RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP36.42■■■■□ 3.42
CAPNS1-201ENST00000246533 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa36.42■■■■□ 3.42
CAPNS1-201ENST00000246533 MSH6P52701 1360 aa36.41■■■■□ 3.42
CAPNS1-201ENST00000246533 C19orf44Q9H6X5 657 aa36.41■■■■□ 3.42
CAPNS1-201ENST00000246533 NALCNQ8IZF0 1738 aa36.4■■■■□ 3.42
CAPNS1-201ENST00000246533 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP36.4■■■■□ 3.42
CAPNS1-201ENST00000246533 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP36.4■■■■□ 3.42
CAPNS1-201ENST00000246533 PRAM1Q96QH2 718 aa36.4■■■■□ 3.42
CAPNS1-201ENST00000246533 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa36.39■■■■□ 3.42
CAPNS1-201ENST00000246533 TOM1O60784 492 aa36.39■■■■□ 3.42
CAPNS1-201ENST00000246533 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa36.35■■■■□ 3.41
CAPNS1-201ENST00000246533 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP36.33■■■■□ 3.41
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM135BQ49AJ0 1406 aa36.32■■■■□ 3.41
CAPNS1-201ENST00000246533 SIRT1Q96EB6 747 aa36.32■■■■□ 3.4
CAPNS1-201ENST00000246533 POGKQ9P215 609 aa36.32■■■■□ 3.4
CAPNS1-201ENST00000246533 DLC1Q96QB1 1528 aa36.3■■■■□ 3.4
CAPNS1-201ENST00000246533 ANP32CO43423 234 aa36.3■■■■□ 3.4
CAPNS1-201ENST00000246533 ATF3P18847 181 aa36.3■■■■□ 3.4
CAPNS1-201ENST00000246533 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP36.3■■■■□ 3.4
CAPNS1-201ENST00000246533 SLAIN2Q9P270 581 aa36.29■■■■□ 3.4
CAPNS1-201ENST00000246533 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP36.27■■■■□ 3.4
CAPNS1-201ENST00000246533 CADPS2Q86UW7 1296 aa36.26■■■■□ 3.4
CAPNS1-201ENST00000246533 NUTM2FA1L443 756 aa36.24■■■■□ 3.39
CAPNS1-201ENST00000246533 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP36.24■■■■□ 3.39
CAPNS1-201ENST00000246533 RALGAPBQ86X10 1494 aa36.24■■■■□ 3.39
CAPNS1-201ENST00000246533 NEFLP07196 543 aa36.23■■■■□ 3.39
CAPNS1-201ENST00000246533 GPRASP1Q5JY77 1395 aa36.22■■■■□ 3.39
CAPNS1-201ENST00000246533 CARD11Q9BXL7 1154 aa36.22■■■■□ 3.39
CAPNS1-201ENST00000246533 DCCP43146 1447 aa36.21■■■■□ 3.39
CAPNS1-201ENST00000246533 MST1RQ04912 1400 aa36.2■■■■□ 3.39
CAPNS1-201ENST00000246533 FKBP8Q14318 412 aa36.16■■■■□ 3.38
CAPNS1-201ENST00000246533 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa36.15■■■■□ 3.38
CAPNS1-201ENST00000246533 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa36.13■■■■□ 3.37
CAPNS1-201ENST00000246533 ORAI2Q96SN7 254 aa36.12■■■■□ 3.37
CAPNS1-201ENST00000246533 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP36.11■■■■□ 3.37
CAPNS1-201ENST00000246533 HSPA1LP34931 641 aa36.11■■■■□ 3.37
CAPNS1-201ENST00000246533 BRINP3Q76B58 766 aa36.11■■■■□ 3.37
CAPNS1-201ENST00000246533 C1orf167Q5SNV9 1468 aa36.11■■■■□ 3.37
CAPNS1-201ENST00000246533 ANP32EQ9BTT0 268 aa36.1■■■■□ 3.37
CAPNS1-201ENST00000246533 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP36.08■■■■□ 3.37
CAPNS1-201ENST00000246533 FMN2Q9NZ56 1722 aa36.06■■■■□ 3.36
CAPNS1-201ENST00000246533 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP36.05■■■■□ 3.36
CAPNS1-201ENST00000246533 QRICH2Q9H0J4 1663 aa36.05■■■■□ 3.36
CAPNS1-201ENST00000246533 WASLO00401 505 aaPredicted RBP36.04■■■■□ 3.36
CAPNS1-201ENST00000246533 ADGRB2O60241 1585 aa36.04■■■■□ 3.36
CAPNS1-201ENST00000246533 ESCO1Q5FWF5 840 aa36.02■■■■□ 3.36
CAPNS1-201ENST00000246533 PRR36Q9H6K5 1346 aa36.01■■■■□ 3.36
CAPNS1-201ENST00000246533 CDK19Q9BWU1 502 aa36■■■■□ 3.35
CAPNS1-201ENST00000246533 USP32Q8NFA0 1604 aa35.99■■■■□ 3.35
CAPNS1-201ENST00000246533 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa35.98■■■■□ 3.35
CAPNS1-201ENST00000246533 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP35.97■■■■□ 3.35
