RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426895.8

TTLL3-209, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 2 BASIC

Gene TTLL3, Length 2,767 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3-209ENST00000426895 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa23.56■■□□□ 1.36
TTLL3-209ENST00000426895 NINLQ9Y2I6 1382 aa23.56■■□□□ 1.36
TTLL3-209ENST00000426895 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
TTLL3-209ENST00000426895 VSIG10Q8N0Z9 540 aa23.54■■□□□ 1.36
TTLL3-209ENST00000426895 C22orf23Q9BZE7 217 aa23.54■■□□□ 1.36
TTLL3-209ENST00000426895 PKNOX2Q96KN3 472 aa23.53■■□□□ 1.36
TTLL3-209ENST00000426895 CHMP5Q9NZZ3 219 aa23.53■■□□□ 1.36
TTLL3-209ENST00000426895 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
TTLL3-209ENST00000426895 IQGAP3Q86VI3 1631 aa23.52■■□□□ 1.36
TTLL3-209ENST00000426895 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa23.52■■□□□ 1.36
TTLL3-209ENST00000426895 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.35
TTLL3-209ENST00000426895 MADDQ8WXG6 1647 aa23.51■■□□□ 1.35
TTLL3-209ENST00000426895 IQGAP1P46940 1657 aa23.51■■□□□ 1.35
TTLL3-209ENST00000426895 ATP7AQ04656 1500 aa23.51■■□□□ 1.35
TTLL3-209ENST00000426895 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
TTLL3-209ENST00000426895 MYOM1P52179 1685 aa23.51■■□□□ 1.35
TTLL3-209ENST00000426895 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa23.5■■□□□ 1.35
TTLL3-209ENST00000426895 TCP11L2Q8N4U5 519 aa23.5■■□□□ 1.35
TTLL3-209ENST00000426895 MRE11P49959 708 aa23.49■■□□□ 1.35
TTLL3-209ENST00000426895 GRPEL1Q9HAV7 217 aa23.49■■□□□ 1.35
TTLL3-209ENST00000426895 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa23.49■■□□□ 1.35
TTLL3-209ENST00000426895 ERBB4Q15303 1308 aa23.49■■□□□ 1.35
TTLL3-209ENST00000426895 ATP10AO60312 1499 aa23.48■■□□□ 1.35
TTLL3-209ENST00000426895 MYH16Q9H6N6 1097 aa23.48■■□□□ 1.35
TTLL3-209ENST00000426895 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
TTLL3-209ENST00000426895 CFAP70Q5T0N1 1121 aa23.46■■□□□ 1.35
TTLL3-209ENST00000426895 NGEFQ8N5V2 710 aa23.46■■□□□ 1.35
TTLL3-209ENST00000426895 HSCBQ8IWL3 235 aa23.45■■□□□ 1.34
TTLL3-209ENST00000426895 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
TTLL3-209ENST00000426895 KIF3BO15066 747 aa23.44■■□□□ 1.34
TTLL3-209ENST00000426895 RUNDC1Q96C34 613 aa23.44■■□□□ 1.34
TTLL3-209ENST00000426895 ESPNB1AK53 854 aa23.43■■□□□ 1.34
TTLL3-209ENST00000426895 MVPQ14764 893 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
TTLL3-209ENST00000426895 ZMYND15Q9H091 742 aa23.43■■□□□ 1.34
TTLL3-209ENST00000426895 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa23.43■■□□□ 1.34
TTLL3-209ENST00000426895 MORC1Q86VD1 984 aa23.43■■□□□ 1.34
TTLL3-209ENST00000426895 RAPGEF3O95398 923 aa23.42■■□□□ 1.34
TTLL3-209ENST00000426895 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa23.41■■□□□ 1.34
TTLL3-209ENST00000426895 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
TTLL3-209ENST00000426895 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
TTLL3-209ENST00000426895 ERVK-7P63135 1459 aa23.4■■□□□ 1.34
TTLL3-209ENST00000426895 DDX11L8A8MPP1 907 aa23.4■■□□□ 1.34
TTLL3-209ENST00000426895 GAS2L3Q86XJ1 694 aa23.4■■□□□ 1.34
TTLL3-209ENST00000426895 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
TTLL3-209ENST00000426895 FOXD4L1Q9NU39 408 aa23.39■■□□□ 1.34
TTLL3-209ENST00000426895 AAMPQ13685 434 aa23.39■■□□□ 1.33
TTLL3-209ENST00000426895 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
TTLL3-209ENST00000426895 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
TTLL3-209ENST00000426895 RRP9O43818 475 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
