RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216840.10

RABGGTA-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTA, Length 2,088 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-201ENST00000216840 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa23.13■■□□□ 1.29
RABGGTA-201ENST00000216840 HDGFP51858 240 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
RABGGTA-201ENST00000216840 TMEM2Q9UHN6 1383 aa23.12■■□□□ 1.29
RABGGTA-201ENST00000216840 NLRP1Q9C000 1473 aa23.12■■□□□ 1.29
RABGGTA-201ENST00000216840 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
RABGGTA-201ENST00000216840 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
RABGGTA-201ENST00000216840 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa23.1■■□□□ 1.29
RABGGTA-201ENST00000216840 ABCC11Q96J66 1382 aa23.1■■□□□ 1.29
RABGGTA-201ENST00000216840 NINLQ9Y2I6 1382 aa23.09■■□□□ 1.29
RABGGTA-201ENST00000216840 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
RABGGTA-201ENST00000216840 NUDCQ9Y266 331 aa23.09■■□□□ 1.29
RABGGTA-201ENST00000216840 METP08581 1390 aa23.08■■□□□ 1.28
RABGGTA-201ENST00000216840 ATAD2Q6PL18 1390 aa23.06■■□□□ 1.28
RABGGTA-201ENST00000216840 KNDC1Q76NI1 1749 aa23.06■■□□□ 1.28
RABGGTA-201ENST00000216840 BCANQ96GW7 911 aa23.05■■□□□ 1.28
RABGGTA-201ENST00000216840 ADAMTS8Q9UP79 889 aa23.05■■□□□ 1.28
RABGGTA-201ENST00000216840 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa23.05■■□□□ 1.28
RABGGTA-201ENST00000216840 WAPLQ7Z5K2 1190 aa23.04■■□□□ 1.28
RABGGTA-201ENST00000216840 CGNL1Q0VF96 1302 aa23.04■■□□□ 1.28
RABGGTA-201ENST00000216840 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP23.03■■□□□ 1.28
RABGGTA-201ENST00000216840 CDK19Q9BWU1 502 aa23.03■■□□□ 1.28
RABGGTA-201ENST00000216840 MORC1Q86VD1 984 aa23.02■■□□□ 1.28
RABGGTA-201ENST00000216840 A0A1W2PP64 1363 aa23.02■■□□□ 1.28
RABGGTA-201ENST00000216840 TECPR2O15040 1411 aa23.01■■□□□ 1.27
RABGGTA-201ENST00000216840 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa23■■□□□ 1.27
RABGGTA-201ENST00000216840 NSD2O96028 1365 aa23■■□□□ 1.27
RABGGTA-201ENST00000216840 LTKP29376 864 aa23■■□□□ 1.27
RABGGTA-201ENST00000216840 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
RABGGTA-201ENST00000216840 CD163L1Q9NR16 1453 aa23■■□□□ 1.27
RABGGTA-201ENST00000216840 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa23■■□□□ 1.27
RABGGTA-201ENST00000216840 CPS1P31327 1500 aa22.99■■□□□ 1.27
RABGGTA-201ENST00000216840 SLIT1O75093 1534 aa22.98■■□□□ 1.27
RABGGTA-201ENST00000216840 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
RABGGTA-201ENST00000216840 FAM135BQ49AJ0 1406 aa22.98■■□□□ 1.27
RABGGTA-201ENST00000216840 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.98■■□□□ 1.27
RABGGTA-201ENST00000216840 SIRT1Q96EB6 747 aa22.98■■□□□ 1.27
RABGGTA-201ENST00000216840 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
RABGGTA-201ENST00000216840 ARHGAP23Q9P227 1491 aa22.98■■□□□ 1.27
RABGGTA-201ENST00000216840 PDE3BQ13370 1112 aa22.97■■□□□ 1.27
RABGGTA-201ENST00000216840 TXNDC2Q86VQ3 553 aa22.97■■□□□ 1.27
RABGGTA-201ENST00000216840 TERF2IPQ9NYB0 399 aa22.97■■□□□ 1.27
RABGGTA-201ENST00000216840 MED14O60244 1454 aa22.94■■□□□ 1.26
RABGGTA-201ENST00000216840 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa22.94■■□□□ 1.26
RABGGTA-201ENST00000216840 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
RABGGTA-201ENST00000216840 SHPRHQ149N8 1683 aa22.93■■□□□ 1.26
RABGGTA-201ENST00000216840 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
RABGGTA-201ENST00000216840 ERICH6BQ5W0A0 696 aa22.93■■□□□ 1.26
RABGGTA-201ENST00000216840 CABP1Q9NZU7 370 aa22.93■■□□□ 1.26
RABGGTA-201ENST00000216840 EID1Q9Y6B2 187 aa22.93■■□□□ 1.26
