RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428101.6

LMO1-202, Transcript of LIM domain only 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO1, Length 1,038 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1-202ENST00000428101 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP40.19■■■■■ 4.02
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LMO1-202ENST00000428101 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP40.18■■■■■ 4.02
LMO1-202ENST00000428101 HRCP23327 699 aa40.18■■■■■ 4.02
LMO1-202ENST00000428101 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP40.18■■■■■ 4.02
LMO1-202ENST00000428101 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP40.16■■■■■ 4.02
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LMO1-202ENST00000428101 DCAF11Q8TEB1 546 aa39.94■■■■□ 3.98
LMO1-202ENST00000428101 C8orf37Q96NL8 207 aa39.94■■■■□ 3.98
LMO1-202ENST00000428101 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa39.94■■■■□ 3.98
LMO1-202ENST00000428101 ADGRB1O14514 1584 aa39.93■■■■□ 3.98
LMO1-202ENST00000428101 PRAM1Q96QH2 718 aa39.92■■■■□ 3.98
LMO1-202ENST00000428101 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP39.91■■■■□ 3.98
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LMO1-202ENST00000428101 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP39.9■■■■□ 3.98
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LMO1-202ENST00000428101 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa39.73■■■■□ 3.95
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LMO1-202ENST00000428101 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP39.71■■■■□ 3.95
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LMO1-202ENST00000428101 USP21Q9UK80 565 aa39.69■■■■□ 3.94
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LMO1-202ENST00000428101 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP39.66■■■■□ 3.94
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LMO1-202ENST00000428101 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP39.48■■■■□ 3.91
LMO1-202ENST00000428101 ARHGEF10O15013 1369 aa39.47■■■■□ 3.91
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LMO1-202ENST00000428101 FAM83GA6ND36 823 aa39.3■■■■□ 3.88
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LMO1-202ENST00000428101 ATAD2Q6PL18 1390 aa39.3■■■■□ 3.88
LMO1-202ENST00000428101 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa39.29■■■■□ 3.88
LMO1-202ENST00000428101 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP39.26■■■■□ 3.88
LMO1-202ENST00000428101 NEUROD1Q13562 356 aa39.26■■■■□ 3.88
LMO1-202ENST00000428101 CCDC61Q9Y6R9 512 aa39.26■■■■□ 3.88
LMO1-202ENST00000428101 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP39.25■■■■□ 3.87
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