RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 DEKP35659 375 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
CTPS1-201ENST00000372616 FAM69CQ0P6D2 419 aa9.68□□□□□ -0.86
CTPS1-201ENST00000372616 FECHP22830 423 aa9.68□□□□□ -0.86
CTPS1-201ENST00000372616 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa9.68□□□□□ -0.86
CTPS1-201ENST00000372616 KDM6BO15054 1643 aa9.67□□□□□ -0.86
CTPS1-201ENST00000372616 ERBINQ96RT1 1412 aa9.67□□□□□ -0.86
CTPS1-201ENST00000372616 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
CTPS1-201ENST00000372616 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC102AQ96A19 550 aa9.67□□□□□ -0.86
CTPS1-201ENST00000372616 ATP7AQ04656 1500 aa9.67□□□□□ -0.86
CTPS1-201ENST00000372616 KIF13AQ9H1H9 1805 aa9.67□□□□□ -0.86
CTPS1-201ENST00000372616 POGZQ7Z3K3 1410 aa9.67□□□□□ -0.86
CTPS1-201ENST00000372616 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP9.66□□□□□ -0.86
CTPS1-201ENST00000372616 PDIA6Q15084 440 aa9.66□□□□□ -0.86
CTPS1-201ENST00000372616 KDM5CP41229 1560 aa9.66□□□□□ -0.86
CTPS1-201ENST00000372616 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
CTPS1-201ENST00000372616 MLH3Q9UHC1 1453 aa9.65□□□□□ -0.86
CTPS1-201ENST00000372616 KDM5DQ9BY66 1539 aa9.65□□□□□ -0.86
CTPS1-201ENST00000372616 PARP9Q8IXQ6 854 aa9.65□□□□□ -0.87
CTPS1-201ENST00000372616 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP9.65□□□□□ -0.879e-7■■■□□ 18.8
CTPS1-201ENST00000372616 HECW2Q9P2P5 1572 aa9.64□□□□□ -0.87
CTPS1-201ENST00000372616 AFAP1Q8N556 730 aa9.64□□□□□ -0.87
CTPS1-201ENST00000372616 UNC13BO14795 1591 aa9.64□□□□□ -0.87
CTPS1-201ENST00000372616 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
CTPS1-201ENST00000372616 TSPOAP1O95153 1857 aa9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-201ENST00000372616 CD44P16070 742 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-201ENST00000372616 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-201ENST00000372616 RICTORQ6R327 1708 aa9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-201ENST00000372616 MS4A3Q96HJ5 214 aa9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-201ENST00000372616 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-201ENST00000372616 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-201ENST00000372616 MPHOSPH9Q99550 1183 aa9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-201ENST00000372616 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
CTPS1-201ENST00000372616 IRF6O14896 467 aa9.62□□□□□ -0.87
CTPS1-201ENST00000372616 PIP4P2Q8N4L2 257 aa9.62□□□□□ -0.87
CTPS1-201ENST00000372616 CLUAP1Q96AJ1 413 aa9.62□□□□□ -0.87
CTPS1-201ENST00000372616 USP35Q9P2H5 1018 aa9.62□□□□□ -0.87
CTPS1-201ENST00000372616 WASHC2AQ641Q2 1341 aa9.62□□□□□ -0.87
CTPS1-201ENST00000372616 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
CTPS1-201ENST00000372616 MAGI2Q86UL8 1455 aa9.61□□□□□ -0.87
CTPS1-201ENST00000372616 NUP155O75694 1391 aa9.61□□□□□ -0.87
CTPS1-201ENST00000372616 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
CTPS1-201ENST00000372616 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
CTPS1-201ENST00000372616 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
CTPS1-201ENST00000372616 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
CTPS1-201ENST00000372616 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa9.61□□□□□ -0.87
CTPS1-201ENST00000372616 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
CTPS1-201ENST00000372616 IQGAP3Q86VI3 1631 aa9.6□□□□□ -0.87
CTPS1-201ENST00000372616 PZPP20742 1482 aa9.6□□□□□ -0.87
CTPS1-201ENST00000372616 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
