RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400183.6

USP25-204, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 5,341 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-204ENST00000400183 NLRP2Q9NX02 1062 aa22.4■■□□□ 1.18
USP25-204ENST00000400183 CDC45O75419 566 aa22.4■■□□□ 1.18
USP25-204ENST00000400183 ATF3P18847 181 aa22.4■■□□□ 1.18
USP25-204ENST00000400183 PANK1Q8TE04 598 aa22.39■■□□□ 1.18
USP25-204ENST00000400183 WWC1Q8IX03 1113 aa22.39■■□□□ 1.18
USP25-204ENST00000400183 CABP2Q9NPB3 220 aa22.39■■□□□ 1.17
USP25-204ENST00000400183 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.38■■□□□ 1.17
USP25-204ENST00000400183 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
USP25-204ENST00000400183 NFKBIBQ15653 356 aa22.38■■□□□ 1.17
USP25-204ENST00000400183 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
USP25-204ENST00000400183 FBXW7Q969H0 707 aa22.38■■□□□ 1.17
USP25-204ENST00000400183 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
USP25-204ENST00000400183 WASHC4Q2M389 1173 aa22.37■■□□□ 1.17
USP25-204ENST00000400183 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.37■■□□□ 1.17
USP25-204ENST00000400183 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
USP25-204ENST00000400183 NLRP6P59044 892 aa22.37■■□□□ 1.17
USP25-204ENST00000400183 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
USP25-204ENST00000400183 MTHFSP49914 203 aa22.36■■□□□ 1.17
USP25-204ENST00000400183 SETQ01105 290 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
USP25-204ENST00000400183 GNAI3P08754 354 aa22.35■■□□□ 1.17
USP25-204ENST00000400183 TMEM132EQ6IEE7 984 aa22.35■■□□□ 1.17
USP25-204ENST00000400183 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
USP25-204ENST00000400183 ADAMTS8Q9UP79 889 aa22.34■■□□□ 1.17
USP25-204ENST00000400183 NINLQ9Y2I6 1382 aa22.34■■□□□ 1.17
USP25-204ENST00000400183 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
USP25-204ENST00000400183 TCP11L2Q8N4U5 519 aa22.33■■□□□ 1.17
USP25-204ENST00000400183 FAM13BQ9NYF5 915 aa22.33■■□□□ 1.17
USP25-204ENST00000400183 PSMA5P28066 241 aa22.33■■□□□ 1.16
USP25-204ENST00000400183 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
USP25-204ENST00000400183 CNTROBQ8N137 903 aa22.32■■□□□ 1.16
USP25-204ENST00000400183 FOSBP53539 338 aa22.32■■□□□ 1.16
USP25-204ENST00000400183 GAS2L2Q8NHY3 880 aa22.32■■□□□ 1.16
USP25-204ENST00000400183 CCDC30Q5VVM6 783 aa22.31■■□□□ 1.16
USP25-204ENST00000400183 NUTM2GQ5VZR2 741 aa22.31■■□□□ 1.16
USP25-204ENST00000400183 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
USP25-204ENST00000400183 FSD1Q9BTV5 496 aa22.3■■□□□ 1.16
USP25-204ENST00000400183 IL27Q8NEV9 243 aa22.3■■□□□ 1.16
USP25-204ENST00000400183 BRMS1Q9HCU9 246 aa22.3■■□□□ 1.16
USP25-204ENST00000400183 XBP1P17861 261 aa22.29■■□□□ 1.16
USP25-204ENST00000400183 SURF6O75683 361 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
USP25-204ENST00000400183 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
USP25-204ENST00000400183 CCDC27Q2M243 656 aa22.28■■□□□ 1.16
USP25-204ENST00000400183 FAM43AQ8N2R8 423 aa22.28■■□□□ 1.16
USP25-204ENST00000400183 BRPF3Q9ULD4 1205 aa22.28■■□□□ 1.16
USP25-204ENST00000400183 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.28■■□□□ 1.16
USP25-204ENST00000400183 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
USP25-204ENST00000400183 CFAP70Q5T0N1 1121 aa22.27■■□□□ 1.16
USP25-204ENST00000400183 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
USP25-204ENST00000400183 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.27■■□□□ 1.16
