RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436289.6

NELFE-204, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 5

Gene NELFE, Length 906 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-204ENST00000436289 MYOM2P54296 1465 aa22.98■■□□□ 1.27
NELFE-204ENST00000436289 HFM1A2PYH4 1435 aa22.96■■□□□ 1.27
NELFE-204ENST00000436289 PRAG1Q86YV5 1406 aa22.96■■□□□ 1.27
NELFE-204ENST00000436289 ESCO1Q5FWF5 840 aa22.95■■□□□ 1.26
NELFE-204ENST00000436289 UNC5CLQ8IV45 518 aa22.95■■□□□ 1.26
NELFE-204ENST00000436289 ROBO2Q9HCK4 1378 aa22.95■■□□□ 1.26
NELFE-204ENST00000436289 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa22.93■■□□□ 1.26
NELFE-204ENST00000436289 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa22.93■■□□□ 1.26
NELFE-204ENST00000436289 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa22.92■■□□□ 1.26
NELFE-204ENST00000436289 FOXO3O43524 673 aa22.9■■□□□ 1.26
NELFE-204ENST00000436289 PXDNQ92626 1479 aa22.86■■□□□ 1.25
NELFE-204ENST00000436289 DEFB132Q7Z7B7 95 aa22.86■■□□□ 1.25
NELFE-204ENST00000436289 RALGAPBQ86X10 1494 aa22.85■■□□□ 1.25
NELFE-204ENST00000436289 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
NELFE-204ENST00000436289 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
NELFE-204ENST00000436289 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
NELFE-204ENST00000436289 SLIT2O94813 1529 aa22.84■■□□□ 1.25
NELFE-204ENST00000436289 SEPT12Q8IYM1 358 aa22.83■■□□□ 1.25
NELFE-204ENST00000436289 LRP5O75197 1615 aa22.82■■□□□ 1.24
NELFE-204ENST00000436289 ITGAEP38570 1179 aa22.82■■□□□ 1.24
NELFE-204ENST00000436289 KIF1BO60333 1816 aa22.82■■□□□ 1.24
NELFE-204ENST00000436289 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa22.81■■□□□ 1.24
NELFE-204ENST00000436289 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
NELFE-204ENST00000436289 VPS72Q15906 364 aa22.81■■□□□ 1.24
NELFE-204ENST00000436289 CLTCL1P53675 1640 aa22.81■■□□□ 1.24
NELFE-204ENST00000436289 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa22.81■■□□□ 1.24
NELFE-204ENST00000436289 BAG6P46379 1132 aa22.79■■□□□ 1.24
NELFE-204ENST00000436289 KRT27Q7Z3Y8 459 aa22.79■■□□□ 1.24
NELFE-204ENST00000436289 GLI3P10071 1580 aa22.78■■□□□ 1.24
NELFE-204ENST00000436289 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
NELFE-204ENST00000436289 CCDC144AA2RUR9 1427 aa22.76■■□□□ 1.23
NELFE-204ENST00000436289 PSME1Q06323 249 aa22.76■■□□□ 1.23
NELFE-204ENST00000436289 HRCP23327 699 aa22.75■■□□□ 1.23
NELFE-204ENST00000436289 NAIPQ13075 1403 aa22.74■■□□□ 1.23
NELFE-204ENST00000436289 KRT28Q7Z3Y7 464 aa22.74■■□□□ 1.23
NELFE-204ENST00000436289 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
NELFE-204ENST00000436289 TECPR2O15040 1411 aa22.71■■□□□ 1.23
NELFE-204ENST00000436289 NUTM2FA1L443 756 aa22.7■■□□□ 1.22
NELFE-204ENST00000436289 ABCC11Q96J66 1382 aa22.7■■□□□ 1.22
NELFE-204ENST00000436289 BRWD3Q6RI45 1802 aa22.7■■□□□ 1.22
NELFE-204ENST00000436289 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
NELFE-204ENST00000436289 WAPLQ7Z5K2 1190 aa22.69■■□□□ 1.22
NELFE-204ENST00000436289 USP32Q8NFA0 1604 aa22.68■■□□□ 1.22
NELFE-204ENST00000436289 SIRT1Q96EB6 747 aa22.68■■□□□ 1.22
NELFE-204ENST00000436289 STK26Q9P289 416 aa22.68■■□□□ 1.22
NELFE-204ENST00000436289 KIF1AQ12756 1690 aa22.66■■□□□ 1.22
NELFE-204ENST00000436289 ARHGEF10O15013 1369 aa22.65■■□□□ 1.22
NELFE-204ENST00000436289 PHF8Q9UPP1 1060 aa22.65■■□□□ 1.22
NELFE-204ENST00000436289 NWD2Q9ULI1 1742 aa22.65■■□□□ 1.22
NELFE-204ENST00000436289 TNS3Q68CZ2 1445 aa22.65■■□□□ 1.22
NELFE-204ENST00000436289 SBNO1A3KN83 1393 aa22.64■■□□□ 1.22
NELFE-204ENST00000436289 A0A0G2JS52 829 aa22.64■■□□□ 1.21
NELFE-204ENST00000436289 MYT1Q01538 1121 aa22.64■■□□□ 1.21
NELFE-204ENST00000436289 PPLO60437 1756 aa22.63■■□□□ 1.21
NELFE-204ENST00000436289 FAM83GA6ND36 823 aa22.62■■□□□ 1.21
NELFE-204ENST00000436289 CABLES1Q8TDN4 633 aa22.62■■□□□ 1.21
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NELFE-204ENST00000436289 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa22.62■■□□□ 1.21
NELFE-204ENST00000436289 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa22.6■■□□□ 1.21
NELFE-204ENST00000436289 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
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NELFE-204ENST00000436289 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
NELFE-204ENST00000436289 LMOD2Q6P5Q4 547 aa22.59■■□□□ 1.21
NELFE-204ENST00000436289 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
NELFE-204ENST00000436289 DISP2A7MBM2 1401 aa22.57■■□□□ 1.2
NELFE-204ENST00000436289 FMN2Q9NZ56 1722 aa22.57■■□□□ 1.2
NELFE-204ENST00000436289 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa22.56■■□□□ 1.2
NELFE-204ENST00000436289 TMEM132EQ6IEE7 984 aa22.56■■□□□ 1.2
NELFE-204ENST00000436289 BTG4Q9NY30 223 aa22.55■■□□□ 1.2
NELFE-204ENST00000436289 PLCH1Q4KWH8 1693 aa22.55■■□□□ 1.2
NELFE-204ENST00000436289 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
NELFE-204ENST00000436289 NRXN1Q9ULB1 1477 aa22.54■■□□□ 1.2
NELFE-204ENST00000436289 RGL3Q3MIN7 710 aa22.53■■□□□ 1.2
NELFE-204ENST00000436289 KNDC1Q76NI1 1749 aa22.53■■□□□ 1.2
NELFE-204ENST00000436289 YY1P25490 414 aa22.52■■□□□ 1.2
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NELFE-204ENST00000436289 RGPD1P0DJD0 1748 aa22.51■■□□□ 1.19
NELFE-204ENST00000436289 PLEKHG5O94827 1062 aa22.51■■□□□ 1.19
NELFE-204ENST00000436289 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa22.51■■□□□ 1.19
NELFE-204ENST00000436289 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa22.51■■□□□ 1.19
NELFE-204ENST00000436289 FAM196AQ6ZSG2 479 aa22.5■■□□□ 1.19
NELFE-204ENST00000436289 DCAF8L1A6NGE4 600 aa22.49■■□□□ 1.19
NELFE-204ENST00000436289 CAMKK2Q96RR4 588 aa22.49■■□□□ 1.19
NELFE-204ENST00000436289 PIK3C2GO75747 1445 aa22.48■■□□□ 1.19
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NELFE-204ENST00000436289 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
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NELFE-204ENST00000436289 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa22.47■■□□□ 1.19
NELFE-204ENST00000436289 ANKARQ7Z5J8 1434 aa22.47■■□□□ 1.19
NELFE-204ENST00000436289 GPRASP1Q5JY77 1395 aa22.46■■□□□ 1.19
NELFE-204ENST00000436289 NBPF8Q3BBV2 869 aa22.45■■□□□ 1.18
NELFE-204ENST00000436289 NBPF14Q5TI25 921 aa22.45■■□□□ 1.18
NELFE-204ENST00000436289 FAM182BQ5T319 152 aa22.44■■□□□ 1.18
NELFE-204ENST00000436289 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa22.44■■□□□ 1.18
NELFE-204ENST00000436289 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
NELFE-204ENST00000436289 ABCA3Q99758 1704 aa22.43■■□□□ 1.18
NELFE-204ENST00000436289 NRAPQ86VF7 1730 aa22.43■■□□□ 1.18
NELFE-204ENST00000436289 TRIM37O94972 964 aa22.42■■□□□ 1.18
NELFE-204ENST00000436289 APBA3O96018 575 aa22.42■■□□□ 1.18
NELFE-204ENST00000436289 PRAM1Q96QH2 718 aa22.42■■□□□ 1.18
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