Protein–RNA interactions for Protein: P20937

Klra1, T-cell surface glycoprotein YE1/48, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klra1P20937 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
Klra1P20937 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Klra1P20937 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Klra1P20937 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Klra1P20937 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Klra1P20937 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Klra1P20937 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Klra1P20937 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Klra1P20937 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
Klra1P20937 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Klra1P20937 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
Klra1P20937 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Klra1P20937 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
Klra1P20937 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Klra1P20937 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
Klra1P20937 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Klra1P20937 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Klra1P20937 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Klra1P20937 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
Klra1P20937 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Klra1P20937 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Klra1P20937 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Klra1P20937 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Klra1P20937 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Klra1P20937 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Klra1P20937 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Klra1P20937 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
Klra1P20937 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Klra1P20937 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Klra1P20937 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Klra1P20937 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Klra1P20937 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Klra1P20937 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Klra1P20937 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Klra1P20937 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Klra1P20937 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
Klra1P20937 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Klra1P20937 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Klra1P20937 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Klra1P20937 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Klra1P20937 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Klra1P20937 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Klra1P20937 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Klra1P20937 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
Klra1P20937 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Klra1P20937 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Klra1P20937 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Klra1P20937 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Klra1P20937 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Klra1P20937 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Klra1P20937 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Klra1P20937 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
Klra1P20937 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Klra1P20937 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Klra1P20937 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Klra1P20937 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
Klra1P20937 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Klra1P20937 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Klra1P20937 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Klra1P20937 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Klra1P20937 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Klra1P20937 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Klra1P20937 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Klra1P20937 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Klra1P20937 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Klra1P20937 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Klra1P20937 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Klra1P20937 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Klra1P20937 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Klra1P20937 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Klra1P20937 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Klra1P20937 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Klra1P20937 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Klra1P20937 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Klra1P20937 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Klra1P20937 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Klra1P20937 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Klra1P20937 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Klra1P20937 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Klra1P20937 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Klra1P20937 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Klra1P20937 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Klra1P20937 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Klra1P20937 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Klra1P20937 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Klra1P20937 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Klra1P20937 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Klra1P20937 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Klra1P20937 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Klra1P20937 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Klra1P20937 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Klra1P20937 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Klra1P20937 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Klra1P20937 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Klra1P20937 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Klra1P20937 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Klra1P20937 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Klra1P20937 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Klra1P20937 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Klra1P20937 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms