RNA–Protein interactions for RNA: YPR069C

SPE3, Transcript of Spermidine synthase, yeastyeast

Gene SPE3, Length 882 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE3YPR069C MPC3P53311 146 aa3.85□□□□□ -1.79
SPE3YPR069C RSM18P40033 138 aa3.84□□□□□ -1.79
SPE3YPR069C YML108WQ03759 105 aa3.84□□□□□ -1.79
SPE3YPR069C TDA8Q6B2U8 126 aa3.84□□□□□ -1.79
SPE3YPR069C ELC1Q03071 99 aa3.83□□□□□ -1.8
SPE3YPR069C YEL045CP32616 141 aa3.82□□□□□ -1.8
SPE3YPR069C DSE2P38844 325 aa3.82□□□□□ -1.8
SPE3YPR069C YOL097W-AQ3E7Y9 61 aa3.82□□□□□ -1.8
SPE3YPR069C YLR157W-DP0CE99 70 aa3.81□□□□□ -1.8
SPE3YPR069C FYV7Q12247 151 aa3.81□□□□□ -1.8
SPE3YPR069C HUR1P45820 110 aa3.8□□□□□ -1.8
SPE3YPR069C YAR1P46683 200 aa3.8□□□□□ -1.8
SPE3YPR069C YCR043CP25361 127 aa3.79□□□□□ -1.8
SPE3YPR069C NHP2P32495 156 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
SPE3YPR069C NAT5Q08689 176 aa3.79□□□□□ -1.8
SPE3YPR069C FUN14P18411 198 aa3.78□□□□□ -1.8
SPE3YPR069C YER181CP40097 107 aa3.77□□□□□ -1.81
SPE3YPR069C POP7P38291 140 aa3.76□□□□□ -1.81
SPE3YPR069C RSM19P53733 91 aaPredicted RBP3.76□□□□□ -1.81
SPE3YPR069C CWC27Q02770 301 aa3.76□□□□□ -1.81
SPE3YPR069C LSM6Q06406 86 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
SPE3YPR069C TSC3Q3E790 80 aa3.74□□□□□ -1.81
SPE3YPR069C RPP2AP05319 106 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
SPE3YPR069C YKL069WP36088 180 aa3.73□□□□□ -1.81
SPE3YPR069C TIM11P81449 96 aaPredicted RBP3.73□□□□□ -1.81
SPE3YPR069C UIP3P39547 235 aa3.72□□□□□ -1.81
SPE3YPR069C YLR162WQ06235 118 aa3.72□□□□□ -1.81
SPE3YPR069C PAI3P01094 68 aa3.71□□□□□ -1.82
SPE3YPR069C YJR107C-AP0CT86 78 aa3.71□□□□□ -1.82
SPE3YPR069C FYV12Q08559 129 aa3.71□□□□□ -1.82
SPE3YPR069C YLR363W-AQ3E747 85 aa3.71□□□□□ -1.82
SPE3YPR069C YLR296WQ05898 108 aa3.7□□□□□ -1.82
SPE3YPR069C YHR213W-BQ8TGK1 99 aa3.7□□□□□ -1.82
SPE3YPR069C MIC10Q96VH5 97 aa3.7□□□□□ -1.82
SPE3YPR069C Q0017Q9ZZX8 53 aa3.7□□□□□ -1.82
SPE3YPR069C YFR009W-AP0C5M9 85 aa3.69□□□□□ -1.82
SPE3YPR069C ECM19Q06011 112 aa3.69□□□□□ -1.82
SPE3YPR069C ATP18P81450 59 aa3.67□□□□□ -1.82
SPE3YPR069C SHH4Q06236 168 aa3.67□□□□□ -1.82
SPE3YPR069C YJL133C-AQ3E7A3 74 aa3.67□□□□□ -1.82
SPE3YPR069C YDL085C-AQ3E7B7 68 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
SPE3YPR069C ICS3P47034 131 aa3.64□□□□□ -1.83
SPE3YPR069C YJR128WP47162 119 aa3.63□□□□□ -1.83
SPE3YPR069C COF1Q03048 143 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
SPE3YPR069C YHR073W-AP0C5N7 58 aa3.62□□□□□ -1.83
SPE3YPR069C COX23P38824 151 aa3.61□□□□□ -1.83
SPE3YPR069C SAE3P89114 91 aa3.61□□□□□ -1.83
SPE3YPR069C YBR182C-AQ8TGU6 64 aa3.6□□□□□ -1.83
SPE3YPR069C YER187WP40102 141 aa3.59□□□□□ -1.83
SPE3YPR069C YDR210WQ03482 75 aa3.59□□□□□ -1.83
SPE3YPR069C ISD11Q6Q560 94 aa3.57□□□□□ -1.84
SPE3YPR069C LSM8P47093 109 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