USP25-204ENST00000400183 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.27■■□□□ 1.16
USP25-204ENST00000400183 GPRASP1Q5JY77 1395 aa22.27■■□□□ 1.16
USP25-204ENST00000400183 SDF4Q9BRK5 362 aa22.27■■□□□ 1.15
USP25-204ENST00000400183 IFT57Q9NWB7 429 aa22.26■■□□□ 1.15
USP25-204ENST00000400183 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.26■■□□□ 1.15
USP25-204ENST00000400183 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa22.26■■□□□ 1.15
USP25-204ENST00000400183 PRKAR2BP31323 418 aa22.25■■□□□ 1.15
USP25-204ENST00000400183 TEX35Q5T0J7 233 aa22.25■■□□□ 1.15
USP25-204ENST00000400183 OLFM4Q6UX06 510 aa22.25■■□□□ 1.15
USP25-204ENST00000400183 FYB1O15117 783 aa22.25■■□□□ 1.15
USP25-204ENST00000400183 PPP2R1AP30153 589 aa22.25■■□□□ 1.15
USP25-204ENST00000400183 SART3Q15020 963 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
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USP25-204ENST00000400183 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
USP25-204ENST00000400183 ABTB2Q8N961 1025 aa22.24■■□□□ 1.15
USP25-204ENST00000400183 MNS1Q8NEH6 495 aa22.24■■□□□ 1.15
USP25-204ENST00000400183 NCOA2Q15596 1464 aa22.24■■□□□ 1.15
USP25-204ENST00000400183 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
USP25-204ENST00000400183 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
USP25-204ENST00000400183 HIP1O00291 1037 aa22.22■■□□□ 1.15
USP25-204ENST00000400183 AFAP1Q8N556 730 aa22.22■■□□□ 1.15
USP25-204ENST00000400183 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
USP25-204ENST00000400183 MCM2P49736 904 aa22.22■■□□□ 1.15
USP25-204ENST00000400183 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
USP25-204ENST00000400183 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
USP25-204ENST00000400183 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.22■■□□□ 1.15
USP25-204ENST00000400183 MRE11P49959 708 aa22.21■■□□□ 1.15
USP25-204ENST00000400183 CDCA7LQ96GN5 454 aa22.21■■□□□ 1.15
USP25-204ENST00000400183 PDCP20941 246 aa22.21■■□□□ 1.15
USP25-204ENST00000400183 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
USP25-204ENST00000400183 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
USP25-204ENST00000400183 OFD1O75665 1012 aa22.2■■□□□ 1.14
USP25-204ENST00000400183 ERC1Q8IUD2 1116 aa22.2■■□□□ 1.14
USP25-204ENST00000400183 CDR1P51861 262 aa22.2■■□□□ 1.14
USP25-204ENST00000400183 NEK4P51957 841 aa22.2■■□□□ 1.14
USP25-204ENST00000400183 GCC1Q96CN9 775 aa22.2■■□□□ 1.14
USP25-204ENST00000400183 RUFY1Q96T51 708 aa22.2■■□□□ 1.14
USP25-204ENST00000400183 MBD3O95983 291 aa22.2■■□□□ 1.14
USP25-204ENST00000400183 PDE3AQ14432 1141 aa22.2■■□□□ 1.14
USP25-204ENST00000400183 NASPP49321 788 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
USP25-204ENST00000400183 ACBD3Q9H3P7 528 aa22.19■■□□□ 1.14
USP25-204ENST00000400183 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
USP25-204ENST00000400183 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.19■■□□□ 1.14
USP25-204ENST00000400183 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa22.18■■□□□ 1.14
USP25-204ENST00000400183 KIF21BO75037 1637 aa22.18■■□□□ 1.14
USP25-204ENST00000400183 GNAI2P04899 355 aa22.18■■□□□ 1.14
USP25-204ENST00000400183 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.18■■□□□ 1.14
USP25-204ENST00000400183 RABEP1Q15276 862 aa22.18■■□□□ 1.14
USP25-204ENST00000400183 TXNDC2Q86VQ3 553 aa22.18■■□□□ 1.14
USP25-204ENST00000400183 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
USP25-204ENST00000400183 CCDC39Q9UFE4 941 aa22.17■■□□□ 1.14
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