RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027667.12

Pkp1-201, Transcript of Plakophilin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pkp1, Length 4,669 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tceal9Q9DD24 104 aa15.88■□□□□ 0.13
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cabp2Q9JLK4 216 aa15.88■□□□□ 0.13
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nolc1E9Q5C9 702 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm10563F6WIE4 79 aa15.86■□□□□ 0.13
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Prex2Q3LAC4 1598 aa15.86■□□□□ 0.13
Pkp1-201ENSMUST00000027667 TkfcQ8VC30 578 aa15.86■□□□□ 0.13
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Magi3Q9EQJ9 1476 aa15.86■□□□□ 0.13
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Larp1bA0A0A6YXJ7 370 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Anapc15P60007 132 aa15.86■□□□□ 0.13
Pkp1-201ENSMUST00000027667 IbtkQ6ZPR6 1352 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Plekhh1Q80TI1 1356 aa15.86■□□□□ 0.13
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ppm1fQ8CGA0 452 aa15.85■□□□□ 0.13
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PalmQ9Z0P4 383 aa15.84■□□□□ 0.13
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Atp7aQ64430 1491 aa15.84■□□□□ 0.13
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PtmsQ9D0J8 101 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Naip5Q9R016 1403 aa15.83■□□□□ 0.13
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Wdr7Q920I9 1489 aa15.83■□□□□ 0.13
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Q8C5K5 320 aa15.83■□□□□ 0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kdm5bQ80Y84 1544 aa15.83■□□□□ 0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ccdc171E9Q1U1 1324 aa15.82■□□□□ 0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Eif2s2Q99L45 331 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 DroshaQ5HZJ0 1373 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 AampJ3QN89 436 aa15.82■□□□□ 0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fkbp4P30416 458 aa15.82■□□□□ 0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 GnpatP98192 678 aa15.82■□□□□ 0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ipo9Q91YE6 1041 aa15.82■□□□□ 0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Smg7Q5RJH6 1138 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pik3c2gO70167 1506 aa15.81■□□□□ 0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cnnm1Q0GA42 951 aa15.81■□□□□ 0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PsapQ61207 557 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 CgnP59242 1191 aa15.8■□□□□ 0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fchsd2Q3USJ8 740 aa15.8■□□□□ 0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mphosph10Q810V0 681 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm21680A0A0G2JGR8 267 aa15.79■□□□□ 0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Neurod6P48986 337 aa15.79■□□□□ 0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 TmpoQ61033 693 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ggnbp2Q5SV77 696 aa15.79■□□□□ 0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gnl3lQ6PGG6 577 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Chrna2Q91X60 512 aa15.79■□□□□ 0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Speer4bQ9D9F7 267 aa15.79■□□□□ 0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 TefQ9JLC6 301 aa15.79■□□□□ 0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 CatipB9EKE5 520 aa15.79■□□□□ 0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 BcanQ61361 883 aa15.79■□□□□ 0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Smarce1O54941 411 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 ChgaP26339 463 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Prkrip1Q9CWV6 186 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dnai2A2AC93 623 aa15.77■□□□□ 0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Atl3Q91YH5 541 aa15.77■□□□□ 0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Plekhd1B2RPU2 505 aa15.77■□□□□ 0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pcmtd1P59913 357 aa15.77■□□□□ 0.11
Pkp1-201ENSMUST00000027667 NexnQ7TPW1 607 aa15.77■□□□□ 0.11
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ssh2Q5SW75 1423 aa15.77■□□□□ 0.11
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Eva1cP58659 440 aa15.76■□□□□ 0.11
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kcnh5Q920E3 988 aa15.76■□□□□ 0.11
Pkp1-201ENSMUST00000027667 ZgpatQ8VDM1 511 aa15.76■□□□□ 0.11
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Atp6v1dP57746 247 aa15.75■□□□□ 0.11
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm21663A0A0G2JE01 267 aa15.75■□□□□ 0.11
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm7361D3Z6R1 267 aa15.75■□□□□ 0.11
Pkp1-201ENSMUST00000027667 5031410I06RikE9Q4E0 267 aa15.75■□□□□ 0.11
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm1979E9QAN3 267 aa15.75■□□□□ 0.11
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm5862K7N5V5 267 aa15.75■□□□□ 0.11
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm10220K7N660 267 aa15.75■□□□□ 0.11
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Arhgef12Q8R4H2 1543 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
Pkp1-201ENSMUST00000027667 4930572O03RikQ8C5Y0 211 aa15.74■□□□□ 0.11
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Q9D2X8 372 aa15.74■□□□□ 0.11
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Idi2Q8BFZ6 227 aa15.74■□□□□ 0.11
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ppp1r15aP17564 657 aa15.73■□□□□ 0.11
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zranb1Q7M760 708 aa15.73■□□□□ 0.11
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ncoa1P70365 1447 aa15.73■□□□□ 0.11
Pkp1-201ENSMUST00000027667 CrebrfQ8CDG5 640 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ak7Q9D2H2 614 aa15.73■□□□□ 0.11
Pkp1-201ENSMUST00000027667 KarsQ99MN1 595 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cdc37l1Q9CZP7 335 aa15.72■□□□□ 0.11
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fam50bQ9WTJ8 334 aa15.72■□□□□ 0.11
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cetn4Q8K4K1 168 aa15.71■□□□□ 0.11
Pkp1-201ENSMUST00000027667 R3hcc1Q8BSI6 488 aa15.71■□□□□ 0.11
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ccne1Q61457 408 aa15.71■□□□□ 0.1
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rusc2Q80U22 1514 aa15.71■□□□□ 0.1
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gprasp1Q5U4C1 1347 aa15.7■□□□□ 0.1
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Acsbg1Q99PU5 721 aa15.7■□□□□ 0.1
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmem94Q7TSH8 1360 aa15.7■□□□□ 0.1
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc12a5Q91V14 1138 aa15.7■□□□□ 0.1
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Arhgef40Q3UPH7 1517 aa15.7■□□□□ 0.1
Pkp1-201ENSMUST00000027667 TnikP83510 1323 aa15.7■□□□□ 0.1
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Adgrb2Q8CGM1 1561 aa15.69■□□□□ 0.1
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Erc2Q6PH08 957 aa15.69■□□□□ 0.1
Pkp1-201ENSMUST00000027667 SkilQ60665 675 aa15.68■□□□□ 0.1
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Farp2Q91VS8 1065 aa15.68■□□□□ 0.1
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zeb2Q9R0G7 1215 aa15.68■□□□□ 0.1
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dhx16G3X8X0 1044 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Filip1lQ6P6L0 1131 aa15.68■□□□□ 0.1
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Stard3nlQ9DCI3 235 aa15.68■□□□□ 0.1
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hmox1P14901 289 aa15.68■□□□□ 0.1
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Btbd11Q6GQW0 1109 aa15.67■□□□□ 0.1
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Eif3bQ8JZQ9 803 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gnai2P08752 355 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
Pkp1-201ENSMUST00000027667 TimelessQ9R1X4 1197 aa15.67■□□□□ 0.1
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Map4k4P97820 1233 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dennd4bQ3U1Y4 1499 aa15.67■□□□□ 0.1
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ttll13A4Q9F6 804 aa15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 14 ms