RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 ORAI2Q96SN7 254 aa25.76■■□□□ 1.71
SPCS1-201ENST00000233025 RALGAPBQ86X10 1494 aa25.74■■□□□ 1.71
SPCS1-201ENST00000233025 PXDNQ92626 1479 aa25.72■■□□□ 1.71
SPCS1-201ENST00000233025 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa25.71■■□□□ 1.71
SPCS1-201ENST00000233025 SLIT2O94813 1529 aa25.68■■□□□ 1.7
SPCS1-201ENST00000233025 PRAG1Q86YV5 1406 aa25.67■■□□□ 1.7
SPCS1-201ENST00000233025 HRCP23327 699 aa25.64■■□□□ 1.7
SPCS1-201ENST00000233025 ROBO2Q9HCK4 1378 aa25.64■■□□□ 1.69
SPCS1-201ENST00000233025 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa25.63■■□□□ 1.69
SPCS1-201ENST00000233025 USP32Q8NFA0 1604 aa25.63■■□□□ 1.69
SPCS1-201ENST00000233025 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
SPCS1-201ENST00000233025 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
SPCS1-201ENST00000233025 UNC5CLQ8IV45 518 aa25.62■■□□□ 1.69
SPCS1-201ENST00000233025 NPHP3Q7Z494 1330 aa25.62■■□□□ 1.69
SPCS1-201ENST00000233025 CLTCL1P53675 1640 aa25.59■■□□□ 1.69
SPCS1-201ENST00000233025 PLCH1Q4KWH8 1693 aa25.59■■□□□ 1.69
SPCS1-201ENST00000233025 NWD2Q9ULI1 1742 aa25.59■■□□□ 1.69
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
SPCS1-201ENST00000233025 KIF1BO60333 1816 aa25.58■■□□□ 1.68
SPCS1-201ENST00000233025 SEPT12Q8IYM1 358 aa25.56■■□□□ 1.68
SPCS1-201ENST00000233025 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
SPCS1-201ENST00000233025 NUP155O75694 1391 aa25.55■■□□□ 1.68
SPCS1-201ENST00000233025 HFM1A2PYH4 1435 aa25.54■■□□□ 1.68
SPCS1-201ENST00000233025 RGPD1P0DJD0 1748 aa25.54■■□□□ 1.68
SPCS1-201ENST00000233025 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
SPCS1-201ENST00000233025 ABCA3Q99758 1704 aa25.51■■□□□ 1.68
SPCS1-201ENST00000233025 APLP2Q06481 763 aa25.51■■□□□ 1.67
SPCS1-201ENST00000233025 ROCK1Q13464 1354 aa25.5■■□□□ 1.67
SPCS1-201ENST00000233025 ESCO1Q5FWF5 840 aa25.5■■□□□ 1.67
SPCS1-201ENST00000233025 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
SPCS1-201ENST00000233025 FOXO3O43524 673 aa25.49■■□□□ 1.67
SPCS1-201ENST00000233025 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
SPCS1-201ENST00000233025 BAG6P46379 1132 aa25.49■■□□□ 1.67
SPCS1-201ENST00000233025 KRT27Q7Z3Y8 459 aa25.49■■□□□ 1.67
SPCS1-201ENST00000233025 VPS72Q15906 364 aa25.47■■□□□ 1.67
SPCS1-201ENST00000233025 KIF1AQ12756 1690 aa25.47■■□□□ 1.67
SPCS1-201ENST00000233025 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.67
SPCS1-201ENST00000233025 NRAPQ86VF7 1730 aa25.45■■□□□ 1.66
SPCS1-201ENST00000233025 FMN2Q9NZ56 1722 aa25.43■■□□□ 1.66
SPCS1-201ENST00000233025 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa25.43■■□□□ 1.66
SPCS1-201ENST00000233025 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.43■■□□□ 1.66
SPCS1-201ENST00000233025 PPLO60437 1756 aa25.43■■□□□ 1.66
SPCS1-201ENST00000233025 YY1P25490 414 aa25.42■■□□□ 1.66
SPCS1-201ENST00000233025 DISP2A7MBM2 1401 aa25.42■■□□□ 1.66
SPCS1-201ENST00000233025 NAIPQ13075 1403 aa25.41■■□□□ 1.66
SPCS1-201ENST00000233025 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
SPCS1-201ENST00000233025 CCDC144AA2RUR9 1427 aa25.39■■□□□ 1.66
SPCS1-201ENST00000233025 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
SPCS1-201ENST00000233025 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
SPCS1-201ENST00000233025 TNS3Q68CZ2 1445 aa25.35■■□□□ 1.65
SPCS1-201ENST00000233025 KNDC1Q76NI1 1749 aa25.34■■□□□ 1.65