TTLL3-209ENST00000426895 ZMYM3Q14202 1370 aa23.38■■□□□ 1.33
TTLL3-209ENST00000426895 CFAP74Q9C0B2 1584 aa23.38■■□□□ 1.33
TTLL3-209ENST00000426895 FAM69CQ0P6D2 419 aa23.38■■□□□ 1.33
TTLL3-209ENST00000426895 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
TTLL3-209ENST00000426895 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa23.37■■□□□ 1.33
TTLL3-209ENST00000426895 POGZQ7Z3K3 1410 aa23.37■■□□□ 1.33
TTLL3-209ENST00000426895 ITPRIPQ8IWB1 547 aa23.36■■□□□ 1.33
TTLL3-209ENST00000426895 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
TTLL3-209ENST00000426895 TSPOAP1O95153 1857 aa23.36■■□□□ 1.33
TTLL3-209ENST00000426895 WDR63Q8IWG1 891 aa23.35■■□□□ 1.33
TTLL3-209ENST00000426895 NSD3Q9BZ95 1437 aa23.35■■□□□ 1.33
TTLL3-209ENST00000426895 CEP152O94986 1710 aa23.35■■□□□ 1.33
TTLL3-209ENST00000426895 MTHFSP49914 203 aa23.35■■□□□ 1.33
TTLL3-209ENST00000426895 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa23.34■■□□□ 1.33
TTLL3-209ENST00000426895 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa23.34■■□□□ 1.33
TTLL3-209ENST00000426895 SMC4Q9NTJ3 1288 aa23.34■■□□□ 1.33
TTLL3-209ENST00000426895 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
TTLL3-209ENST00000426895 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa23.34■■□□□ 1.33
TTLL3-209ENST00000426895 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa23.32■■□□□ 1.32
TTLL3-209ENST00000426895 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
TTLL3-209ENST00000426895 IQSEC2Q5JU85 1478 aa23.32■■□□□ 1.32
TTLL3-209ENST00000426895 DEPDC5O75140 1603 aa23.32■■□□□ 1.32
TTLL3-209ENST00000426895 TRIM27P14373 513 aa23.31■■□□□ 1.32
TTLL3-209ENST00000426895 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
TTLL3-209ENST00000426895 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP23.3■■□□□ 1.32
TTLL3-209ENST00000426895 CLTCL1P53675 1640 aa23.3■■□□□ 1.32
TTLL3-209ENST00000426895 NEO1Q92859 1461 aa23.29■■□□□ 1.32
TTLL3-209ENST00000426895 LNPKQ9C0E8 428 aa23.29■■□□□ 1.32
TTLL3-209ENST00000426895 HECW2Q9P2P5 1572 aa23.29■■□□□ 1.32
TTLL3-209ENST00000426895 DDIT3P35638 169 aa23.29■■□□□ 1.32
TTLL3-209ENST00000426895 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
TTLL3-209ENST00000426895 SHPRHQ149N8 1683 aa23.28■■□□□ 1.32
TTLL3-209ENST00000426895 TRPM2O94759 1503 aa23.28■■□□□ 1.32
TTLL3-209ENST00000426895 KANK1Q14678 1352 aa23.27■■□□□ 1.32
TTLL3-209ENST00000426895 DIP2BQ9P265 1576 aa23.27■■□□□ 1.32
TTLL3-209ENST00000426895 GGT6Q6P531 493 aa23.27■■□□□ 1.32
TTLL3-209ENST00000426895 TRAK1Q9UPV9 953 aa23.27■■□□□ 1.32
TTLL3-209ENST00000426895 MROH1Q8NDA8 1641 aa23.27■■□□□ 1.32
TTLL3-209ENST00000426895 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
TTLL3-209ENST00000426895 ABCA6Q8N139 1617 aa23.26■■□□□ 1.31
TTLL3-209ENST00000426895 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
TTLL3-209ENST00000426895 SSH1Q8WYL5 1049 aa23.26■■□□□ 1.31
TTLL3-209ENST00000426895 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
TTLL3-209ENST00000426895 GBP4Q96PP9 640 aa23.25■■□□□ 1.31
TTLL3-209ENST00000426895 MLH3Q9UHC1 1453 aa23.25■■□□□ 1.31
TTLL3-209ENST00000426895 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa23.24■■□□□ 1.31
TTLL3-209ENST00000426895 TMEM57Q8N5G2 664 aa23.24■■□□□ 1.31
TTLL3-209ENST00000426895 CFAP53Q96M91 514 aa23.24■■□□□ 1.31
TTLL3-209ENST00000426895 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
TTLL3-209ENST00000426895 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa23.24■■□□□ 1.31
TTLL3-209ENST00000426895 STAC3Q96MF2 364 aa23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.5 ms