RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390935.1

RNA5SP18-201, Transcript of RNA, 5S ribosomal pseudogene 18, humanhuman

BASIC

Gene RNA5SP18, Length 121 nt, Biotype rRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNA5SP18-201ENST00000390935 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
RNA5SP18-201ENST00000390935 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
RNA5SP18-201ENST00000390935 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa11.39□□□□□ -0.59
RNA5SP18-201ENST00000390935 MYOM2P54296 1465 aa11.38□□□□□ -0.59
RNA5SP18-201ENST00000390935 KNDC1Q76NI1 1749 aa11.38□□□□□ -0.59
RNA5SP18-201ENST00000390935 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
RNA5SP18-201ENST00000390935 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
RNA5SP18-201ENST00000390935 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
RNA5SP18-201ENST00000390935 NUTM2FA1L443 756 aa11.37□□□□□ -0.59
RNA5SP18-201ENST00000390935 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
RNA5SP18-201ENST00000390935 DCAF11Q8TEB1 546 aa11.37□□□□□ -0.59
RNA5SP18-201ENST00000390935 ESCO1Q5FWF5 840 aa11.36□□□□□ -0.59
RNA5SP18-201ENST00000390935 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
RNA5SP18-201ENST00000390935 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa11.36□□□□□ -0.59
RNA5SP18-201ENST00000390935 LAMC1P11047 1609 aa11.35□□□□□ -0.59
RNA5SP18-201ENST00000390935 SIRT1Q96EB6 747 aa11.35□□□□□ -0.59
RNA5SP18-201ENST00000390935 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
RNA5SP18-201ENST00000390935 PNPLA6Q8IY17 1366 aa11.34□□□□□ -0.59
RNA5SP18-201ENST00000390935 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP11.34□□□□□ -0.59
RNA5SP18-201ENST00000390935 PRAM1Q96QH2 718 aa11.34□□□□□ -0.59
RNA5SP18-201ENST00000390935 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.59
RNA5SP18-201ENST00000390935 FOXO3O43524 673 aa11.33□□□□□ -0.6
RNA5SP18-201ENST00000390935 FMN2Q9NZ56 1722 aa11.32□□□□□ -0.6
RNA5SP18-201ENST00000390935 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
RNA5SP18-201ENST00000390935 TRAK1Q9UPV9 953 aa11.32□□□□□ -0.6
RNA5SP18-201ENST00000390935 ADGRB1O14514 1584 aa11.32□□□□□ -0.6
RNA5SP18-201ENST00000390935 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
RNA5SP18-201ENST00000390935 POGKQ9P215 609 aa11.31□□□□□ -0.6
RNA5SP18-201ENST00000390935 NPHP3Q7Z494 1330 aa11.31□□□□□ -0.6
RNA5SP18-201ENST00000390935 ADAMTS2O95450 1211 aa11.3□□□□□ -0.6
RNA5SP18-201ENST00000390935 STAC3Q96MF2 364 aa11.3□□□□□ -0.6
RNA5SP18-201ENST00000390935 C8orf37Q96NL8 207 aa11.3□□□□□ -0.6
RNA5SP18-201ENST00000390935 PXDNQ92626 1479 aa11.3□□□□□ -0.6
RNA5SP18-201ENST00000390935 AFF2P51816 1311 aa11.3□□□□□ -0.6
RNA5SP18-201ENST00000390935 DLC1Q96QB1 1528 aa11.3□□□□□ -0.6
RNA5SP18-201ENST00000390935 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
RNA5SP18-201ENST00000390935 NGLY1Q96IV0 654 aa11.27□□□□□ -0.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 PHF8Q9UPP1 1060 aa11.27□□□□□ -0.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 RXRBP28702 533 aa11.26□□□□□ -0.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 KRT28Q7Z3Y7 464 aa11.26□□□□□ -0.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 USP32Q8NFA0 1604 aa11.26□□□□□ -0.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 KIF1AQ12756 1690 aa11.26□□□□□ -0.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa11.25□□□□□ -0.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 SIN3AQ96ST3 1273 aa11.25□□□□□ -0.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa11.25□□□□□ -0.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 NBPF1Q3BBV0 1214 aa11.24□□□□□ -0.