RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000031145.6

Pdcl2-201, Transcript of Phosducin-like protein 2, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pdcl2, Length 1,181 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Synj2Q9D2G5 1434 aa12.49□□□□□ -0.41
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Eea1Q8BL66 1411 aa12.48□□□□□ -0.41
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Wdr44Q6NVE8 915 aa12.48□□□□□ -0.41
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ppfibp2O35711 882 aa12.47□□□□□ -0.41
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Mug1P28665 1476 aa12.46□□□□□ -0.41
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Fam193bQ3U2K0 892 aa12.46□□□□□ -0.41
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Map3k7Q62073 579 aa12.46□□□□□ -0.41
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Trim32Q8CH72 655 aa12.46□□□□□ -0.41
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Psme1P97371 249 aa12.44□□□□□ -0.42
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Q9CQ90 155 aa12.44□□□□□ -0.42
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 SmapQ9R0P4 181 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Arhgap5P97393 1501 aa12.43□□□□□ -0.42
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 OvosQ3UU35 1456 aa12.42□□□□□ -0.42
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Abca9Q8K449 1623 aa12.42□□□□□ -0.42
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 ZfrO88532 1074 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Dab2P98078 766 aa12.42□□□□□ -0.42
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Wbp1lQ8BGW2 348 aa12.42□□□□□ -0.42
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Pcf11G3X9Z4 1553 aa12.42□□□□□ -0.42
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Hecw2Q6I6G8 1578 aa12.42□□□□□ -0.42
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ercc6l2Q9JIM3 1537 aa12.42□□□□□ -0.42
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Yeats2Q3TUF7 1407 aa12.41□□□□□ -0.42
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ptch1Q61115 1434 aa12.41□□□□□ -0.42
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Brwd3A2AHJ4 1799 aa12.4□□□□□ -0.42
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 CntlnA2AM05 1397 aa12.4□□□□□ -0.42
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Spata31d1aE9QA35 1336 aa12.39□□□□□ -0.43
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 NpatQ8BMA5 1420 aa12.39□□□□□ -0.43
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Emp3O35912 163 aa12.39□□□□□ -0.43
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Tie1Q06806 1134 aa12.39□□□□□ -0.43
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Arid5bQ8BM75 1188 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Camsap2Q8C1B1 1461 aa12.39□□□□□ -0.43
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Zbtb38Q3LR78 1197 aa12.38□□□□□ -0.43
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Prom2Q3UUY6 835 aa12.38□□□□□ -0.43
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Nob1Q8BW10 403 aa12.38□□□□□ -0.43
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 PtprmP28828 1452 aa12.38□□□□□ -0.43
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Klra1P20937 262 aa12.37□□□□□ -0.43
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ppp4cP97470 307 aa12.37□□□□□ -0.43
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Rtl5Q5DTT4 599 aa12.37□□□□□ -0.43
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Krtap3-2Q9D638 99 aa12.37□□□□□ -0.43
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Krtap3-3Q9D7P0 99 aa12.37□□□□□ -0.43
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Tdrd9Q14BI7 1383 aa12.37□□□□□ -0.43
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Lmo7E9PYF4 1699 aaKnown RBP12.37□□□□□ -0.43
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Atp10aO54827 1508 aa12.37□□□□□ -0.43
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa12.37□□□□□ -0.43
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Large2Q5XPT3 690 aa12.36□□□□□ -0.43
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Hyal3Q8VEI3 412 aa12.36□□□□□ -0.43
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Kiaa1551Q5DTW7 1521 aa12.36□□□□□ -0.43
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Trappc8E9PWG2 1437 aa12.35□□□□□ -0.43
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Erich3F6QRE9 1637 aa12.34□□□□□ -0.43
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Fam208aQ69ZR9 1610 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 AaasP58742 546 aa12.34□□□□□ -0.43
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Vars2Q3U2A8 1060 aa12.34□□□□□ -0.43
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Qser1A2BIE1 1698 aa12.34□□□□□ -0.43
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Kif14L0N7N1 1674 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Bcl2l13P59017 434 aa12.33□□□□□ -0.44
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Caskin2Q8VHK1 1201 aa12.33□□□□□ -0.44
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Sart1Q9Z315 806 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.44
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Neurl4Q5NCX5 1563 aa12.32□□□□□ -0.44
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Jph1Q9ET80 660 aa12.32□□□□□ -0.44
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 NexmifQ5DTT1 1515 aa12.32□□□□□ -0.44
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Gm1043A0A140LJC2 1431 aa12.31□□□□□ -0.44
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 OplahQ8K010 1288 aa12.31□□□□□ -0.44
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Fchsd2Q3USJ8 740 aa12.3□□□□□ -0.44
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Afap1Q80YS6 731 aa12.3□□□□□ -0.44
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Dip2cE9PWR4 1557 aa12.3□□□□□ -0.44
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Kiaa0556Q8C753 1610 aa12.29□□□□□ -0.44
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Kcnn2P58390 839 aa12.29□□□□□ -0.44
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 TsksO54887 585 aa12.28□□□□□ -0.44
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Hmx2P43687 273 aa12.28□□□□□ -0.44
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Wfs1P56695 890 aa12.28□□□□□ -0.44
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Rnf40Q3U319 1001 aa12.27□□□□□ -0.45
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Pip4k2bQ80XI4 416 aa12.27□□□□□ -0.45
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Sirt1Q923E4 737 aa12.27□□□□□ -0.45
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Cdc42bpaQ3UU96 1719 aa12.27□□□□□ -0.45
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ahdc1Q6PAL7 1594 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Rbm46P86049 533 aa12.26□□□□□ -0.45
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Zc3h15Q3TIV5 426 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Tmem132aQ922P8 1018 aa12.26□□□□□ -0.45
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Naip1Q9QWK5 1403 aa12.26□□□□□ -0.45
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Adamtsl3G3UXC7 1706 aa12.25□□□□□ -0.45
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Fbxo41Q6NS60 873 aa12.25□□□□□ -0.45
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Tmub1Q9JMG3 245 aa12.25□□□□□ -0.45
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Map3k5O35099 1380 aa12.25□□□□□ -0.45
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ccnb3Q810T2 1396 aa12.25□□□□□ -0.45
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 RereQ80TZ9 1558 aa12.25□□□□□ -0.45
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ankrd34aB2RW11 495 aa12.24□□□□□ -0.45
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Dennd4bQ3U1Y4 1499 aa12.24□□□□□ -0.45
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Chst12Q99LL3 419 aa12.24□□□□□ -0.45
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Scube2Q9JJS0 997 aa12.24□□□□□ -0.45
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Kdm5cP41230 1554 aa12.23□□□□□ -0.45
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Znf423Q80TS5 1292 aa12.23□□□□□ -0.45
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Kidins220E9Q9B7 1793 aa12.23□□□□□ -0.45
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Tiam1Q60610 1591 aa12.22□□□□□ -0.45
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Kri1Q8VDQ9 704 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Rrp7aQ9D1C9 280 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Hic1Q9R1Y5 733 aa12.22□□□□□ -0.45
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Zmym4A2A791 1549 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Caskin1Q6P9K8 1431 aa12.21□□□□□ -0.45
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Tor1aip2Q8BYU6 502 aa12.21□□□□□ -0.45
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Cfap74Q3UY96 1578 aa12.21□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 37.1 ms