RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312060.9

CTU2-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene CTU2, Length 1,672 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-201ENST00000312060 KCNA6P17658 529 aa30.76■■■□□ 2.51
CTU2-201ENST00000312060 PTCH1Q13635 1447 aa30.76■■■□□ 2.51
CTU2-201ENST00000312060 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP30.76■■■□□ 2.51
CTU2-201ENST00000312060 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP30.74■■■□□ 2.51
CTU2-201ENST00000312060 EVC2Q86UK5 1308 aa30.72■■■□□ 2.51
CTU2-201ENST00000312060 TULP4Q9NRJ4 1543 aa30.69■■■□□ 2.5
CTU2-201ENST00000312060 NWD1Q149M9 1564 aa30.69■■■□□ 2.5
CTU2-201ENST00000312060 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP30.69■■■□□ 2.5
CTU2-201ENST00000312060 DMRT2Q9Y5R5 561 aa30.66■■■□□ 2.5
CTU2-201ENST00000312060 STRCP1A6NGW2 1772 aa30.64■■■□□ 2.49
CTU2-201ENST00000312060 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP30.63■■■□□ 2.49
CTU2-201ENST00000312060 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP30.63■■■□□ 2.49
CTU2-201ENST00000312060 CDK19Q9BWU1 502 aa30.62■■■□□ 2.49
CTU2-201ENST00000312060 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP30.62■■■□□ 2.49
CTU2-201ENST00000312060 CABP2Q9NPB3 220 aa30.61■■■□□ 2.49
CTU2-201ENST00000312060 ADGRB2O60241 1585 aa30.6■■■□□ 2.49
CTU2-201ENST00000312060 WASLO00401 505 aaPredicted RBP30.59■■■□□ 2.49
CTU2-201ENST00000312060 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP30.59■■■□□ 2.49
CTU2-201ENST00000312060 MYOM1P52179 1685 aa30.58■■■□□ 2.49
CTU2-201ENST00000312060 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP30.56■■■□□ 2.48
CTU2-201ENST00000312060 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP30.55■■■□□ 2.48
CTU2-201ENST00000312060 NALCNQ8IZF0 1738 aa30.54■■■□□ 2.48
CTU2-201ENST00000312060 ATAD2Q6PL18 1390 aa30.53■■■□□ 2.48
CTU2-201ENST00000312060 TMC1Q8TDI8 760 aa30.52■■■□□ 2.48
CTU2-201ENST00000312060 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP30.5■■■□□ 2.47
CTU2-201ENST00000312060 PANK3Q9H999 370 aa30.49■■■□□ 2.47
CTU2-201ENST00000312060 C14orf37Q86TY3 774 aa30.49■■■□□ 2.47
CTU2-201ENST00000312060 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa30.49■■■□□ 2.47
CTU2-201ENST00000312060 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa30.48■■■□□ 2.47
CTU2-201ENST00000312060 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP30.46■■■□□ 2.47
CTU2-201ENST00000312060 NINLQ9Y2I6 1382 aa30.45■■■□□ 2.47
CTU2-201ENST00000312060 TMEM94Q12767 1356 aa30.44■■■□□ 2.46
CTU2-201ENST00000312060 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa30.44■■■□□ 2.46
CTU2-201ENST00000312060 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP30.43■■■□□ 2.46
CTU2-201ENST00000312060 FMN2Q9NZ56 1722 aa30.43■■■□□ 2.46
CTU2-201ENST00000312060 NUTM2FA1L443 756 aa30.42■■■□□ 2.46
CTU2-201ENST00000312060 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP30.42■■■□□ 2.46
CTU2-201ENST00000312060 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa30.42■■■□□ 2.46
CTU2-201ENST00000312060 ATP7BP35670 1465 aa30.42■■■□□ 2.46
CTU2-201ENST00000312060 CCDC61Q9Y6R9 512 aa30.42■■■□□ 2.46
CTU2-201ENST00000312060 PRR36Q9H6K5 1346 aa30.41■■■□□ 2.46
CTU2-201ENST00000312060 CABP1Q9NZU7 370 aa30.41■■■□□ 2.46
CTU2-201ENST00000312060 C19orf44Q9H6X5 657 aa30.4■■■□□ 2.46
CTU2-201ENST00000312060 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP30.39■■■□□ 2.46
CTU2-201ENST00000312060 USP32Q8NFA0 1604 aa30.39■■■□□ 2.46
CTU2-201ENST00000312060 LRRC7Q96NW7 1537 aa30.39■■■□□ 2.46
CTU2-201ENST00000312060 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa30.38■■■□□ 2.45
CTU2-201ENST00000312060 ITSN1Q15811 1721 aa30.38■■■□□ 2.45
CTU2-201ENST00000312060 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa30.37■■■□□ 2.45
CTU2-201ENST00000312060 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa30.36■■■□□ 2.45
CTU2-201ENST00000312060 ANP32CO43423 234 aa30.36■■■□□ 2.45
CTU2-201ENST00000312060 ANKARQ7Z5J8 1434 aa30.36■■■□□ 2.45
CTU2-201ENST00000312060 TERF2IPQ9NYB0 399 aa30.35■■■□□ 2.45
CTU2-201ENST00000312060 KNSTRNQ9Y448 316 aa30.34■■■□□ 2.45
CTU2-201ENST00000312060 MIER1Q8N108 512 aa30.33■■■□□ 2.45
CTU2-201ENST00000312060 CARD14Q9BXL6 1004 aa30.33■■■□□ 2.45
CTU2-201ENST00000312060 CD163L1Q9NR16 1453 aa30.32■■■□□ 2.44
CTU2-201ENST00000312060 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP30.32■■■□□ 2.44
CTU2-201ENST00000312060 A0A1W2PP64 1363 aa30.31■■■□□ 2.44
CTU2-201ENST00000312060 MSH6P52701 1360 aa30.3■■■□□ 2.44
CTU2-201ENST00000312060 PLEKHG3A1L390 1219 aa30.29■■■□□ 2.44
CTU2-201ENST00000312060 ATF3P18847 181 aa30.29■■■□□ 2.44
CTU2-201ENST00000312060 DCCP43146 1447 aa30.29■■■□□ 2.44
CTU2-201ENST00000312060 AKAP12Q02952 1782 aa30.28■■■□□ 2.44
CTU2-201ENST00000312060 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP30.28■■■□□ 2.44
CTU2-201ENST00000312060 NSD3Q9BZ95 1437 aa30.27■■■□□ 2.44
CTU2-201ENST00000312060 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP30.26■■■□□ 2.43
CTU2-201ENST00000312060 CADPS2Q86UW7 1296 aa30.26■■■□□ 2.43
CTU2-201ENST00000312060 LTBP4Q8N2S1 1624 aa30.24■■■□□ 2.43
CTU2-201ENST00000312060 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa30.24■■■□□ 2.43
CTU2-201ENST00000312060 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP30.24■■■□□ 2.43
CTU2-201ENST00000312060 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP30.23■■■□□ 2.43
CTU2-201ENST00000312060 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP30.23■■■□□ 2.43
CTU2-201ENST00000312060 MON2Q7Z3U7 1717 aa30.23■■■□□ 2.43
CTU2-201ENST00000312060 ACEP12821 1306 aa30.23■■■□□ 2.43
CTU2-201ENST00000312060 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP30.22■■■□□ 2.43
CTU2-201ENST00000312060 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP30.22■■■□□ 2.43
CTU2-201ENST00000312060 ESCO1Q5FWF5 840 aa30.2■■■□□ 2.43
CTU2-201ENST00000312060 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP30.2■■■□□ 2.42
CTU2-201ENST00000312060 C1orf167Q5SNV9 1468 aa30.19■■■□□ 2.42
CTU2-201ENST00000312060 PHF8Q9UPP1 1060 aa30.19■■■□□ 2.42
CTU2-201ENST00000312060 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa30.19■■■□□ 2.42
CTU2-201ENST00000312060 CGNL1Q0VF96 1302 aa30.19■■■□□ 2.42
CTU2-201ENST00000312060 MST1RQ04912 1400 aa30.18■■■□□ 2.42
CTU2-201ENST00000312060 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP30.18■■■□□ 2.42
CTU2-201ENST00000312060 ORAI2Q96SN7 254 aa30.16■■■□□ 2.42
CTU2-201ENST00000312060 RALBP1Q15311 655 aa30.15■■■□□ 2.42
CTU2-201ENST00000312060 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP30.15■■■□□ 2.42
CTU2-201ENST00000312060 KIF20BQ96Q89 1820 aa30.14■■■□□ 2.41
CTU2-201ENST00000312060 PARD3Q8TEW0 1356 aa30.13■■■□□ 2.41
CTU2-201ENST00000312060 USP6P35125 1406 aa30.12■■■□□ 2.41
CTU2-201ENST00000312060 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP30.12■■■□□ 2.41
CTU2-201ENST00000312060 KIF1AQ12756 1690 aa30.12■■■□□ 2.41
CTU2-201ENST00000312060 NRKQ7Z2Y5 1582 aa30.1■■■□□ 2.41
CTU2-201ENST00000312060 FYB1O15117 783 aa30.09■■■□□ 2.41
CTU2-201ENST00000312060 NSD2O96028 1365 aa30.09■■■□□ 2.41
CTU2-201ENST00000312060 SLAIN2Q9P270 581 aa30.08■■■□□ 2.41
CTU2-201ENST00000312060 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa30.08■■■□□ 2.41
CTU2-201ENST00000312060 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa30.07■■■□□ 2.4
CTU2-201ENST00000312060 PSME1Q06323 249 aa30.06■■■□□ 2.4
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