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 ADGRB2O60241 1585 aa11.24□□□□□ -0.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 WASLO00401 505 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 PSME1Q06323 249 aa11.23□□□□□ -0.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 L3MBTL2Q969R5 705 aa11.23□□□□□ -0.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 USP21Q9UK80 565 aa11.23□□□□□ -0.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 PRR36Q9H6K5 1346 aa11.23□□□□□ -0.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa11.23□□□□□ -0.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 PLEKHG5O94827 1062 aa11.22□□□□□ -0.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 NEUROD1Q13562 356 aa11.22□□□□□ -0.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 ANKARQ7Z5J8 1434 aa11.22□□□□□ -0.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 LMOD2Q6P5Q4 547 aa11.21□□□□□ -0.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 CABLES1Q8TDN4 633 aa11.21□□□□□ -0.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 TULP4Q9NRJ4 1543 aa11.2□□□□□ -0.62
RNA5SP18-201ENST00000390935 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
RNA5SP18-201ENST00000390935 TNS3Q68CZ2 1445 aa11.19□□□□□ -0.62
RNA5SP18-201ENST00000390935 SBNO1A3KN83 1393 aa11.19□□□□□ -0.62
RNA5SP18-201ENST00000390935 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
RNA5SP18-201ENST00000390935 CDK19Q9BWU1 502 aa11.19□□□□□ -0.62
RNA5SP18-201ENST00000390935 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
RNA5SP18-201ENST00000390935 BCL9LQ86UU0 1499 aa11.19□□□□□ -0.62
RNA5SP18-201ENST00000390935 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
RNA5SP18-201ENST00000390935 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
RNA5SP18-201ENST00000390935 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
RNA5SP18-201ENST00000390935 RGS12O14924 1447 aa11.18□□□□□ -0.62
RNA5SP18-201ENST00000390935 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
RNA5SP18-201ENST00000390935 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP11.17□□□□□ -0.62
RNA5SP18-201ENST00000390935 ATRNO75882 1429 aa11.17□□□□□ -0.62
RNA5SP18-201ENST00000390935 ARHGEF10O15013 1369 aa11.16□□□□□ -0.62
RNA5SP18-201ENST00000390935 GPRASP1Q5JY77 1395 aa11.16□□□□□ -0.62
RNA5SP18-201ENST00000390935 ITSN1Q15811 1721 aa11.16□□□□□ -0.62
RNA5SP18-201ENST00000390935 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
RNA5SP18-201ENST00000390935 ATP7BP35670 1465 aa11.16□□□□□ -0.62
RNA5SP18-201ENST00000390935 ABCA3Q99758 1704 aa11.15□□□□□ -0.62
RNA5SP18-201ENST00000390935 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
RNA5SP18-201ENST00000390935 ALS2Q96Q42 1657 aa11.15□□□□□ -0.62
RNA5SP18-201ENST00000390935 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
RNA5SP18-201ENST00000390935 UNC5CLQ8IV45 518 aa11.15□□□□□ -0.62
RNA5SP18-201ENST00000390935 SLIT2O94813 1529 aa11.14□□□□□ -0.63
RNA5SP18-201ENST00000390935 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa11.14□□□□□ -0.63
RNA5SP18-201ENST00000390935 FAM83GA6ND36 823 aa11.14□□□□□ -0.63
RNA5SP18-201ENST00000390935 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
RNA5SP18-201ENST00000390935 CCDC61Q9Y6R9 512 aa11.14□□□□□ -0.63
RNA5SP18-201ENST00000390935 ACEP12821 1306 aa11.13□□□□□ -0.63
RNA5SP18-201ENST00000390935 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
RNA5SP18-201ENST00000390935 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
RNA5SP18-201ENST00000390935 NBPF8Q3BBV2 869 aa11.13□□□□□ -0.63
RNA5SP18-201ENST00000390935 CABP2Q9NPB3 220 aa11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 115.7 ms