SPCS1-201ENST00000233025 VGFO15240 615 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
SPCS1-201ENST00000233025 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
SPCS1-201ENST00000233025 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa25.32■■□□□ 1.64
SPCS1-201ENST00000233025 ADGRB2O60241 1585 aa25.32■■□□□ 1.64
SPCS1-201ENST00000233025 TECPR2O15040 1411 aa25.32■■□□□ 1.64
SPCS1-201ENST00000233025 IFT172Q9UG01 1749 aa25.32■■□□□ 1.64
SPCS1-201ENST00000233025 NUTM2FA1L443 756 aa25.31■■□□□ 1.64
SPCS1-201ENST00000233025 RREB1Q92766 1687 aa25.31■■□□□ 1.64
SPCS1-201ENST00000233025 CABLES1Q8TDN4 633 aa25.29■■□□□ 1.64
SPCS1-201ENST00000233025 A0A0G2JS52 829 aa25.28■■□□□ 1.64
SPCS1-201ENST00000233025 MYT1Q01538 1121 aa25.28■■□□□ 1.64
SPCS1-201ENST00000233025 NUP188Q5SRE5 1749 aa25.28■■□□□ 1.64
SPCS1-201ENST00000233025 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
SPCS1-201ENST00000233025 KRT28Q7Z3Y7 464 aa25.27■■□□□ 1.64
SPCS1-201ENST00000233025 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
SPCS1-201ENST00000233025 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
SPCS1-201ENST00000233025 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa25.24■■□□□ 1.63
SPCS1-201ENST00000233025 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
SPCS1-201ENST00000233025 FAM182BQ5T319 152 aa25.24■■□□□ 1.63
SPCS1-201ENST00000233025 SBNO1A3KN83 1393 aa25.22■■□□□ 1.63
SPCS1-201ENST00000233025 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa25.22■■□□□ 1.63
SPCS1-201ENST00000233025 FAM83GA6ND36 823 aa25.22■■□□□ 1.63
SPCS1-201ENST00000233025 WAPLQ7Z5K2 1190 aa25.22■■□□□ 1.63
SPCS1-201ENST00000233025 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa25.21■■□□□ 1.63
SPCS1-201ENST00000233025 CAMKK2Q96RR4 588 aa25.21■■□□□ 1.63
SPCS1-201ENST00000233025 NRXN1Q9ULB1 1477 aa25.21■■□□□ 1.63
SPCS1-201ENST00000233025 ARHGEF10O15013 1369 aa25.2■■□□□ 1.63
SPCS1-201ENST00000233025 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
SPCS1-201ENST00000233025 PARD3Q8TEW0 1356 aa25.18■■□□□ 1.62
SPCS1-201ENST00000233025 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa25.18■■□□□ 1.62
SPCS1-201ENST00000233025 UTRNP46939 3433 aa25.18■■□□□ 1.62
SPCS1-201ENST00000233025 ALS2Q96Q42 1657 aa25.17■■□□□ 1.62
SPCS1-201ENST00000233025 PLEKHG5O94827 1062 aa25.17■■□□□ 1.62
SPCS1-201ENST00000233025 ABCC11Q96J66 1382 aa25.16■■□□□ 1.62
SPCS1-201ENST00000233025 PSME1Q06323 249 aa25.15■■□□□ 1.62
SPCS1-201ENST00000233025 BTG4Q9NY30 223 aa25.15■■□□□ 1.62
SPCS1-201ENST00000233025 NINLQ9Y2I6 1382 aa25.15■■□□□ 1.62
SPCS1-201ENST00000233025 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa25.14■■□□□ 1.62
SPCS1-201ENST00000233025 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa25.14■■□□□ 1.62
SPCS1-201ENST00000233025 PHF8Q9UPP1 1060 aa25.14■■□□□ 1.62
SPCS1-201ENST00000233025 POTEDQ86YR6 584 aa25.13■■□□□ 1.61
SPCS1-201ENST00000233025 STK26Q9P289 416 aa25.13■■□□□ 1.61
SPCS1-201ENST00000233025 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
SPCS1-201ENST00000233025 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa25.1■■□□□ 1.61
SPCS1-201ENST00000233025 TRIM37O94972 964 aa25.09■■□□□ 1.61
SPCS1-201ENST00000233025 ITGAEP38570 1179 aa25.09■■□□□ 1.61
SPCS1-201ENST00000233025 LMOD2Q6P5Q4 547 aa25.09■■□□□ 1.61
SPCS1-201ENST00000233025 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
SPCS1-201ENST00000233025 FAM196AQ6ZSG2 479 aa25.06■■□□□ 1.6
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