RABGGTA-201ENST00000216840 RNF123Q5XPI4 1314 aa22.92■■□□□ 1.26
RABGGTA-201ENST00000216840 WASLO00401 505 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
RABGGTA-201ENST00000216840 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
RABGGTA-201ENST00000216840 ATP7BP35670 1465 aa22.9■■□□□ 1.26
RABGGTA-201ENST00000216840 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
RABGGTA-201ENST00000216840 KIF20BQ96Q89 1820 aa22.89■■□□□ 1.26
RABGGTA-201ENST00000216840 ROBO2Q9HCK4 1378 aa22.89■■□□□ 1.26
RABGGTA-201ENST00000216840 CDCA7LQ96GN5 454 aa22.89■■□□□ 1.25
RABGGTA-201ENST00000216840 MTHFSP49914 203 aa22.87■■□□□ 1.25
RABGGTA-201ENST00000216840 FYB1O15117 783 aa22.86■■□□□ 1.25
RABGGTA-201ENST00000216840 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
RABGGTA-201ENST00000216840 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
RABGGTA-201ENST00000216840 CCDC146Q8IYE0 955 aa22.86■■□□□ 1.25
RABGGTA-201ENST00000216840 GGNBP2Q9H3C7 697 aa22.86■■□□□ 1.25
RABGGTA-201ENST00000216840 ADAMTSL3P82987 1691 aa22.86■■□□□ 1.25
RABGGTA-201ENST00000216840 PTPRUQ92729 1446 aa22.85■■□□□ 1.25
RABGGTA-201ENST00000216840 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
RABGGTA-201ENST00000216840 SLC26A8Q96RN1 970 aa22.85■■□□□ 1.25
RABGGTA-201ENST00000216840 ADGRB2O60241 1585 aa22.85■■□□□ 1.25
RABGGTA-201ENST00000216840 ZNF521Q96K83 1311 aa22.84■■□□□ 1.25
RABGGTA-201ENST00000216840 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa22.84■■□□□ 1.25
RABGGTA-201ENST00000216840 TBX22Q9Y458 520 aa22.83■■□□□ 1.25
RABGGTA-201ENST00000216840 DIP2AQ14689 1571 aa22.83■■□□□ 1.25
RABGGTA-201ENST00000216840 CFAP53Q96M91 514 aa22.83■■□□□ 1.24
RABGGTA-201ENST00000216840 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
RABGGTA-201ENST00000216840 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
RABGGTA-201ENST00000216840 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa22.81■■□□□ 1.24
RABGGTA-201ENST00000216840 APAF1O14727 1248 aa22.8■■□□□ 1.24
RABGGTA-201ENST00000216840 PPP4R2Q9NY27 417 aa22.8■■□□□ 1.24
RABGGTA-201ENST00000216840 RCAN3Q9UKA8 241 aa22.8■■□□□ 1.24
RABGGTA-201ENST00000216840 MON2Q7Z3U7 1717 aa22.79■■□□□ 1.24
RABGGTA-201ENST00000216840 AKAP12Q02952 1782 aa22.79■■□□□ 1.24
RABGGTA-201ENST00000216840 CCDC61Q9Y6R9 512 aa22.78■■□□□ 1.24
RABGGTA-201ENST00000216840 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
RABGGTA-201ENST00000216840 ITSN1Q15811 1721 aa22.78■■□□□ 1.24
RABGGTA-201ENST00000216840 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa22.77■■□□□ 1.24
RABGGTA-201ENST00000216840 PRR36Q9H6K5 1346 aa22.77■■□□□ 1.24
RABGGTA-201ENST00000216840 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
RABGGTA-201ENST00000216840 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa22.76■■□□□ 1.23
RABGGTA-201ENST00000216840 PTCH1Q13635 1447 aa22.76■■□□□ 1.23
RABGGTA-201ENST00000216840 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP22.76■■□□□ 1.23
RABGGTA-201ENST00000216840 NGEFQ8N5V2 710 aa22.76■■□□□ 1.23
RABGGTA-201ENST00000216840 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa22.75■■□□□ 1.23
RABGGTA-201ENST00000216840 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
RABGGTA-201ENST00000216840 GOLGA2Q08379 1002 aa22.75■■□□□ 1.23
RABGGTA-201ENST00000216840 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
RABGGTA-201ENST00000216840 RRP1P56182 461 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
RABGGTA-201ENST00000216840 RUNDC1Q96C34 613 aa22.73■■□□□ 1.23
RABGGTA-201ENST00000216840 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
RABGGTA-201ENST00000216840 DUSP27Q5VZP5 1158 aa22.73■■□□□ 1.23
RABGGTA-201ENST00000216840 IQSEC2Q5JU85 1478 aa22.72■■□□□ 1.23
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