Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET80

Jph1, Junctophilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jph1Q9ET80 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
Jph1Q9ET80 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Jph1Q9ET80 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Jph1Q9ET80 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Jph1Q9ET80 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Jph1Q9ET80 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Jph1Q9ET80 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Jph1Q9ET80 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Jph1Q9ET80 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Jph1Q9ET80 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Jph1Q9ET80 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Jph1Q9ET80 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Jph1Q9ET80 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Jph1Q9ET80 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Jph1Q9ET80 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Jph1Q9ET80 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Jph1Q9ET80 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Jph1Q9ET80 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Jph1Q9ET80 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Jph1Q9ET80 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Jph1Q9ET80 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Jph1Q9ET80 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Jph1Q9ET80 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Jph1Q9ET80 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Jph1Q9ET80 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Jph1Q9ET80 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Jph1Q9ET80 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Jph1Q9ET80 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Jph1Q9ET80 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Jph1Q9ET80 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Jph1Q9ET80 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Jph1Q9ET80 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Jph1Q9ET80 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Jph1Q9ET80 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Jph1Q9ET80 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Jph1Q9ET80 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Jph1Q9ET80 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Jph1Q9ET80 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Jph1Q9ET80 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Jph1Q9ET80 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Jph1Q9ET80 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Jph1Q9ET80 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Jph1Q9ET80 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Jph1Q9ET80 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Jph1Q9ET80 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Jph1Q9ET80 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Jph1Q9ET80 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Jph1Q9ET80 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Jph1Q9ET80 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Jph1Q9ET80 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Jph1Q9ET80 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Jph1Q9ET80 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Jph1Q9ET80 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Jph1Q9ET80 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Jph1Q9ET80 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Jph1Q9ET80 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Jph1Q9ET80 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Jph1Q9ET80 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Jph1Q9ET80 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Jph1Q9ET80 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Jph1Q9ET80 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Jph1Q9ET80 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Jph1Q9ET80 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Jph1Q9ET80 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Jph1Q9ET80 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Jph1Q9ET80 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Jph1Q9ET80 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Jph1Q9ET80 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Jph1Q9ET80 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Jph1Q9ET80 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Jph1Q9ET80 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Jph1Q9ET80 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Jph1Q9ET80 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Jph1Q9ET80 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Jph1Q9ET80 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Jph1Q9ET80 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Jph1Q9ET80 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Jph1Q9ET80 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Jph1Q9ET80 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Jph1Q9ET80 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Jph1Q9ET80 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Jph1Q9ET80 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Jph1Q9ET80 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Jph1Q9ET80 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Jph1Q9ET80 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Jph1Q9ET80 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Jph1Q9ET80 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Jph1Q9ET80 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Jph1Q9ET80 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Jph1Q9ET80 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Jph1Q9ET80 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Jph1Q9ET80 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Jph1Q9ET80 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Jph1Q9ET80 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Jph1Q9ET80 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Jph1Q9ET80 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Jph1Q9ET80 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Jph1Q9ET80 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Jph1Q9ET80 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Jph1Q9ET80 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms