RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376371.6

GKAP1-203, Transcript of G kinase anchoring protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GKAP1, Length 1,778 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1-203ENST00000376371 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP36.8■■■■□ 3.48
GKAP1-203ENST00000376371 CDCA8Q53HL2 280 aa36.77■■■■□ 3.48
GKAP1-203ENST00000376371 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP36.77■■■■□ 3.48
GKAP1-203ENST00000376371 STRCQ7RTU9 1775 aa36.76■■■■□ 3.47
GKAP1-203ENST00000376371 PTCH1Q13635 1447 aa36.73■■■■□ 3.47
GKAP1-203ENST00000376371 MYOM1P52179 1685 aa36.72■■■■□ 3.47
GKAP1-203ENST00000376371 EVC2Q86UK5 1308 aa36.72■■■■□ 3.47
GKAP1-203ENST00000376371 KCNA6P17658 529 aa36.7■■■■□ 3.47
GKAP1-203ENST00000376371 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP36.69■■■■□ 3.46
GKAP1-203ENST00000376371 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP36.64■■■■□ 3.46
GKAP1-203ENST00000376371 CABP2Q9NPB3 220 aa36.63■■■■□ 3.46
GKAP1-203ENST00000376371 NWD1Q149M9 1564 aa36.62■■■■□ 3.45
GKAP1-203ENST00000376371 CDK19Q9BWU1 502 aa36.61■■■■□ 3.45
GKAP1-203ENST00000376371 ADGRB2O60241 1585 aa36.59■■■■□ 3.45
GKAP1-203ENST00000376371 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP36.58■■■■□ 3.45
GKAP1-203ENST00000376371 PANK3Q9H999 370 aa36.57■■■■□ 3.44
GKAP1-203ENST00000376371 WASLO00401 505 aaPredicted RBP36.55■■■■□ 3.44
GKAP1-203ENST00000376371 STRCP1A6NGW2 1772 aa36.53■■■■□ 3.44
GKAP1-203ENST00000376371 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP36.52■■■■□ 3.44
GKAP1-203ENST00000376371 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP36.52■■■■□ 3.44
GKAP1-203ENST00000376371 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa36.51■■■■□ 3.44
GKAP1-203ENST00000376371 ATAD2Q6PL18 1390 aa36.5■■■■□ 3.43
GKAP1-203ENST00000376371 TMC1Q8TDI8 760 aa36.48■■■■□ 3.43
GKAP1-203ENST00000376371 ANP32CO43423 234 aa36.48■■■■□ 3.43
GKAP1-203ENST00000376371 NALCNQ8IZF0 1738 aa36.46■■■■□ 3.43
GKAP1-203ENST00000376371 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP36.45■■■■□ 3.43
GKAP1-203ENST00000376371 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP36.45■■■■□ 3.43
GKAP1-203ENST00000376371 NINLQ9Y2I6 1382 aa36.41■■■■□ 3.42
GKAP1-203ENST00000376371 PRR36Q9H6K5 1346 aa36.41■■■■□ 3.42
GKAP1-203ENST00000376371 ATP7BP35670 1465 aa36.4■■■■□ 3.42
GKAP1-203ENST00000376371 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP36.4■■■■□ 3.42
GKAP1-203ENST00000376371 CARD14Q9BXL6 1004 aa36.4■■■■□ 3.42
GKAP1-203ENST00000376371 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP36.38■■■■□ 3.41
GKAP1-203ENST00000376371 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP36.38■■■■□ 3.41
GKAP1-203ENST00000376371 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa36.37■■■■□ 3.41
GKAP1-203ENST00000376371 USP32Q8NFA0 1604 aa36.37■■■■□ 3.41
GKAP1-203ENST00000376371 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP36.36■■■■□ 3.41
GKAP1-203ENST00000376371 CABP1Q9NZU7 370 aa36.36■■■■□ 3.41
GKAP1-203ENST00000376371 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa36.36■■■■□ 3.41
GKAP1-203ENST00000376371 CD163L1Q9NR16 1453 aa36.36■■■■□ 3.41
GKAP1-203ENST00000376371 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa36.34■■■■□ 3.41
GKAP1-203ENST00000376371 FMN2Q9NZ56 1722 aa36.34■■■■□ 3.41
GKAP1-203ENST00000376371 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa36.34■■■■□ 3.41
GKAP1-203ENST00000376371 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP36.33■■■■□ 3.41
GKAP1-203ENST00000376371 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa36.33■■■■□ 3.41
GKAP1-203ENST00000376371 NUTM2FA1L443 756 aa36.32■■■■□ 3.41
GKAP1-203ENST00000376371 KNSTRNQ9Y448 316 aa36.32■■■■□ 3.41
GKAP1-203ENST00000376371 CCDC61Q9Y6R9 512 aa36.32■■■■□ 3.41
