RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCDC136Q96JN2 1154 aa24.77■■□□□ 1.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 STK26Q9P289 416 aa24.77■■□□□ 1.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa24.77■■□□□ 1.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MORC1Q86VD1 984 aa24.76■■□□□ 1.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 STAG3Q9UJ98 1225 aa24.76■■□□□ 1.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 A2ML1A8K2U0 1454 aa24.75■■□□□ 1.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP24.75■■□□□ 1.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CGNL1Q0VF96 1302 aa24.74■■□□□ 1.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CABP2Q9NPB3 220 aa24.74■■□□□ 1.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SHPRHQ149N8 1683 aa24.73■■□□□ 1.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MLECQ14165 292 aa24.73■■□□□ 1.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCDC146Q8IYE0 955 aa24.73■■□□□ 1.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NINLQ9Y2I6 1382 aa24.71■■□□□ 1.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GOLGA2Q08379 1002 aa24.7■■□□□ 1.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NSD2O96028 1365 aa24.7■■□□□ 1.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DUSP27Q5VZP5 1158 aa24.7■■□□□ 1.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRAM1Q96QH2 718 aa24.7■■□□□ 1.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EXOC6Q8TAG9 804 aa24.69■■□□□ 1.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 APAF1O14727 1248 aa24.68■■□□□ 1.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RIMS2Q9UQ26 1411 aa24.68■■□□□ 1.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 POGKQ9P215 609 aa24.66■■□□□ 1.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 A0A1W2PP64 1363 aa24.66■■□□□ 1.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ATAD2Q6PL18 1390 aa24.66■■□□□ 1.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLFN5Q08AF3 891 aa24.64■■□□□ 1.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NGEFQ8N5V2 710 aa24.64■■□□□ 1.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ABCC11Q96J66 1382 aa24.64■■□□□ 1.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DLC1Q96QB1 1528 aa24.63■■□□□ 1.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PLIN1O60240 522 aa24.63■■□□□ 1.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZMYM3Q14202 1370 aa24.63■■□□□ 1.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MTHFSP49914 203 aa24.61■■□□□ 1.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CD163L1Q9NR16 1453 aa24.6■■□□□ 1.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa24.6■■□□□ 1.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa24.58■■□□□ 1.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CFAP53Q96M91 514 aa24.58■■□□□ 1.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ANP32EQ9BTT0 268 aa24.57■■□□□ 1.52
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TERF2IPQ9NYB0 399 aa24.57■■□□□ 1.52
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IQSEC2Q5JU85 1478 aa24.56■■□□□ 1.52
NUP50-AS1-201ENST00000426282 E9PSI1 815 aa24.55■■□□□ 1.52
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CDK19Q9BWU1 502 aa24.55■■□□□ 1.52
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MED14O60244 1454 aa24.54■■□□□ 1.52
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CRBNQ96SW2 442 aa24.54■■□□□ 1.52
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FANCIQ9NVI1 1328 aa24.54■■□□□ 1.52
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP24.54■■□□□ 1.52
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RUNDC1Q96C34 613 aa24.54■■□□□ 1.52
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NLRP1Q9C000 1473 aa24.53■■□□□ 1.52
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DMRT2Q9Y5R5 561 aa24.52■■□□□ 1.52
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TNRQ92752 1358 aa24.52■■□□□ 1.52
NUP50-AS1-201ENST00000426282 WWC1Q8IX03 1113 aa24.52■■□□□ 1.52
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C20orf194Q5TEA3 1177 aa24.51■■□□□ 1.51
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GGNBP2Q9H3C7 697 aa24.51■■□□□ 1.51
NUP50-AS1-201ENST00000426282 WAPLQ7Z5K2 1190 aa24.5■■□□□ 1.51
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KIF20BQ96Q89 1820 aa24.5■■□□□ 1.51
NUP50-AS1-201ENST00000426282 UBR1Q8IWV7 1749 aa24.49■■□□□ 1.51
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FYB1O15117 783 aa24.49■■□□□ 1.51
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
NUP50-AS1-201ENST00000426282 METP08581 1390 aa24.48■■□□□ 1.51
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TCP11L2Q8N4U5 519 aa24.48■■□□□ 1.51
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CABP1Q9NZU7 370 aa24.48■■□□□ 1.51
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KNDC1Q76NI1 1749 aa24.48■■□□□ 1.51
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ATP7BP35670 1465 aa24.46■■□□□ 1.51
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
NUP50-AS1-201ENST00000426282 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HDGFP51858 240 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ADGRB2O60241 1585 aa24.44■■□□□ 1.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NEUROD2Q15784 382 aa24.44■■□□□ 1.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TECPR2O15040 1411 aa24.43■■□□□ 1.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM2Q9UHN6 1383 aa24.43■■□□□ 1.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP24.43■■□□□ 1.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCDC27Q2M243 656 aa24.41■■□□□ 1.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CPS1P31327 1500 aa24.41■■□□□ 1.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM135BQ49AJ0 1406 aa24.41■■□□□ 1.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MSH5O43196 834 aa24.39■■□□□ 1.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 WDR63Q8IWG1 891 aa24.39■■□□□ 1.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 WASLO00401 505 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TXNDC2Q86VQ3 553 aa24.39■■□□□ 1.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BCAR3O75815 825 aa24.38■■□□□ 1.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SIRT1Q96EB6 747 aa24.38■■□□□ 1.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa24.36■■□□□ 1.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PNPLA6Q8IY17 1366 aa24.36■■□□□ 1.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa24.34■■□□□ 1.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP24.34■■□□□ 1.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PLEKHF1Q96S99 279 aa24.33■■□□□ 1.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.3 ms