RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372418.2

PRPS1-201, Transcript of phosphoribosyl pyrophosphate synthetase 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene PRPS1, Length 942 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPS1-201ENST00000372418 USP21Q9UK80 565 aa16.26■□□□□ 0.19
PRPS1-201ENST00000372418 MYOM2P54296 1465 aa16.26■□□□□ 0.19
PRPS1-201ENST00000372418 KIF1BO60333 1816 aa16.26■□□□□ 0.19
PRPS1-201ENST00000372418 BCL9LQ86UU0 1499 aa16.25■□□□□ 0.19
PRPS1-201ENST00000372418 PXDNQ92626 1479 aa16.25■□□□□ 0.19
PRPS1-201ENST00000372418 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
PRPS1-201ENST00000372418 NAIPQ13075 1403 aa16.23■□□□□ 0.19
PRPS1-201ENST00000372418 PPLO60437 1756 aa16.23■□□□□ 0.19
PRPS1-201ENST00000372418 ATAD2Q6PL18 1390 aa16.22■□□□□ 0.19
PRPS1-201ENST00000372418 PRAG1Q86YV5 1406 aa16.21■□□□□ 0.19
PRPS1-201ENST00000372418 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
PRPS1-201ENST00000372418 NUTM2FA1L443 756 aa16.2■□□□□ 0.18
PRPS1-201ENST00000372418 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa16.2■□□□□ 0.18
PRPS1-201ENST00000372418 GLI3P10071 1580 aa16.2■□□□□ 0.18
PRPS1-201ENST00000372418 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
PRPS1-201ENST00000372418 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa16.18■□□□□ 0.18
PRPS1-201ENST00000372418 BRWD3Q6RI45 1802 aa16.18■□□□□ 0.18
PRPS1-201ENST00000372418 WAPLQ7Z5K2 1190 aa16.18■□□□□ 0.18
PRPS1-201ENST00000372418 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa16.17■□□□□ 0.18
PRPS1-201ENST00000372418 FOXO3O43524 673 aa16.16■□□□□ 0.18
PRPS1-201ENST00000372418 ESCO1Q5FWF5 840 aa16.16■□□□□ 0.18
PRPS1-201ENST00000372418 HFM1A2PYH4 1435 aa16.15■□□□□ 0.18
PRPS1-201ENST00000372418 RALGAPBQ86X10 1494 aa16.15■□□□□ 0.18
PRPS1-201ENST00000372418 DEFB132Q7Z7B7 95 aa16.13■□□□□ 0.17
PRPS1-201ENST00000372418 STK26Q9P289 416 aa16.13■□□□□ 0.17
PRPS1-201ENST00000372418 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
PRPS1-201ENST00000372418 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
PRPS1-201ENST00000372418 TMEM132EQ6IEE7 984 aa16.12■□□□□ 0.17
PRPS1-201ENST00000372418 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
PRPS1-201ENST00000372418 SLIT2O94813 1529 aa16.12■□□□□ 0.17
PRPS1-201ENST00000372418 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
PRPS1-201ENST00000372418 FMN2Q9NZ56 1722 aa16.11■□□□□ 0.17
PRPS1-201ENST00000372418 IFT172Q9UG01 1749 aa16.11■□□□□ 0.17
PRPS1-201ENST00000372418 VGFO15240 615 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
PRPS1-201ENST00000372418 PLEKHG5O94827 1062 aa16.1■□□□□ 0.17
PRPS1-201ENST00000372418 CABLES1Q8TDN4 633 aa16.1■□□□□ 0.17
PRPS1-201ENST00000372418 ZRANB1Q9UGI0 708 aa16.1■□□□□ 0.17
PRPS1-201ENST00000372418 NPHP3Q7Z494 1330 aa16.1■□□□□ 0.17
PRPS1-201ENST00000372418 USP32Q8NFA0 1604 aa16.09■□□□□ 0.17
PRPS1-201ENST00000372418 TECPR2O15040 1411 aa16.09■□□□□ 0.17
PRPS1-201ENST00000372418 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa16.09■□□□□ 0.17
PRPS1-201ENST00000372418 ABCA3Q99758 1704 aa16.08■□□□□ 0.17
PRPS1-201ENST00000372418 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa16.07■□□□□ 0.16
PRPS1-201ENST00000372418 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa16.07■□□□□ 0.16
PRPS1-201ENST00000372418 PLCH1Q4KWH8 1693 aa16.07■□□□□ 0.16
PRPS1-201ENST00000372418 KNDC1Q76NI1 1749 aa16.07■□□□□ 0.16
PRPS1-201ENST00000372418 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
PRPS1-201ENST00000372418 RGL3Q3MIN7 710 aa16.06■□□□□ 0.16
PRPS1-201ENST00000372418 UNC5CLQ8IV45 518 aa16.06■□□□□ 0.16
