RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019749.3

Hoxd8-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd8, Length 2,634 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ino80Q6ZPV2 1559 aa34.2■■■■□ 3.06
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 P2rx7Q9Z1M0 595 aa34.17■■■■□ 3.06
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ralbp1Q62172 648 aa34.15■■■■□ 3.06
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Dip2cE9PWR4 1557 aa34.15■■■■□ 3.06
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Bcl11aQ9QYE3 773 aa34.08■■■■□ 3.05
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Yeats2Q3TUF7 1407 aa34■■■■□ 3.03
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Eif2ak4Q9QZ05 1648 aa33.95■■■■□ 3.03
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Zmym3Q9JLM4 1370 aa33.93■■■■□ 3.02
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Shq1Q7TMX5 569 aa33.91■■■■□ 3.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tsen2Q6P7W5 460 aa33.91■■■■□ 3.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Prrc2bQ7TPM1 1486 aaKnown RBP33.91■■■■□ 3.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Adgrl3Q80TS3 1537 aa33.9■■■■□ 3.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Nkx1-2P42580 305 aa33.9■■■■□ 3.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mapk8ip3Q9ESN9 1337 aa33.9■■■■□ 3.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Adamts7Q68SA9 1657 aa33.89■■■■□ 3.01
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Trim26Q99PN3 545 aa33.86■■■■□ 3.01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Nrxn1Q9CS84 1514 aa33.84■■■■□ 3.01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Znf521Q6KAS7 1311 aa33.83■■■■□ 3.01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ksr2Q3UVC0 959 aa33.83■■■■□ 3.01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Adgrl1Q80TR1 1466 aa33.83■■■■□ 3.01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cep170bQ80U49 1574 aa33.8■■■■□ 3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ahdc1Q6PAL7 1594 aaKnown RBP33.8■■■■□ 3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Arhgap23Q69ZH9 1483 aa33.79■■■■□ 3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Qser1A2BIE1 1698 aa33.79■■■■□ 3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Duxf3A0A0N4SV92 674 aa33.78■■■■□ 3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 DiexfQ8BTT6 772 aaKnown RBP33.78■■■■□ 3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rlbp1Q9Z275 317 aa33.77■■■■□ 3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Q9D9H8 365 aa33.77■■■■□ 3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 PtprmP28828 1452 aa33.76■■■■□ 3
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Armcx1Q9CX83 456 aa33.72■■■□□ 2.99
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Sart3Q9JLI8 962 aaKnown RBP33.71■■■□□ 2.99
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Dnai1Q8C0M8 701 aa33.71■■■□□ 2.99
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Fam135bQ9DAI6 1403 aa33.71■■■□□ 2.99
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Hecw2Q6I6G8 1578 aa33.7■■■□□ 2.99
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Atp2b2Q9R0K7 1198 aa33.7■■■□□ 2.99
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ak7Q9D2H2 614 aa33.69■■■□□ 2.98
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 NinlQ6ZQ12 1394 aa33.67■■■□□ 2.98
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Hsp90aa1P07901 733 aaKnown RBP33.66■■■□□ 2.98
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ppm1gQ61074 542 aa33.63■■■□□ 2.97
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ipo8Q7TMY7 1010 aa33.63■■■□□ 2.97
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Arhgef28P97433 1693 aa33.61■■■□□ 2.97
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Eif2s2Q99L45 331 aaKnown RBP33.6■■■□□ 2.97
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