 1132 aa17.14■□□□□ 0.33
PRAME-210ENST00000442481 MYT1Q01538 1121 aa17.14■□□□□ 0.33
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PRAME-210ENST00000442481 GPRASP1Q5JY77 1395 aa17.13■□□□□ 0.33
PRAME-210ENST00000442481 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa17.13■□□□□ 0.33
PRAME-210ENST00000442481 ADGRB2O60241 1585 aa17.11■□□□□ 0.33
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PRAME-210ENST00000442481 CFAP70Q5T0N1 1121 aa17.11■□□□□ 0.33
PRAME-210ENST00000442481 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
PRAME-210ENST00000442481 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa17.1■□□□□ 0.33
PRAME-210ENST00000442481 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP17.1■□□□□ 0.33
PRAME-210ENST00000442481 HRCP23327 699 aa17.09■□□□□ 0.33
PRAME-210ENST00000442481 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.33
PRAME-210ENST00000442481 FAM182BQ5T319 152 aa17.07■□□□□ 0.32
PRAME-210ENST00000442481 STAC3Q96MF2 364 aa17.07■□□□□ 0.32
PRAME-210ENST00000442481 BTG4Q9NY30 223 aa17.07■□□□□ 0.32
PRAME-210ENST00000442481 ALS2Q96Q42 1657 aa17.07■□□□□ 0.32
PRAME-210ENST00000442481 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
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