RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412318.5

ANKRD28-202, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 4,408 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-202ENST00000412318 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
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ANKRD28-202ENST00000412318 DAPK1P53355 1430 aa5.55□□□□□ -1.52
ANKRD28-202ENST00000412318 NLRP13Q86W25 1043 aa5.55□□□□□ -1.52
ANKRD28-202ENST00000412318 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa5.55□□□□□ -1.52
ANKRD28-202ENST00000412318 ABCA8O94911 1581 aa5.55□□□□□ -1.52
ANKRD28-202ENST00000412318 PLCH2O75038 1416 aa5.55□□□□□ -1.52
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ANKRD28-202ENST00000412318 STRN4Q9NRL3 753 aa5.54□□□□□ -1.52
ANKRD28-202ENST00000412318 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
ANKRD28-202ENST00000412318 G3V3G9 751 aa5.54□□□□□ -1.52
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ANKRD28-202ENST00000412318 HDAC5Q9UQL6 1122 aa5.54□□□□□ -1.52
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ANKRD28-202ENST00000412318 TNRQ92752 1358 aa5.54□□□□□ -1.52
ANKRD28-202ENST00000412318 IDI1Q13907 227 aa5.54□□□□□ -1.52
ANKRD28-202ENST00000412318 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
ANKRD28-202ENST00000412318 USP47Q96K76 1375 aa5.54□□□□□ -1.52
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
ANKRD28-202ENST00000412318 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
ANKRD28-202ENST00000412318 SYNMO15061 1565 aa5.53□□□□□ -1.52
ANKRD28-202ENST00000412318 TIAM1Q13009 1591 aa5.53□□□□□ -1.52
ANKRD28-202ENST00000412318 HSPA1LP34931 641 aa5.53□□□□□ -1.52
ANKRD28-202ENST00000412318 STK11IPQ8N1F8 1099 aa5.53□□□□□ -1.52
ANKRD28-202ENST00000412318 AGLP35573 1532 aa5.53□□□□□ -1.52
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ANKRD28-202ENST00000412318 CADPS2Q86UW7 1296 aa5.53□□□□□ -1.52
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ANKRD28-202ENST00000412318 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa5.53□□□□□ -1.52
ANKRD28-202ENST00000412318 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa5.52□□□□□ -1.53
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa5.52□□□□□ -1.53
ANKRD28-202ENST00000412318 TPRNQ4KMQ1 711 aa5.52□□□□□ -1.53
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ANKRD28-202ENST00000412318 LRP5O75197 1615 aa5.52□□□□□ -1.53
ANKRD28-202ENST00000412318 TAF7LQ5H9L4 462 aa5.52□□□□□ -1.53
ANKRD28-202ENST00000412318 KLHL34Q8N239 644 aa5.52□□□□□ -1.53
ANKRD28-202ENST00000412318 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa5.52□□□□□ -1.53
ANKRD28-202ENST00000412318 CNTLNQ9NXG0 1405 aa5.52□□□□□ -1.53
ANKRD28-202ENST00000412318 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa5.52□□□□□ -1.53
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ANKRD28-202ENST00000412318 ROCK1Q13464 1354 aa5.52□□□□□ -1.53
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ANKRD28-202ENST00000412318 PDE3BQ13370 1112 aa5.51□□□□□ -1.53
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ANKRD28-202ENST00000412318 CDK19Q9BWU1 502 aa5.51□□□□□ -1.53
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ANKRD28-202ENST00000412318 PLCB2Q00722 1185 aa5.51□□□□□ -1.53
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ANKRD28-202ENST00000412318 FAM135AQ9P2D6 1515 aa5.51□□□□□ -1.53
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ANKRD28-202ENST00000412318 NGLY1Q96IV0 654 aa5.51□□□□□ -1.53
ANKRD28-202ENST00000412318 GGNBP2Q9H3C7 697 aa5.51□□□□□ -1.53
ANKRD28-202ENST00000412318 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa5.51□□□□□ -1.53
ANKRD28-202ENST00000412318 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa5.5□□□□□ -1.53
ANKRD28-202ENST00000412318 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP5.5□□□□□ -1.537e-13■□□□□ 10.3
ANKRD28-202ENST00000412318 CHMP3Q9Y3E7 222 aa5.5□□□□□ -1.53
ANKRD28-202ENST00000412318 MSH6P52701 1360 aa5.5□□□□□ -1.53
ANKRD28-202ENST00000412318 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
ANKRD28-202ENST00000412318 CASC1Q6TDU7 716 aa5.5□□□□□ -1.53
ANKRD28-202ENST00000412318 MAP7D2Q96T17 732 aa5.5□□□□□ -1.53
ANKRD28-202ENST00000412318 CCDC61Q9Y6R9 512 aa5.5□□□□□ -1.53
ANKRD28-202ENST00000412318 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa5.5□□□□□ -1.53
ANKRD28-202ENST00000412318 A2MP01023 1474 aa5.5□□□□□ -1.53
ANKRD28-202ENST00000412318 ALKQ9UM73 1620 aa5.5□□□□□ -1.53
ANKRD28-202ENST00000412318 ATP10AO60312 1499 aa5.5□□□□□ -1.53
ANKRD28-202ENST00000412318 ADAMTS2O95450 1211 aa5.49□□□□□ -1.53
ANKRD28-202ENST00000412318 TATP17735 454 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
ANKRD28-202ENST00000412318 CABP1Q9NZU7 370 aa5.49□□□□□ -1.53
ANKRD28-202ENST00000412318 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
ANKRD28-202ENST00000412318 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
ANKRD28-202ENST00000412318 CCER2I3L3R5 266 aa5.49□□□□□ -1.53
ANKRD28-202ENST00000412318 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
ANKRD28-202ENST00000412318 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
ANKRD28-202ENST00000412318 ABCC5O15440 1437 aa5.49□□□□□ -1.53
ANKRD28-202ENST00000412318 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa5.49□□□□□ -1.53
ANKRD28-202ENST00000412318 FOXO3O43524 673 aa5.49□□□□□ -1.53
ANKRD28-202ENST00000412318 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
ANKRD28-202ENST00000412318 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
ANKRD28-202ENST00000412318 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
ANKRD28-202ENST00000412318 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
ANKRD28-202ENST00000412318 GORABQ5T7V8 394 aa5.49□□□□□ -1.53
ANKRD28-202ENST00000412318 PHF8Q9UPP1 1060 aa5.49□□□□□ -1.53
ANKRD28-202ENST00000412318 WASHC2AQ641Q2 1341 aa5.48□□□□□ -1.53
ANKRD28-202ENST00000412318 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
ANKRD28-202ENST00000412318 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
ANKRD28-202ENST00000412318 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
ANKRD28-202ENST00000412318 KCNH5Q8NCM2 988 aa5.48□□□□□ -1.53
ANKRD28-202ENST00000412318 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
ANKRD28-202ENST00000412318 PPP4R2Q9NY27 417 aa5.48□□□□□ -1.53
ANKRD28-202ENST00000412318 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
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