RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000056233.3

NFE2L3-201, Transcript of nuclear factor, erythroid 2 like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NFE2L3, Length 3,686 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L3-201ENST00000056233 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
NFE2L3-201ENST00000056233 KIF14Q15058 1648 aa21■□□□□ 0.95
NFE2L3-201ENST00000056233 FBLN1P23142 703 aa21■□□□□ 0.95
NFE2L3-201ENST00000056233 SSFA2P28290 1259 aa21■□□□□ 0.95
NFE2L3-201ENST00000056233 USP19O94966 1318 aa21■□□□□ 0.95
NFE2L3-201ENST00000056233 KANK1Q14678 1352 aa20.99■□□□□ 0.95
NFE2L3-201ENST00000056233 TRIM27P14373 513 aa20.99■□□□□ 0.95
NFE2L3-201ENST00000056233 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
NFE2L3-201ENST00000056233 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa20.99■□□□□ 0.95
NFE2L3-201ENST00000056233 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa20.97■□□□□ 0.95
NFE2L3-201ENST00000056233 ARHGAP5Q13017 1502 aa20.97■□□□□ 0.95
NFE2L3-201ENST00000056233 SLC4A10Q6U841 1118 aa20.97■□□□□ 0.95
NFE2L3-201ENST00000056233 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
NFE2L3-201ENST00000056233 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa20.96■□□□□ 0.95
NFE2L3-201ENST00000056233 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa20.96■□□□□ 0.95
NFE2L3-201ENST00000056233 NSD3Q9BZ95 1437 aa20.95■□□□□ 0.94
NFE2L3-201ENST00000056233 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
NFE2L3-201ENST00000056233 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
NFE2L3-201ENST00000056233 CASC1Q6TDU7 716 aa20.93■□□□□ 0.94
NFE2L3-201ENST00000056233 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
NFE2L3-201ENST00000056233 NUTM2FA1L443 756 aa20.93■□□□□ 0.94
NFE2L3-201ENST00000056233 A2MP01023 1474 aa20.92■□□□□ 0.94
NFE2L3-201ENST00000056233 CLCN1P35523 988 aa20.91■□□□□ 0.94
NFE2L3-201ENST00000056233 MAGI2Q86UL8 1455 aa20.91■□□□□ 0.94
NFE2L3-201ENST00000056233 MBD5Q9P267 1494 aa20.91■□□□□ 0.94
NFE2L3-201ENST00000056233 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
NFE2L3-201ENST00000056233 CHD1LQ86WJ1 897 aa20.91■□□□□ 0.94
NFE2L3-201ENST00000056233 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.94
NFE2L3-201ENST00000056233 FAM135AQ9P2D6 1515 aa20.89■□□□□ 0.93
NFE2L3-201ENST00000056233 ZNF521Q96K83 1311 aa20.88■□□□□ 0.93
NFE2L3-201ENST00000056233 GAS2L3Q86XJ1 694 aa20.88■□□□□ 0.93
NFE2L3-201ENST00000056233 WDR63Q8IWG1 891 aa20.88■□□□□ 0.93
NFE2L3-201ENST00000056233 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa20.88■□□□□ 0.93
NFE2L3-201ENST00000056233 ANTXR1Q9H6X2 564 aa20.88■□□□□ 0.93
NFE2L3-201ENST00000056233 GPRASP1Q5JY77 1395 aa20.88■□□□□ 0.93
NFE2L3-201ENST00000056233 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa20.88■□□□□ 0.93
NFE2L3-201ENST00000056233 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
NFE2L3-201ENST00000056233 CCDC141Q6ZP82 1450 aa20.87■□□□□ 0.93
NFE2L3-201ENST00000056233 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
NFE2L3-201ENST00000056233 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
NFE2L3-201ENST00000056233 NECTIN2Q92692 538 aa20.86■□□□□ 0.93
NFE2L3-201ENST00000056233 PRKAR2BP31323 418 aa20.86■□□□□ 0.93
NFE2L3-201ENST00000056233 TMPOP42166 694 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
NFE2L3-201ENST00000056233 PRDM10Q9NQV6 1147 aa20.86■□□□□ 0.93
NFE2L3-201ENST00000056233 CHAMP1Q96JM3 812 aa20.86■□□□□ 0.93
NFE2L3-201ENST00000056233 RRP9O43818 475 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
NFE2L3-201ENST00000056233 TAOK2Q9UL54 1235 aa20.85■□□□□ 0.93
NFE2L3-201ENST00000056233 DISP1Q96F81 1524 aa20.85■□□□□ 0.93
