RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000041614.14

Ttc13-201, Transcript of Tetratricopeptide repeat domain 13, mousemouse

TSL 2 BASIC

Gene Ttc13, Length 3,038 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Caskin1Q6P9K8 1431 aa21.87■■□□□ 1.09
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Kiaa1107Q80TK0 1369 aa21.87■■□□□ 1.09
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Arid3cA6PWV5 409 aa21.87■■□□□ 1.09
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Ralbp1Q62172 648 aa21.87■■□□□ 1.09
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Nsfl1cQ9CZ44 370 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Apaf1O88879 1249 aa21.86■■□□□ 1.09
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Znf521Q6KAS7 1311 aa21.86■■□□□ 1.09
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Igf1rQ60751 1373 aa21.86■■□□□ 1.09
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Kiaa1210E9Q0C6 1637 aa21.84■■□□□ 1.09
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Aplp1Q03157 653 aa21.84■■□□□ 1.09
Ttc13-201ENSMUST00000041614 IbspQ61711 324 aa21.83■■□□□ 1.09
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Sbno1Q689Z5 1390 aa21.83■■□□□ 1.08
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Terf2O35144 541 aa21.82■■□□□ 1.08
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Kif20aP97329 887 aa21.82■■□□□ 1.08
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Abca8bQ8K440 1620 aa21.82■■□□□ 1.08
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Fmn2Q9JL04 1578 aa21.82■■□□□ 1.08
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Pde4cQ3UEI1 686 aa21.81■■□□□ 1.08
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Fan1Q69ZT1 1020 aa21.81■■□□□ 1.08
Ttc13-201ENSMUST00000041614 AU019823E9PUQ3 292 aa21.81■■□□□ 1.08
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Kif2cQ922S8 721 aa21.81■■□□□ 1.08
Ttc13-201ENSMUST00000041614 AI481877A2ALV5 1481 aa21.81■■□□□ 1.08
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Dmrtc1Q9D9R7 182 aa21.8■■□□□ 1.08
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Trim44Q9QXA7 346 aa21.8■■□□□ 1.08
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Rnf17Q99MV7 1640 aa21.79■■□□□ 1.08
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Gm156Q58A37 223 aa21.79■■□□□ 1.08
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Col17a1Q07563 1470 aa21.79■■□□□ 1.08
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Stk24Q99KH8 431 aa21.79■■□□□ 1.08
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Gtf2e1Q9D0D5 440 aa21.79■■□□□ 1.08
Ttc13-201ENSMUST00000041614 PogkQ80TC5 607 aa21.78■■□□□ 1.08
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Spag9Q58A65 1321 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Nutm1Q8BHP2 1126 aa21.77■■□□□ 1.07
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Usp40Q8BWR4 1235 aa21.77■■□□□ 1.07
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Map3k5O35099 1380 aa21.77■■□□□ 1.07
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Gm32742A0A1B0GT42 1604 aa21.76■■□□□ 1.07
Ttc13-201ENSMUST00000041614 4933402E13RikQ9D4D2 429 aa21.76■■□□□ 1.07
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Senp3Q9EP97 568 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
Ttc13-201ENSMUST00000041614 P2rx7Q9Z1M0 595 aa21.76■■□□□ 1.07
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Cog6Q8R3I3 657 aa21.75■■□□□ 1.07
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Rbm10Q99KG3 930 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Tulp4Q9JIL5 1547 aa21.75■■□□□ 1.07
Ttc13-201ENSMUST00000041614 GorabQ8BRM2 368 aa21.74■■□□□ 1.07
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Edc4Q3UJB9 1406 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Ddit3P35639 168 aa21.73■■□□□ 1.07
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Rrp12Q6P5B0 1295 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
Ttc13-201ENSMUST00000041614 GsdmaQ9EST1 446 aa21.72■■□□□ 1.07
Ttc13-201ENSMUST00000041614 U2af1Q9D883 239 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Adgrl2Q8JZZ7 1487 aa21.71■■□□□ 1.07
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Kif18aQ91WD7 886 aa21.71■■□□□ 1.07
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Phlpp2Q8BXA7 1320 aa21.7■■□□□ 1.06
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Stk11ipQ3TAA7 1072 aa21.7■■□□□ 1.06
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Srpk2O54781 681 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Chrna2Q91X60 512 aa21.68■■□□□ 1.06
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Tfip11Q9ERA6 838 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Atl3Q91YH5 541 aa21.66■■□□□ 1.06
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Cfap74Q3UY96 1578 aa21.66■■□□□ 1.06
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Pdcd11Q6NS46 1862 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Adgrl3Q80TS3 1537 aa21.66■■□□□ 1.06
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Erich6bQ9D4S6 220 aa21.66■■□□□ 1.06
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Zfyve16Q80U44 1528 aa21.64■■□□□ 1.05
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Irf5P56477 497 aa21.64■■□□□ 1.05
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Pdia4P08003 638 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Ccar1Q8CH18 1146 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Fam135bQ9DAI6 1403 aa21.63■■□□□ 1.05
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Nectin2P32507 530 aa21.63■■□□□ 1.05
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Maco1Q7TQE6 664 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Abcc3B2RX12 1523 aa21.63■■□□□ 1.05
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Map4k4P97820 1233 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Tsen2Q6P7W5 460 aa21.63■■□□□ 1.05
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Ppip5k1A2ARP1 1436 aa21.62■■□□□ 1.05
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Map7O88735 730 aa21.61■■□□□ 1.05
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Q4VA45 678 aa21.61■■□□□ 1.05
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Dhx16G3X8X0 1044 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Abcc6Q9R1S7 1498 aa21.6■■□□□ 1.05
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Dusp27Q148W8 1138 aa21.6■■□□□ 1.05
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Myom2Q14BI5 1463 aa21.6■■□□□ 1.05
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Erbb4Q61527 1308 aa21.6■■□□□ 1.05
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Rsph3aQ3UFY4 516 aa21.6■■□□□ 1.05
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Ccdc60Q8C4J0 545 aa21.6■■□□□ 1.05
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Kidins220E9Q9B7 1793 aa21.6■■□□□ 1.05
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Cdc42bpbQ7TT50 1713 aa21.59■■□□□ 1.05
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Kdm5aQ3UXZ9 1690 aa21.59■■□□□ 1.05
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Tmco5bQ80X59 307 aa21.58■■□□□ 1.05
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Pola1P33609 1465 aa21.57■■□□□ 1.04
Ttc13-201ENSMUST00000041614 IbtkQ6ZPR6 1352 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Abca9Q8K449 1623 aa21.56■■□□□ 1.04
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Zranb1Q7M760 708 aa21.55■■□□□ 1.04
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Mast1Q9R1L5 1570 aa21.55■■□□□ 1.04
Ttc13-201ENSMUST00000041614 SkilQ60665 675 aa21.54■■□□□ 1.04
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Kif3bQ61771 747 aa21.53■■□□□ 1.04
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Ripk4Q9ERK0 786 aa21.53■■□□□ 1.04
Ttc13-201ENSMUST00000041614 PtmaP26350 111 aa21.53■■□□□ 1.04
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Ddrgk1Q80WW9 315 aa21.53■■□□□ 1.04
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Hecw1Q8K4P8 1604 aa21.53■■□□□ 1.04
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Stag3O70576 1240 aa21.53■■□□□ 1.04
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Bloc1s4Q8VED2 215 aa21.53■■□□□ 1.04
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Cald1E9QA15 768 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Ccdc146E9Q9F7 977 aa21.51■■□□□ 1.03
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Nek4Q9Z1J2 792 aa21.51■■□□□ 1.03
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Rbm25B2RY56 838 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
Ttc13-201ENSMUST00000041614 Clcn1Q64347 994 aa21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 8.9 ms