CAPNS1-201ENST00000246533 USP47Q96K76 1375 aa35.94■■■■□ 3.34
CAPNS1-201ENST00000246533 CABP2Q9NPB3 220 aa35.94■■■■□ 3.34
CAPNS1-201ENST00000246533 TULP4Q9NRJ4 1543 aa35.93■■■■□ 3.34
CAPNS1-201ENST00000246533 FOXO3O43524 673 aa35.91■■■■□ 3.34
CAPNS1-201ENST00000246533 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa35.91■■■■□ 3.34
CAPNS1-201ENST00000246533 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP35.9■■■■□ 3.34
CAPNS1-201ENST00000246533 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP35.89■■■■□ 3.34
CAPNS1-201ENST00000246533 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP35.89■■■■□ 3.34
CAPNS1-201ENST00000246533 TESK2Q96S53 571 aa35.89■■■■□ 3.34
CAPNS1-201ENST00000246533 PHLPP1O60346 1717 aa35.88■■■■□ 3.34
CAPNS1-201ENST00000246533 ATP7BP35670 1465 aa35.87■■■■□ 3.33
CAPNS1-201ENST00000246533 PHF8Q9UPP1 1060 aa35.86■■■■□ 3.33
CAPNS1-201ENST00000246533 ANKARQ7Z5J8 1434 aa35.85■■■■□ 3.33
CAPNS1-201ENST00000246533 NHSL1Q5SYE7 1610 aa35.85■■■■□ 3.33
CAPNS1-201ENST00000246533 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP35.85■■■■□ 3.33
CAPNS1-201ENST00000246533 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP35.83■■■■□ 3.33
CAPNS1-201ENST00000246533 EVC2Q86UK5 1308 aa35.83■■■■□ 3.33
CAPNS1-201ENST00000246533 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa35.81■■■■□ 3.32
CAPNS1-201ENST00000246533 ERICH6BQ5W0A0 696 aa35.79■■■■□ 3.32
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC61Q9Y6R9 512 aa35.77■■■■□ 3.32
CAPNS1-201ENST00000246533 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP35.76■■■■□ 3.32
CAPNS1-201ENST00000246533 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP35.75■■■■□ 3.31
CAPNS1-201ENST00000246533 NPHP3Q7Z494 1330 aa35.74■■■■□ 3.31
CAPNS1-201ENST00000246533 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP35.74■■■■□ 3.31
CAPNS1-201ENST00000246533 PXDNQ92626 1479 aa35.73■■■■□ 3.31
CAPNS1-201ENST00000246533 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa35.73■■■■□ 3.31
CAPNS1-201ENST00000246533 CABP1Q9NZU7 370 aa35.73■■■■□ 3.31
CAPNS1-201ENST00000246533 DISP3Q9P2K9 1392 aa35.73■■■■□ 3.31
CAPNS1-201ENST00000246533 KIF1AQ12756 1690 aa35.73■■■■□ 3.31
CAPNS1-201ENST00000246533 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP35.71■■■■□ 3.31
CAPNS1-201ENST00000246533 KRT28Q7Z3Y7 464 aa35.71■■■■□ 3.31
CAPNS1-201ENST00000246533 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa35.71■■■■□ 3.31
CAPNS1-201ENST00000246533 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP35.7■■■■□ 3.31
CAPNS1-201ENST00000246533 ITSN1Q15811 1721 aa35.69■■■■□ 3.3
CAPNS1-201ENST00000246533 PSME1Q06323 249 aa35.69■■■■□ 3.3
CAPNS1-201ENST00000246533 ACEP12821 1306 aa35.68■■■■□ 3.3
CAPNS1-201ENST00000246533 PLEKHG3A1L390 1219 aa35.67■■■■□ 3.3
CAPNS1-201ENST00000246533 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP35.67■■■■□ 3.3
CAPNS1-201ENST00000246533 JCADQ9P266 1359 aa35.63■■■■□ 3.29
CAPNS1-201ENST00000246533 WASHC2AQ641Q2 1341 aa35.62■■■■□ 3.29
CAPNS1-201ENST00000246533 TMF1P82094 1093 aa35.61■■■■□ 3.29
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa35.61■■■■□ 3.29
CAPNS1-201ENST00000246533 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP35.6■■■■□ 3.29
CAPNS1-201ENST00000246533 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP35.6■■■■□ 3.29
CAPNS1-201ENST00000246533 TMC1Q8TDI8 760 aa35.59■■■■□ 3.29
CAPNS1-201ENST00000246533 ATAD2Q6PL18 1390 aa35.58■■■■□ 3.29
CAPNS1-201ENST00000246533 PNPLA6Q8IY17 1366 aa35.58■■■■□ 3.29
CAPNS1-201ENST00000246533 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa35.58■■■■□ 3.29
CAPNS1-201ENST00000246533 PLEKHG5O94827 1062 aa35.57■■■■□ 3.29
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