NFE2L3-201ENST00000056233 NGEFQ8N5V2 710 aa20.85■□□□□ 0.93
NFE2L3-201ENST00000056233 RILPL2Q969X0 211 aa20.85■□□□□ 0.93
NFE2L3-201ENST00000056233 CHMP3Q9Y3E7 222 aa20.83■□□□□ 0.93
NFE2L3-201ENST00000056233 GRIN2AQ12879 1464 aa20.83■□□□□ 0.92
NFE2L3-201ENST00000056233 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.92
NFE2L3-201ENST00000056233 GAS2L2Q8NHY3 880 aa20.83■□□□□ 0.92
NFE2L3-201ENST00000056233 ATP10BO94823 1461 aa20.82■□□□□ 0.92
NFE2L3-201ENST00000056233 EVC2Q86UK5 1308 aa20.82■□□□□ 0.92
NFE2L3-201ENST00000056233 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa20.82■□□□□ 0.92
NFE2L3-201ENST00000056233 ST18O60284 1047 aa20.82■□□□□ 0.92
NFE2L3-201ENST00000056233 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
NFE2L3-201ENST00000056233 DCTN1Q14203 1278 aa20.81■□□□□ 0.92
NFE2L3-201ENST00000056233 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa20.81■□□□□ 0.92
NFE2L3-201ENST00000056233 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
NFE2L3-201ENST00000056233 KIF16BQ96L93 1317 aa20.81■□□□□ 0.92
NFE2L3-201ENST00000056233 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.81■□□□□ 0.92
NFE2L3-201ENST00000056233 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa20.81■□□□□ 0.92
NFE2L3-201ENST00000056233 SYNJ2O15056 1496 aa20.8■□□□□ 0.92
NFE2L3-201ENST00000056233 SYCE3A1L190 88 aa20.8■□□□□ 0.92
NFE2L3-201ENST00000056233 ERBB4Q15303 1308 aa20.8■□□□□ 0.92
NFE2L3-201ENST00000056233 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP20.8■□□□□ 0.92
NFE2L3-201ENST00000056233 CDC45O75419 566 aa20.79■□□□□ 0.92
NFE2L3-201ENST00000056233 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
NFE2L3-201ENST00000056233 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
NFE2L3-201ENST00000056233 CCDC173Q0VFZ6 552 aa20.79■□□□□ 0.92
NFE2L3-201ENST00000056233 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
NFE2L3-201ENST00000056233 TERF2IPQ9NYB0 399 aa20.78■□□□□ 0.92
NFE2L3-201ENST00000056233 MLECQ14165 292 aa20.78■□□□□ 0.92
NFE2L3-201ENST00000056233 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
NFE2L3-201ENST00000056233 KIAA0556O60303 1618 aa20.78■□□□□ 0.92
NFE2L3-201ENST00000056233 ZSCAN30Q86W11 494 aa20.77■□□□□ 0.92
NFE2L3-201ENST00000056233 GDPD2Q9HCC8 539 aa20.77■□□□□ 0.92
NFE2L3-201ENST00000056233 DTNBO60941 627 aa20.77■□□□□ 0.92
NFE2L3-201ENST00000056233 NEK4P51957 841 aa20.77■□□□□ 0.92
NFE2L3-201ENST00000056233 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
NFE2L3-201ENST00000056233 UQCRHLA0A096LP55 91 aa20.77■□□□□ 0.92
NFE2L3-201ENST00000056233 UQCRHP07919 91 aa20.77■□□□□ 0.92
NFE2L3-201ENST00000056233 TSHZ3Q63HK5 1081 aa20.76■□□□□ 0.91
NFE2L3-201ENST00000056233 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
NFE2L3-201ENST00000056233 BAG4O95429 457 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
NFE2L3-201ENST00000056233 NINLQ9Y2I6 1382 aa20.76■□□□□ 0.91
NFE2L3-201ENST00000056233 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
NFE2L3-201ENST00000056233 ANO2Q9NQ90 1003 aa20.76■□□□□ 0.91
NFE2L3-201ENST00000056233 PTMSP20962 102 aa20.75■□□□□ 0.91
NFE2L3-201ENST00000056233 KIAA2012Q0VF49 1180 aa20.74■□□□□ 0.91
NFE2L3-201ENST00000056233 AAMPQ13685 434 aa20.74■□□□□ 0.91
NFE2L3-201ENST00000056233 ZNF428Q96B54 188 aa20.74■□□□□ 0.91
NFE2L3-201ENST00000056233 MRC2Q9UBG0 1479 aa20.73■□□□□ 0.91
NFE2L3-201ENST00000056233 SYCP2Q9BX26 1530 aa20.73■□□□□ 0.91
NFE2L3-201ENST00000056233 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
NFE2L3-201ENST00000056233 SCAPERQ9BY12 1400 aa20.73■□□□□ 0.91
NFE2L3-201ENST00000056233 ATAD2Q6PL18 1390 aa20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.8 ms