SPE3YPR069C EDC1P53080 175 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
SPE3YPR069C YGR164WP53291 111 aa3.56□□□□□ -1.84
SPE3YPR069C YIL102C-AQ2V2P5 75 aa3.56□□□□□ -1.84
SPE3YPR069C YDR381C-AQ3E6R5 114 aa3.55□□□□□ -1.84
SPE3YPR069C YJL009WP47078 108 aa3.54□□□□□ -1.84
SPE3YPR069C YOL014WQ08110 124 aa3.54□□□□□ -1.84
SPE3YPR069C YLR361C-AQ3E795 98 aa3.54□□□□□ -1.84
SPE3YPR069C GLC8P41818 229 aa3.53□□□□□ -1.84
SPE3YPR069C YDL012CQ12489 107 aa3.52□□□□□ -1.85
SPE3YPR069C RPL36AP05745 100 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
SPE3YPR069C YOR316C-AQ3E806 69 aa3.5□□□□□ -1.85
SPE3YPR069C YPR153WQ06537 140 aa3.49□□□□□ -1.85
SPE3YPR069C YGL034CP53186 121 aa3.48□□□□□ -1.85
SPE3YPR069C YOR304C-AO14468 76 aa3.47□□□□□ -1.85
SPE3YPR069C YCR050CP25630 102 aa3.47□□□□□ -1.85
SPE3YPR069C YAR064WP39563 99 aa3.47□□□□□ -1.85
SPE3YPR069C YNL198CP40166 100 aa3.47□□□□□ -1.85
SPE3YPR069C YHL042WP38729 150 aa3.46□□□□□ -1.86
SPE3YPR069C TDA2P40045 126 aa3.46□□□□□ -1.86
SPE3YPR069C RPL38P49167 78 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
SPE3YPR069C SKI6P46948 246 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
SPE3YPR069C YPR170W-BP0C5R9 85 aa3.42□□□□□ -1.86
SPE3YPR069C YJL144WP47009 104 aa3.42□□□□□ -1.86
SPE3YPR069C PBI2P0CT04 75 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
SPE3YPR069C ATP20Q12233 115 aa3.4□□□□□ -1.87
SPE3YPR069C RAD6P06104 172 aa3.38□□□□□ -1.87
SPE3YPR069C LSO2Q3E772 92 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
SPE3YPR069C RPS29AP41057 56 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
SPE3YPR069C RPS29BP41058 56 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SPE3YPR069C LIP1Q03579 150 aa3.35□□□□□ -1.87
SPE3YPR069C RPA12P32529 125 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
SPE3YPR069C YBR016WP38216 128 aa3.33□□□□□ -1.88
SPE3YPR069C YPL080CQ02826 108 aa3.31□□□□□ -1.88
SPE3YPR069C YLR255CO13574 117 aa3.3□□□□□ -1.88
SPE3YPR069C YCR085WP25650 117 aa3.29□□□□□ -1.88
SPE3YPR069C HHF1P02309 103 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
SPE3YPR069C YML054C-AQ3E809 52 aa3.27□□□□□ -1.89
SPE3YPR069C YBL008W-AQ3E821 79 aa3.26□□□□□ -1.89
SPE3YPR069C YGR039WP53225 103 aa3.23□□□□□ -1.89
SPE3YPR069C YGR146C-AQ8TGT9 53 aa3.23□□□□□ -1.89
SPE3YPR069C COX8P04039 78 aa3.21□□□□□ -1.9
SPE3YPR069C YLR285C-AQ3E771 56 aa3.21□□□□□ -1.9
SPE3YPR069C EMC6Q12431 108 aa3.2□□□□□ -1.9
SPE3YPR069C YOL013W-AP0C272 63 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
SPE3YPR069C YSY6P38374 65 aa3.17□□□□□ -1.9
SPE3YPR069C YKL065W-AQ2V2P2 73 aa3.16□□□□□ -1.9
SPE3YPR069C TMA7Q3E764 64 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
SPE3YPR069C YIL156W-BQ2V2P4 73 aa3.15□□□□□ -1.91
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