PRPS1-201ENST00000372418 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
PRPS1-201ENST00000372418 PIK3C2GO75747 1445 aa16.03■□□□□ 0.16
PRPS1-201ENST00000372418 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
PRPS1-201ENST00000372418 SEPT12Q8IYM1 358 aa16.03■□□□□ 0.16
PRPS1-201ENST00000372418 ABCC11Q96J66 1382 aa16.02■□□□□ 0.16
PRPS1-201ENST00000372418 KRT28Q7Z3Y7 464 aa16.02■□□□□ 0.16
PRPS1-201ENST00000372418 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
PRPS1-201ENST00000372418 KIF1AQ12756 1690 aa16.02■□□□□ 0.15
PRPS1-201ENST00000372418 NRAPQ86VF7 1730 aa16■□□□□ 0.15
PRPS1-201ENST00000372418 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
PRPS1-201ENST00000372418 TNS3Q68CZ2 1445 aa16■□□□□ 0.15
PRPS1-201ENST00000372418 FAM182BQ5T319 152 aa15.99■□□□□ 0.15
PRPS1-201ENST00000372418 CCDC125Q86Z20 511 aa15.99■□□□□ 0.15
PRPS1-201ENST00000372418 CCDC144AA2RUR9 1427 aa15.98■□□□□ 0.15
PRPS1-201ENST00000372418 FAM83GA6ND36 823 aa15.98■□□□□ 0.15
PRPS1-201ENST00000372418 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP15.98■□□□□ 0.15
PRPS1-201ENST00000372418 VPS72Q15906 364 aa15.98■□□□□ 0.15
PRPS1-201ENST00000372418 LRP5O75197 1615 aa15.97■□□□□ 0.15
PRPS1-201ENST00000372418 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
PRPS1-201ENST00000372418 NWD2Q9ULI1 1742 aa15.97■□□□□ 0.15
PRPS1-201ENST00000372418 NRXN1Q9ULB1 1477 aa15.97■□□□□ 0.15
PRPS1-201ENST00000372418 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
PRPS1-201ENST00000372418 CFAP70Q5T0N1 1121 aa15.96■□□□□ 0.15
PRPS1-201ENST00000372418 PHF8Q9UPP1 1060 aa15.96■□□□□ 0.15
PRPS1-201ENST00000372418 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa15.95■□□□□ 0.14
PRPS1-201ENST00000372418 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa15.94■□□□□ 0.14
PRPS1-201ENST00000372418 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa15.93■□□□□ 0.14
PRPS1-201ENST00000372418 KRT27Q7Z3Y8 459 aa15.93■□□□□ 0.14
PRPS1-201ENST00000372418 MPHOSPH9Q99550 1183 aa15.93■□□□□ 0.14
PRPS1-201ENST00000372418 PRR36Q9H6K5 1346 aa15.93■□□□□ 0.14
PRPS1-201ENST00000372418 ALS2Q96Q42 1657 aa15.92■□□□□ 0.14
PRPS1-201ENST00000372418 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
PRPS1-201ENST00000372418 LMOD2Q6P5Q4 547 aa15.92■□□□□ 0.14
PRPS1-201ENST00000372418 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa15.92■□□□□ 0.14
PRPS1-201ENST00000372418 PRAM1Q96QH2 718 aa15.92■□□□□ 0.14
PRPS1-201ENST00000372418 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
PRPS1-201ENST00000372418 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
PRPS1-201ENST00000372418 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
PRPS1-201ENST00000372418 SBNO1A3KN83 1393 aa15.91■□□□□ 0.14
PRPS1-201ENST00000372418 HRCP23327 699 aa15.91■□□□□ 0.14
PRPS1-201ENST00000372418 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
PRPS1-201ENST00000372418 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
PRPS1-201ENST00000372418 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa15.89■□□□□ 0.13
PRPS1-201ENST00000372418 ADGRB1O14514 1584 aa15.89■□□□□ 0.13
PRPS1-201ENST00000372418 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
PRPS1-201ENST00000372418 BTG4Q9NY30 223 aa15.89■□□□□ 0.13
PRPS1-201ENST00000372418 SIRT1Q96EB6 747 aa15.87■□□□□ 0.13
PRPS1-201ENST00000372418 ADGRB2O60241 1585 aa15.87■□□□□ 0.13
PRPS1-201ENST00000372418 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
PRPS1-201ENST00000372418 PSME1Q06323 249 aa15.86■□□□□ 0.13
PRPS1-201ENST00000372418 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms