RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000107227.3

Tmod4-202, Transcript of Tropomodulin-4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Tmod4, Length 1,260 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4-202ENSMUST00000107227 N4bp2F8VQG7 1678 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Tex14Q7M6U3 1450 aa18.76■□□□□ 0.59
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Col22a1E9Q7P1 1613 aa18.75■□□□□ 0.59
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Emilin2Q8K482 1074 aa18.75■□□□□ 0.59
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Kif20bQ80WE4 1774 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Ppip5k1A2ARP1 1436 aa18.74■□□□□ 0.59
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Plxnc1Q9QZC2 1574 aa18.73■□□□□ 0.59
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Farp2Q91VS8 1065 aa18.73■□□□□ 0.59
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Wnk3Q80XP9 1757 aa18.73■□□□□ 0.59
Tmod4-202ENSMUST00000107227 MaddQ80U28 1577 aa18.72■□□□□ 0.59
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Kcna6Q61923 529 aa18.72■□□□□ 0.59
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Acsbg1Q99PU5 721 aa18.7■□□□□ 0.58
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Kdm2bQ6P1G2 1309 aa18.7■□□□□ 0.58
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Ddx54Q8K4L0 874 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Usp32F8VPZ3 1604 aa18.68■□□□□ 0.58
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Robo1O89026 1612 aa18.68■□□□□ 0.58
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Q3UJC8 639 aa18.68■□□□□ 0.58
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Arhgef1Q61210 920 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Mia2Q91ZV0 1396 aa18.67■□□□□ 0.58
Tmod4-202ENSMUST00000107227 D430041D05RikF6ZGR6 1678 aa18.66■□□□□ 0.58
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Stk26Q99JT2 416 aa18.66■□□□□ 0.58
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Ccdc6D3YZP9 469 aa18.63■□□□□ 0.57
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Utp14aQ640M1 767 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Sgsm1Q8BPQ7 1093 aa18.63■□□□□ 0.57
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Fam135bQ9DAI6 1403 aa18.63■□□□□ 0.57
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Cep170bQ80U49 1574 aa18.61■□□□□ 0.57
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Mphosph9A6H5Y1 991 aa18.61■□□□□ 0.57
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Psrc1Q9D0P7 329 aa18.61■□□□□ 0.57
Tmod4-202ENSMUST00000107227 C5P06684 1680 aa18.6■□□□□ 0.57
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Dot1lQ6XZL8 1540 aa18.6■□□□□ 0.57
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Mroh3A0A1D5RM54 893 aa18.6■□□□□ 0.57
Tmod4-202ENSMUST00000107227 InhbeO08717 350 aa18.6■□□□□ 0.57
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Lrrc59Q922Q8 307 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Camta1A2A891 1682 aa18.59■□□□□ 0.57
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Als2Q920R0 1651 aa18.59■□□□□ 0.57
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Rims1Q99NE5 1463 aa18.58■□□□□ 0.57
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Idi1P58044 227 aa18.58■□□□□ 0.56
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Tmem2Q5FWI3 1383 aa18.57■□□□□ 0.56
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Sox12Q04890 314 aa18.57■□□□□ 0.56
Tmod4-202ENSMUST00000107227 PtpruB1AUH1 1446 aa18.56■□□□□ 0.56
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Washc2Q6PGL7 1334 aa18.55■□□□□ 0.56
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Atp7bQ64446 1462 aa18.55■□□□□ 0.56
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Tnrc6cQ3UHC0 1690 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Kif1aP33173 1695 aa18.54■□□□□ 0.56
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Atp10bB1AWN4 1474 aa18.52■□□□□ 0.56
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Tnks1bp1P58871 1720 aa18.51■□□□□ 0.55
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Ltbp1Q8CG19 1712 aa18.51■□□□□ 0.55
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Pkd2O35245 966 aa18.5■□□□□ 0.55
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Slc52a2Q9D8F3 450 aa18.5■□□□□ 0.55
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Tulp4Q9JIL5 1547 aa18.49■□□□□ 0.55
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Sugp2Q8CH09 1067 aa18.49■□□□□ 0.55
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Abca15E9PWH4 1668 aa18.47■□□□□ 0.55
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Fan1Q69ZT1 1020 aa18.47■□□□□ 0.55
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Cadps2Q8BYR5 1297 aa18.47■□□□□ 0.55
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Kdm2aP59997 1161 aa18.46■□□□□ 0.55
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Adamts13Q769J6 1426 aa18.46■□□□□ 0.55
Tmod4-202ENSMUST00000107227 VirmaA2AIV2 1811 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Grwd1Q810D6 446 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Adamtsl1Q8BLI0 1745 aa18.45■□□□□ 0.54
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Wdr17E9Q271 1322 aa18.45■□□□□ 0.54
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Lrrc7Q80TE7 1490 aa18.45■□□□□ 0.54
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Shank2Q80Z38 1476 aa18.45■□□□□ 0.54
Tmod4-202ENSMUST00000107227 NgefQ8CHT1 710 aa18.44■□□□□ 0.54
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Sirt1Q923E4 737 aa18.44■□□□□ 0.54
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Ubap1lG3UW59 384 aa18.43■□□□□ 0.54
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Puf60Q3UEB3 564 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Slc35g1Q8BY79 368 aa18.43■□□□□ 0.54
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Kiaa0319Q5SZV5 1081 aa18.42■□□□□ 0.54
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Hdac5Q9Z2V6 1113 aa18.42■□□□□ 0.54
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Txnrd1Q9JMH6 613 aa18.41■□□□□ 0.54
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Abca14E9Q8F8 1683 aa18.41■□□□□ 0.54
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Sf3b2Q3UJB0 878 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Dixdc1Q80Y83 711 aa18.4■□□□□ 0.54
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Cdhr2E9Q7P9 1308 aa18.4■□□□□ 0.54
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Cdk5rap2Q8K389 1822 aa18.39■□□□□ 0.53
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Plekhg1F6S200 1446 aa18.39■□□□□ 0.53
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Srpk2O54781 681 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
Tmod4-202ENSMUST00000107227 OscarQ8VBT3 265 aa18.37■□□□□ 0.53
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Nfat5Q9WV30 1534 aa18.37■□□□□ 0.53
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Ifit1bl1D3Z6F0 470 aa18.36■□□□□ 0.53
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Col16a1Q8BLX7 1580 aa18.36■□□□□ 0.53
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Os9Q8K2C7 672 aa18.36■□□□□ 0.53
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Atp2b2Q9R0K7 1198 aa18.36■□□□□ 0.53
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Mink1Q9JM52 1308 aa18.35■□□□□ 0.53
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Ccdc129Q14B48 1034 aa18.35■□□□□ 0.53
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Znf316Q6PGE4 1016 aa18.34■□□□□ 0.53
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Ly75Q60767 1723 aa18.34■□□□□ 0.53
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Zmym3Q9JLM4 1370 aa18.33■□□□□ 0.53
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Ap3b2Q9JME5 1082 aa18.33■□□□□ 0.52
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Rock1P70335 1354 aa18.32■□□□□ 0.52
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Cacna1sQ02789 1880 aa18.32■□□□□ 0.52
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Nrxn1Q9CS84 1514 aa18.32■□□□□ 0.52
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Pola1P33609 1465 aa18.32■□□□□ 0.52
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Cep152A2AUM9 1736 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Polr3aB2RXC6 1390 aa18.3■□□□□ 0.52
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Gm20521D3Z5F7 333 aa18.3■□□□□ 0.52
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Rtl5Q5DTT4 599 aa18.3■□□□□ 0.52
Tmod4-202ENSMUST00000107227 Slc34a2Q9DBP0 697 aa18.3■□□□□ 0.52
Tmod4-202ENSMUST00000107227 PaskQ8CEE6 1383 aa18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 28.6 ms