RNA–Protein interactions for RNA: YPL060C-A

YPL060C-A, Transcript of TyA Gag protein, yeastyeast

Gene YPL060C-A, Length 3,315 nt, Biotype pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPL060C-AYPL060C-A YDR029WQ12111 104 aa-1.19□□□□□ -2.6
YPL060C-AYPL060C-A PAU6P0CE90 120 aa-1.19□□□□□ -2.6
YPL060C-AYPL060C-A PAU18P0CE91 120 aa-1.19□□□□□ -2.6
YPL060C-AYPL060C-A YGR042WP53227 271 aa-1.19□□□□□ -2.6
YPL060C-AYPL060C-A YJL133C-AQ3E7A3 74 aa-1.19□□□□□ -2.6
YPL060C-AYPL060C-A YNL277W-AQ3E7Z0 62 aa-1.19□□□□□ -2.6
YPL060C-AYPL060C-A YNL042W-BQ3E7Z2 85 aa-1.19□□□□□ -2.6
YPL060C-AYPL060C-A YLR157W-DP0CE99 70 aa-1.2□□□□□ -2.6
YPL060C-AYPL060C-A RPL14BP38754 138 aaKnown RBP-1.2□□□□□ -2.6
YPL060C-AYPL060C-A PAU5P43575 122 aa-1.2□□□□□ -2.6
YPL060C-AYPL060C-A YDR366CP87287 132 aa-1.2□□□□□ -2.6
YPL060C-AYPL060C-A YLR363W-AQ3E747 85 aa-1.2□□□□□ -2.6
YPL060C-AYPL060C-A YHR138CP38841 114 aaPredicted RBP-1.2□□□□□ -2.6
YPL060C-AYPL060C-A AME1P38313 324 aa-1.2□□□□□ -2.6
YPL060C-AYPL060C-A HSP10P38910 106 aa-1.2□□□□□ -2.6
YPL060C-AYPL060C-A YER187WP40102 141 aa-1.2□□□□□ -2.6
YPL060C-AYPL060C-A RUB1Q03919 77 aa-1.2□□□□□ -2.6
YPL060C-AYPL060C-A ICY1Q04329 127 aa-1.2□□□□□ -2.6
YPL060C-AYPL060C-A FRQ1Q06389 190 aa-1.2□□□□□ -2.6
YPL060C-AYPL060C-A QCR7P00128 127 aa-1.21□□□□□ -2.6
YPL060C-AYPL060C-A ATG38Q05789 226 aaKnown RBP-1.21□□□□□ -2.6
YPL060C-AYPL060C-A YPR145C-AQ2V2P0 78 aa-1.21□□□□□ -2.6
YPL060C-AYPL060C-A YBL039W-BP0C268 59 aa-1.21□□□□□ -2.6
YPL060C-AYPL060C-A TOM6P33448 61 aa-1.21□□□□□ -2.6
YPL060C-AYPL060C-A GPI19Q04082 140 aa-1.21□□□□□ -2.6
YPL060C-AYPL060C-A PAU8P0CE92 120 aa-1.22□□□□□ -2.6
YPL060C-AYPL060C-A PAU11P0CE93 120 aa-1.22□□□□□ -2.6
YPL060C-AYPL060C-A PAU2P32612 120 aa-1.22□□□□□ -2.6
YPL060C-AYPL060C-A PAU24P38155 120 aa-1.22□□□□□ -2.6
YPL060C-AYPL060C-A YGR201CP42936 225 aa-1.22□□□□□ -2.6
YPL060C-AYPL060C-A PAU12P53343 120 aa-1.22□□□□□ -2.6
YPL060C-AYPL060C-A TVP18Q04767 167 aa-1.22□□□□□ -2.6
YPL060C-AYPL060C-A YOL118CQ08259 102 aa-1.22□□□□□ -2.6
YPL060C-AYPL060C-A PAU9Q3E770 120 aa-1.22□□□□□ -2.6
YPL060C-AYPL060C-A YAL065CO13511 128 aa-1.22□□□□□ -2.6
YPL060C-AYPL060C-A OLI1P61829 76 aa-1.22□□□□□ -2.6
YPL060C-AYPL060C-A YLR050CQ12155 161 aaKnown RBP-1.22□□□□□ -2.6
YPL060C-AYPL060C-A RPS1BP23248 255 aaKnown RBP-1.22□□□□□ -2.61
YPL060C-AYPL060C-A ATG8P38182 117 aaRIP-Chip data-1.22□□□□□ -2.61not detected
YPL060C-AYPL060C-A POP7P38291 140 aa-1.22□□□□□ -2.61
YPL060C-AYPL060C-A EGD2P38879 174 aaKnown RBP-1.22□□□□□ -2.61
YPL060C-AYPL060C-A RPL22BP56628 122 aaKnown RBP-1.22□□□□□ -2.61
YPL060C-AYPL060C-A OST5Q92316 86 aa-1.22□□□□□ -2.61
YPL060C-AYPL060C-A YJR107C-AP0CT86 78 aa-1.23□□□□□ -2.61
YPL060C-AYPL060C-A RSM19P53733 91 aaPredicted RBP-1.23□□□□□ -2.61
YPL060C-AYPL060C-A FCF2Q12035 217 aaPredicted RBP-1.23□□□□□ -2.61
YPL060C-AYPL060C-A YGL258W-AQ3E740 77 aa-1.23□□□□□ -2.61
YPL060C-AYPL060C-A RGI1P40043 161 aaPredicted RBP-1.23□□□□□ -2.61
YPL060C-AYPL060C-A PAU13P38725 120 aa-1.23□□□□□ -2.61
YPL060C-AYPL060C-A CNL1Q06333 122 aa-1.23□□□□□ -2.61
YPL060C-AYPL060C-A PAU10Q03050 120 aa-1.24□□□□□ -2.61
YPL060C-AYPL060C-A EFM5P53200 248 aaKnown RBP-1.24□□□□□ -2.61
YPL060C-AYPL060C-A YLR365WQ7LIF2 110 aa-1.24□□□□□ -2.61
YPL060C-AYPL060C-A RPA12P32529 125 aaKnown RBP-1.25□□□□□ -2.61
YPL060C-AYPL060C-A VPS51P36116 164 aa-1.25□□□□□ -2.61
YPL060C-AYPL060C-A YGL149WP53116 101 aa-1.25□□□□□ -2.61
YPL060C-AYPL060C-A SMD2Q06217 110 aaKnown RBP-1.25□□□□□ -2.61
YPL060C-AYPL060C-A PAU16P35994 123 aa-1.25□□□□□ -2.61
YPL060C-AYPL060C-A YPL038W-AQ3E7B4 63 aa-1.25□□□□□ -2.61
YPL060C-AYPL060C-A BPH1P25356 2167 aa-1.25□□□□□ -2.61
YPL060C-AYPL060C-A VMA21P41806 77 aa-1.25□□□□□ -2.61
YPL060C-AYPL060C-A PAU4P53427 120 aa-1.25□□□□□ -2.61
YPL060C-AYPL060C-A APS2Q00381 147 aa-1.25□□□□□ -2.61
YPL060C-AYPL060C-A PAU19P0CE85 124 aa-1.26□□□□□ -2.61
YPL060C-AYPL060C-A PAU3P25610 124 aa-1.26□□□□□ -2.61
YPL060C-AYPL060C-A PAU15P40585 124 aa-1.26□□□□□ -2.61
YPL060C-AYPL060C-A YDL022C-AP0C5L6 82 aa-1.26□□□□□ -2.61
YPL060C-AYPL060C-A CWP2P43497 92 aa-1.26□□□□□ -2.61
YPL060C-AYPL060C-A YPL225WQ08971 146 aaKnown RBP-1.27□□□□□ -2.61
YPL060C-AYPL060C-A YLR342W-AQ3E810 57 aa-1.27□□□□□ -2.61
YPL060C-AYPL060C-A YOS1Q3E834 85 aa-1.27□□□□□ -2.61
YPL060C-AYPL060C-A UBI4P0CG63 381 aaKnown RBP-1.27□□□□□ -2.61
YPL060C-AYPL060C-A ELC1Q03071 99 aa-1.27□□□□□ -2.61
YPL060C-AYPL060C-A YDR102CQ03864 110 aa-1.27□□□□□ -2.61
YPL060C-AYPL060C-A YIL156W-BQ2V2P4 73 aa-1.27□□□□□ -2.61
YPL060C-AYPL060C-A YBR200W-AQ3E755 54 aa-1.27□□□□□ -2.61
YPL060C-AYPL060C-A SNN1P48232 102 aa-1.28□□□□□ -2.61
YPL060C-AYPL060C-A YCR085WP25650 117 aa-1.28□□□□□ -2.61
YPL060C-AYPL060C-A YLR053CQ12026 108 aa-1.28□□□□□ -2.61
YPL060C-AYPL060C-A YLL006W-AQ3E814 58 aa-1.28□□□□□ -2.61
YPL060C-AYPL060C-A HSP12P22943 109 aaKnown RBP-1.28□□□□□ -2.62
YPL060C-AYPL060C-A RPS12P48589 143 aaKnown RBP-1.28□□□□□ -2.62
YPL060C-AYPL060C-A YCL012CQ8J0M4 134 aa-1.28□□□□□ -2.62
YPL060C-AYPL060C-A FYV7Q12247 151 aa-1.29□□□□□ -2.62
YPL060C-AYPL060C-A GNA1P43577 159 aaPredicted RBP-1.3□□□□□ -2.62
YPL060C-AYPL060C-A YKL065W-AQ2V2P2 73 aa-1.3□□□□□ -2.62
YPL060C-AYPL060C-A ATP7P30902 174 aa-1.3□□□□□ -2.62
YPL060C-AYPL060C-A SIP18P50263 79 aa-1.3□□□□□ -2.62
YPL060C-AYPL060C-A TLG1Q03322 224 aa-1.3□□□□□ -2.62
YPL060C-AYPL060C-A RPB11P38902 120 aa-1.3□□□□□ -2.62
YPL060C-AYPL060C-A TOM7P53507 60 aa-1.3□□□□□ -2.62
YPL060C-AYPL060C-A SDH6Q3E785 79 aa-1.3□□□□□ -2.62
YPL060C-AYPL060C-A YIL134C-AQ45U18 67 aa-1.3□□□□□ -2.62
YPL060C-AYPL060C-A YGR039WP53225 103 aa-1.31□□□□□ -2.62
YPL060C-AYPL060C-A NSL1Q12143 216 aa-1.31□□□□□ -2.62
YPL060C-AYPL060C-A TIM8P57744 87 aa-1.31□□□□□ -2.62
YPL060C-AYPL060C-A YJL127C-BQ3E828 52 aa-1.31□□□□□ -2.62
YPL060C-AYPL060C-A ERV14P53173 138 aa-1.32□□□□□ -2.62
YPL060C-AYPL060C-A HUB1Q6Q546 73 aa-1.32□□□□□ -2.62
YPL060C-AYPL060C-A NCE101Q02820 53 aa-1.33□□□□□ -2.62
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