CTPS1-201ENST00000372616 DEPDC5O75140 1603 aa9.59□□□□□ -0.87
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC7Q96M83 1385 aa9.59□□□□□ -0.87
CTPS1-201ENST00000372616 MAP2K5Q13163 448 aa9.59□□□□□ -0.87
CTPS1-201ENST00000372616 MRS2Q9HD23 443 aa9.59□□□□□ -0.87
CTPS1-201ENST00000372616 BCORL1Q5H9F3 1711 aa9.59□□□□□ -0.87
CTPS1-201ENST00000372616 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
CTPS1-201ENST00000372616 A2MP01023 1474 aa9.58□□□□□ -0.88
CTPS1-201ENST00000372616 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
CTPS1-201ENST00000372616 PLPP6Q8IY26 295 aa9.58□□□□□ -0.88
CTPS1-201ENST00000372616 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP9.58□□□□□ -0.88
CTPS1-201ENST00000372616 DDRGK1Q96HY6 314 aa9.58□□□□□ -0.88
CTPS1-201ENST00000372616 KANK1Q14678 1352 aa9.58□□□□□ -0.88
CTPS1-201ENST00000372616 FAM135AQ9P2D6 1515 aa9.58□□□□□ -0.88
CTPS1-201ENST00000372616 DDX12PQ92771 950 aa9.58□□□□□ -0.88
CTPS1-201ENST00000372616 RNF123Q5XPI4 1314 aa9.57□□□□□ -0.88
CTPS1-201ENST00000372616 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa9.57□□□□□ -0.88
CTPS1-201ENST00000372616 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
CTPS1-201ENST00000372616 TMC2Q8TDI7 906 aa9.57□□□□□ -0.88
CTPS1-201ENST00000372616 ABCA6Q8N139 1617 aa9.57□□□□□ -0.88
CTPS1-201ENST00000372616 TTLL13PA6NNM8 815 aa9.56□□□□□ -0.88
CTPS1-201ENST00000372616 OSBPP22059 807 aa9.56□□□□□ -0.88
CTPS1-201ENST00000372616 FOXK1P85037 733 aa9.56□□□□□ -0.88
CTPS1-201ENST00000372616 MICALL2Q8IY33 904 aa9.56□□□□□ -0.88
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC136Q96JN2 1154 aa9.56□□□□□ -0.88
CTPS1-201ENST00000372616 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa9.56□□□□□ -0.88
CTPS1-201ENST00000372616 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
CTPS1-201ENST00000372616 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
CTPS1-201ENST00000372616 RAPGEF3O95398 923 aa9.56□□□□□ -0.88
CTPS1-201ENST00000372616 MAP3K9P80192 1104 aa9.56□□□□□ -0.88
CTPS1-201ENST00000372616 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa9.56□□□□□ -0.88
CTPS1-201ENST00000372616 NUDCQ9Y266 331 aa9.56□□□□□ -0.88
CTPS1-201ENST00000372616 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa9.56□□□□□ -0.88
CTPS1-201ENST00000372616 REREQ9P2R6 1566 aa9.55□□□□□ -0.88
CTPS1-201ENST00000372616 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
CTPS1-201ENST00000372616 GNPATO15228 680 aa9.55□□□□□ -0.88
CTPS1-201ENST00000372616 AMHR2Q16671 573 aa9.55□□□□□ -0.88
CTPS1-201ENST00000372616 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
CTPS1-201ENST00000372616 MS4A1P11836 297 aa9.55□□□□□ -0.88
CTPS1-201ENST00000372616 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
CTPS1-201ENST00000372616 TET3O43151 1660 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-201ENST00000372616 VWDEQ8N2E2 1590 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-201ENST00000372616 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-201ENST00000372616 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-201ENST00000372616 C2orf72A6NCS6 295 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-201ENST00000372616 KIF3BO15066 747 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC82Q8N4S0 544 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-201ENST00000372616 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-201ENST00000372616 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-201ENST00000372616 FAM9BQ8IZU0 186 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-201ENST00000372616 ATP10AO60312 1499 aa9.53□□□□□ -0.88
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