GKAP1-203ENST00000376371 A0A1W2PP64 1363 aa36.31■■■■□ 3.4
GKAP1-203ENST00000376371 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP36.31■■■■□ 3.4
GKAP1-203ENST00000376371 DMRT2Q9Y5R5 561 aa36.31■■■■□ 3.4
GKAP1-203ENST00000376371 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP36.3■■■■□ 3.4
GKAP1-203ENST00000376371 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP36.3■■■■□ 3.4
GKAP1-203ENST00000376371 NSD3Q9BZ95 1437 aa36.29■■■■□ 3.4
GKAP1-203ENST00000376371 CCER2I3L3R5 266 aa36.28■■■■□ 3.4
GKAP1-203ENST00000376371 TMEM94Q12767 1356 aa36.27■■■■□ 3.4
GKAP1-203ENST00000376371 TERF2IPQ9NYB0 399 aa36.26■■■■□ 3.4
GKAP1-203ENST00000376371 C14orf37Q86TY3 774 aa36.25■■■■□ 3.39
GKAP1-203ENST00000376371 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP36.25■■■■□ 3.39
GKAP1-203ENST00000376371 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP36.25■■■■□ 3.39
GKAP1-203ENST00000376371 ANKARQ7Z5J8 1434 aa36.24■■■■□ 3.39
GKAP1-203ENST00000376371 ITSN1Q15811 1721 aa36.24■■■■□ 3.39
GKAP1-203ENST00000376371 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP36.23■■■■□ 3.39
GKAP1-203ENST00000376371 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP36.23■■■■□ 3.39
GKAP1-203ENST00000376371 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa36.22■■■■□ 3.39
GKAP1-203ENST00000376371 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa36.22■■■■□ 3.39
GKAP1-203ENST00000376371 AKAP12Q02952 1782 aa36.21■■■■□ 3.39
GKAP1-203ENST00000376371 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP36.21■■■■□ 3.39
GKAP1-203ENST00000376371 PARD3Q8TEW0 1356 aa36.21■■■■□ 3.39
GKAP1-203ENST00000376371 LRRC7Q96NW7 1537 aa36.2■■■■□ 3.38
GKAP1-203ENST00000376371 PLEKHG3A1L390 1219 aa36.19■■■■□ 3.38
GKAP1-203ENST00000376371 C19orf44Q9H6X5 657 aa36.19■■■■□ 3.38
GKAP1-203ENST00000376371 RALBP1Q15311 655 aa36.17■■■■□ 3.38
GKAP1-203ENST00000376371 MON2Q7Z3U7 1717 aa36.17■■■■□ 3.38
GKAP1-203ENST00000376371 ACEP12821 1306 aa36.13■■■■□ 3.37
GKAP1-203ENST00000376371 CGNL1Q0VF96 1302 aa36.12■■■■□ 3.37
GKAP1-203ENST00000376371 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa36.11■■■■□ 3.37
GKAP1-203ENST00000376371 CCDC184Q52MB2 194 aa36.1■■■■□ 3.37
GKAP1-203ENST00000376371 DCCP43146 1447 aa36.09■■■■□ 3.37
GKAP1-203ENST00000376371 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP36.08■■■■□ 3.37
GKAP1-203ENST00000376371 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP36.08■■■■□ 3.37
GKAP1-203ENST00000376371 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP36.08■■■■□ 3.37
GKAP1-203ENST00000376371 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP36.07■■■■□ 3.37
GKAP1-203ENST00000376371 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP36.07■■■■□ 3.37
GKAP1-203ENST00000376371 NRKQ7Z2Y5 1582 aa36.05■■■■□ 3.36
GKAP1-203ENST00000376371 KIF20BQ96Q89 1820 aa36.05■■■■□ 3.36
GKAP1-203ENST00000376371 MSH6P52701 1360 aa36.04■■■■□ 3.36
GKAP1-203ENST00000376371 FYB1O15117 783 aa36.03■■■■□ 3.36
GKAP1-203ENST00000376371 ATF3P18847 181 aa36.03■■■■□ 3.36
GKAP1-203ENST00000376371 USP6P35125 1406 aa36.03■■■■□ 3.36
GKAP1-203ENST00000376371 NSD2O96028 1365 aa36.03■■■■□ 3.36
GKAP1-203ENST00000376371 C1orf167Q5SNV9 1468 aa36.03■■■■□ 3.36
GKAP1-203ENST00000376371 MST1RQ04912 1400 aa36.02■■■■□ 3.36
GKAP1-203ENST00000376371 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP36.02■■■■□ 3.36
GKAP1-203ENST00000376371 PHF8Q9UPP1 1060 aa36.02■■■■□ 3.36
GKAP1-203ENST00000376371 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa36.01■■■■□ 3.36
GKAP1-203ENST00000376371 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP36.01■■■■□ 3.35
GKAP1-203ENST00000376371 ESCO1Q5FWF5 840 aa36■■■■□ 3.35
GKAP1-203ENST00000376371 LTBP4Q8N2S1 1624 aa35.99■■■■□ 3.35
GKAP1-203ENST00000376371 SSH2Q76I76 1423 aa35.99■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 6.7 ms