Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Y5

Hic1, Hypermethylated in cancer 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hic1Q9R1Y5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC43.77■■■■■ 4.6
Hic1Q9R1Y5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
Hic1Q9R1Y5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
Hic1Q9R1Y5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC38.07■■■■□ 3.68
Hic1Q9R1Y5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
Hic1Q9R1Y5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
Hic1Q9R1Y5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Hic1Q9R1Y5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Hic1Q9R1Y5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Hic1Q9R1Y5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Hic1Q9R1Y5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
Hic1Q9R1Y5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Hic1Q9R1Y5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Hic1Q9R1Y5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Hic1Q9R1Y5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
Hic1Q9R1Y5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Hic1Q9R1Y5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Hic1Q9R1Y5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Hic1Q9R1Y5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Hic1Q9R1Y5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Hic1Q9R1Y5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Hic1Q9R1Y5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Hic1Q9R1Y5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
Hic1Q9R1Y5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Hic1Q9R1Y5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Hic1Q9R1Y5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
Hic1Q9R1Y5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Hic1Q9R1Y5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Hic1Q9R1Y5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Hic1Q9R1Y5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Hic1Q9R1Y5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Hic1Q9R1Y5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Hic1Q9R1Y5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
Hic1Q9R1Y5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Hic1Q9R1Y5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Hic1Q9R1Y5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Hic1Q9R1Y5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Hic1Q9R1Y5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
Hic1Q9R1Y5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Hic1Q9R1Y5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Hic1Q9R1Y5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Hic1Q9R1Y5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Hic1Q9R1Y5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Hic1Q9R1Y5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Hic1Q9R1Y5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Hic1Q9R1Y5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Hic1Q9R1Y5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Hic1Q9R1Y5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Hic1Q9R1Y5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
Hic1Q9R1Y5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Hic1Q9R1Y5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Hic1Q9R1Y5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Hic1Q9R1Y5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
Hic1Q9R1Y5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
Hic1Q9R1Y5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Hic1Q9R1Y5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Hic1Q9R1Y5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Hic1Q9R1Y5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Hic1Q9R1Y5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Hic1Q9R1Y5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Hic1Q9R1Y5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
Hic1Q9R1Y5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Hic1Q9R1Y5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Hic1Q9R1Y5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Hic1Q9R1Y5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Hic1Q9R1Y5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Hic1Q9R1Y5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Hic1Q9R1Y5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
Hic1Q9R1Y5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Hic1Q9R1Y5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Hic1Q9R1Y5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Hic1Q9R1Y5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Hic1Q9R1Y5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
Hic1Q9R1Y5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Hic1Q9R1Y5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Hic1Q9R1Y5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Hic1Q9R1Y5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Hic1Q9R1Y5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Hic1Q9R1Y5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Hic1Q9R1Y5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Hic1Q9R1Y5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Hic1Q9R1Y5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Hic1Q9R1Y5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Hic1Q9R1Y5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Hic1Q9R1Y5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Hic1Q9R1Y5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Hic1Q9R1Y5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Hic1Q9R1Y5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Hic1Q9R1Y5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Hic1Q9R1Y5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Hic1Q9R1Y5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Hic1Q9R1Y5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Hic1Q9R1Y5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Hic1Q9R1Y5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Hic1Q9R1Y5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Hic1Q9R1Y5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Hic1Q9R1Y5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
Hic1Q9R1Y5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
Hic1Q9R1Y5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Hic1Q9R1Y5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms