RNA–Protein interactions for RNA: YBL037W

APL3, Transcript of Alpha-adaptin, yeast

Gene APL3, Length 3,078 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
APL3	YBL037W	YGR240C-A	Q3E786	66 aa		0.45	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	YOS1	Q3E834	85 aa		0.45	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	HMRA1	P0CY11	126 aa		0.45	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	UBC4	P15731	148 aa		0.45	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	YER187W	P40102	141 aa		0.45	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	GNA1	P43577	159 aa	Predicted RBP	0.45	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	YMR321C	Q04898	105 aa		0.45	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	KSH1	Q8TGJ3	72 aa		0.45	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	MRP17	P28778	131 aa		0.44	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	YIR020C	P40575	100 aa		0.44	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	YMR082C	Q04276	118 aa		0.44	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	DAD1	Q12248	94 aa		0.44	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	YHR138C	P38841	114 aa	Predicted RBP	0.44	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	EMC5	P40540	141 aa		0.44	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	HUR1	P45820	110 aa		0.44	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	SPC1	P46965	94 aa		0.44	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	YNL190W	P53872	204 aa		0.44	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	YLR363W-A	Q3E747	85 aa		0.44	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	YMR175W-A	Q3E766	64 aa		0.44	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	ECM12	O13529	151 aa		0.44	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	YLR255C	O13574	117 aa		0.44	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	PAU6	P0CE90	120 aa		0.44	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	PAU18	P0CE91	120 aa		0.44	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	MRPS12	P53732	153 aa		0.44	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	ERI1	P62651	68 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	CWP2	P43497	92 aa		0.43	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	YOR034C-A	Q3E735	80 aa		0.43	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	ENV10	Q99382	181 aa		0.43	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	PAU8	P0CE92	120 aa		0.43	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	PAU11	P0CE93	120 aa		0.43	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	RPS11A	P0CX47	156 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	RPS11B	P0CX48	156 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	PAU13	P38725	120 aa		0.43	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	PAU4	P53427	120 aa		0.43	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	PAU10	Q03050	120 aa		0.43	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	YOR314W	Q12506	109 aa		0.43	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	YBR230W-A	Q3E762	66 aa		0.43	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	PAU9	Q3E770	120 aa		0.43	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	YFL041W-A	Q3E817	63 aa		0.43	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	YJR128W	P47162	119 aa		0.42	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	YPR145C-A	Q2V2P0	78 aa		0.42	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	VMA9	Q3E7B6	73 aa		0.42	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	YDL022C-A	P0C5L6	82 aa		0.42	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	YBR292C	P38357	123 aa		0.42	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	YDR381C-A	Q3E6R5	114 aa		0.42	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	YPL038W-A	Q3E7B4	63 aa		0.42	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	YLR342W-A	Q3E810	57 aa		0.42	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	YIL086C	P40503	102 aa		0.41	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	VPS55	P47111	140 aa		0.41	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	LSM6	Q06406	86 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	YOR011W-A	Q3E807	68 aa		0.41	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	COA2	Q3E823	68 aa		0.41	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	YBR032W	P38223	100 aa		0.41	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	LCL1	Q02786	101 aa		0.41	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	YDR042C	Q03205	200 aa		0.41	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	PAU20	Q08322	120 aa		0.41	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	YIL102C-A	Q2V2P5	75 aa		0.41	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	MHF2	Q3E829	80 aa		0.41	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	YHR073W-A	P0C5N7	58 aa		0.41	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	YBL071C	P38185	102 aa		0.41	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	YHR173C	P38864	112 aa		0.41	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	PAU1	P0CE88	120 aa		0.4	□□□□□ -2.35
APL3	YBL037W	PAU14	P0CE89	120 aa		0.4	□□□□□ -2.35
APL3	YBL037W	SRB6	P32570	121 aa		0.4	□□□□□ -2.35
APL3	YBL037W	MRPL38	P35996	138 aa	Predicted RBP	0.4	□□□□□ -2.35
APL3	YBL037W	IMP2	P46972	177 aa		0.4	□□□□□ -2.35
APL3	YBL037W	ICY1	Q04329	127 aa		0.4	□□□□□ -2.35
APL3	YBL037W	YGL258W-A	Q3E740	77 aa		0.4	□□□□□ -2.35
APL3	YBL037W	YCR095W-A	Q3E787	52 aa		0.4	□□□□□ -2.35
APL3	YBL037W	YSY6	P38374	65 aa		0.4	□□□□□ -2.35
APL3	YBL037W	YDR010C	Q12426	110 aa		0.4	□□□□□ -2.35
APL3	YBL037W	MPC2	P38857	129 aa		0.39	□□□□□ -2.35
APL3	YBL037W	RPS29A	P41057	56 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
APL3	YBL037W	HUB1	Q6Q546	73 aa		0.39	□□□□□ -2.35
APL3	YBL037W	YLR157W-E	P0CF00	54 aa		0.39	□□□□□ -2.35
APL3	YBL037W	AUA1	P32450	94 aa		0.39	□□□□□ -2.35
APL3	YBL037W	YIL156W-B	Q2V2P4	73 aa		0.39	□□□□□ -2.35
APL3	YBL037W	YBR072C-A	Q3E794	53 aa		0.39	□□□□□ -2.35
APL3	YBL037W	QCR9	P22289	66 aa		0.39	□□□□□ -2.35
APL3	YBL037W	BSC4	P53841	131 aa		0.39	□□□□□ -2.35
APL3	YBL037W	YDR210W	Q03482	75 aa		0.39	□□□□□ -2.35
APL3	YBL037W	SMX2	P40204	77 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
APL3	YBL037W	NCE101	Q02820	53 aa		0.38	□□□□□ -2.35
APL3	YBL037W	ATP17	Q06405	101 aa		0.38	□□□□□ -2.35
APL3	YBL037W	YDR246W-A	Q3E763	66 aa		0.38	□□□□□ -2.35
APL3	YBL037W	Q0017	Q9ZZX8	53 aa		0.38	□□□□□ -2.35
APL3	YBL037W	SEN1	Q00416	2231 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
APL3	YBL037W	RSM18	P40033	138 aa		0.38	□□□□□ -2.35
APL3	YBL037W	SNA2	P56508	79 aa		0.38	□□□□□ -2.35
APL3	YBL037W	YMR105W-A	Q8TGS8	64 aa		0.38	□□□□□ -2.35
APL3	YBL037W	YDR119W-A	Q2V2P9	66 aa		0.37	□□□□□ -2.35
APL3	YBL037W	YGR121W-A	Q3E816	71 aa		0.37	□□□□□ -2.35
APL3	YBL037W	YPR108W-A	Q3E7B3	70 aa		0.37	□□□□□ -2.35
APL3	YBL037W	PAI3	P01094	68 aa		0.36	□□□□□ -2.35
APL3	YBL037W	YHR214C-D	P0CX93	97 aa		0.36	□□□□□ -2.35
APL3	YBL037W	RPC10	P40422	70 aa		0.36	□□□□□ -2.35
APL3	YBL037W	RPS29B	P41058	56 aa	Known RBP	0.36	□□□□□ -2.35
APL3	YBL037W	MRX7	P53869	86 aa		0.36	□□□□□ -2.35
APL3	YBL037W	YKL018C-A	Q3E7A7	99 aa		0.36	□□□□□ -2.35
APL3	YBL037W	YIL046W-A	Q3E7Z4	54 aa		0.36	□□□□□ -2.35

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