RNA–Protein interactions for RNA: YPL147W

PXA1, Transcript of Subunit of a heterodimeric peroxisomal ABC transport complex, yeast

Gene PXA1, Length 2,613 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria, Peroxisome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PXA1	YPL147W	FPR2	P32472	135 aa		3.67	□□□□□ -1.82
PXA1	YPL147W	FPR1	P20081	114 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
PXA1	YPL147W	TIM12	P32830	109 aa		3.67	□□□□□ -1.82
PXA1	YPL147W	AIM4	P38305	123 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
PXA1	YPL147W	DCV1	P43595	202 aa		3.66	□□□□□ -1.82
PXA1	YPL147W	CRH1	P53301	507 aa		3.66	□□□□□ -1.82
PXA1	YPL147W	YPR153W	Q06537	140 aa		3.66	□□□□□ -1.82
PXA1	YPL147W	RPL36B	O14455	100 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
PXA1	YPL147W	RPL36A	P05745	100 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
PXA1	YPL147W	PFY1	P07274	126 aa		3.66	□□□□□ -1.82
PXA1	YPL147W	RNQ1	P25367	405 aa		3.66	□□□□□ -1.82
PXA1	YPL147W	PAU4	P53427	120 aa		3.66	□□□□□ -1.82
PXA1	YPL147W	YER188C-A	P0C0V2	99 aa		3.65	□□□□□ -1.82
PXA1	YPL147W	PAU1	P0CE88	120 aa		3.65	□□□□□ -1.82
PXA1	YPL147W	PAU14	P0CE89	120 aa		3.65	□□□□□ -1.82
PXA1	YPL147W	PAU6	P0CE90	120 aa		3.65	□□□□□ -1.82
PXA1	YPL147W	PAU18	P0CE91	120 aa		3.65	□□□□□ -1.82
PXA1	YPL147W	PAU8	P0CE92	120 aa		3.65	□□□□□ -1.82
PXA1	YPL147W	PAU11	P0CE93	120 aa		3.65	□□□□□ -1.82
PXA1	YPL147W	PAU13	P38725	120 aa		3.65	□□□□□ -1.82
PXA1	YPL147W	PAU10	Q03050	120 aa		3.65	□□□□□ -1.82
PXA1	YPL147W	PAU20	Q08322	120 aa		3.65	□□□□□ -1.82
PXA1	YPL147W	YPL247C	Q12523	523 aa		3.65	□□□□□ -1.82
PXA1	YPL147W	PAU9	Q3E770	120 aa		3.65	□□□□□ -1.82
PXA1	YPL147W	YIL046W-A	Q3E7Z4	54 aa		3.65	□□□□□ -1.82
PXA1	YPL147W	RPS22A	P0C0W1	130 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
PXA1	YPL147W	RPS23A	P0CX29	145 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
PXA1	YPL147W	RPS23B	P0CX30	145 aa		3.65	□□□□□ -1.83
PXA1	YPL147W	SDH3	P33421	198 aa		3.65	□□□□□ -1.83
PXA1	YPL147W	YLR346C	Q06139	101 aa		3.65	□□□□□ -1.83
PXA1	YPL147W	BSC1	Q12140	328 aa		3.65	□□□□□ -1.83
PXA1	YPL147W	SRX1	P36077	127 aa		3.64	□□□□□ -1.83
PXA1	YPL147W	YHR125W	P38831	101 aa		3.64	□□□□□ -1.83
PXA1	YPL147W	YEL067C	P39978	195 aa		3.64	□□□□□ -1.83
PXA1	YPL147W	LST8	P41318	303 aa		3.64	□□□□□ -1.83
PXA1	YPL147W	BRR2	P32639	2163 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
PXA1	YPL147W	MIG3	P39943	394 aa		3.63	□□□□□ -1.83
PXA1	YPL147W	YDR115W	Q04598	105 aa		3.63	□□□□□ -1.83
PXA1	YPL147W	YGR035W-A	Q45U48	73 aa		3.63	□□□□□ -1.83
PXA1	YPL147W	RTC6	O14464	93 aa		3.62	□□□□□ -1.83
PXA1	YPL147W	YFL067W	P43537	175 aa		3.62	□□□□□ -1.83
PXA1	YPL147W	PRM7	Q12459	698 aa		3.62	□□□□□ -1.83
PXA1	YPL147W	YDR182W-A	Q3E796	67 aa		3.62	□□□□□ -1.83
PXA1	YPL147W	YPR013C	Q12145	317 aa		3.61	□□□□□ -1.83
PXA1	YPL147W	HSP150	P32478	413 aa		3.61	□□□□□ -1.83
PXA1	YPL147W	ERI1	P62651	68 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
PXA1	YPL147W	SED1	Q01589	338 aa		3.61	□□□□□ -1.83
PXA1	YPL147W	YMR244W	Q04018	355 aa		3.61	□□□□□ -1.83
PXA1	YPL147W	YLR146W-A	Q2V2P1	62 aa		3.61	□□□□□ -1.83
PXA1	YPL147W	FLO5	P38894	1075 aa		3.6	□□□□□ -1.83
PXA1	YPL147W	YDL241W	Q07738	123 aa		3.6	□□□□□ -1.83
PXA1	YPL147W	YGR269W	P40326	108 aa		3.6	□□□□□ -1.83
PXA1	YPL147W	RPR2	P40571	144 aa		3.6	□□□□□ -1.83
PXA1	YPL147W	YPI1	P43587	155 aa		3.6	□□□□□ -1.83
PXA1	YPL147W	YCL042W	P25572	119 aa		3.59	□□□□□ -1.83
PXA1	YPL147W	YHR022C	P38763	256 aa		3.59	□□□□□ -1.83
PXA1	YPL147W	YMR122C	Q03879	124 aa		3.59	□□□□□ -1.83
PXA1	YPL147W	YMR030W-A	Q3E760	96 aa		3.59	□□□□□ -1.83
PXA1	YPL147W	YJR085C	P47131	105 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
PXA1	YPL147W	API2	Q04413	109 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PXA1	YPL147W	YCL048W-A	Q2V2Q2	79 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PXA1	YPL147W	YCR022C	P25620	114 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PXA1	YPL147W	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
PXA1	YPL147W	MPC2	P38857	129 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PXA1	YPL147W	YGL149W	P53116	101 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PXA1	YPL147W	IRC21	Q04772	201 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PXA1	YPL147W	YFL051C	P43552	160 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PXA1	YPL147W	MRX7	P53869	86 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PXA1	YPL147W	STT4	P37297	1900 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PXA1	YPL147W	YBR056W-A	I2HB52	66 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PXA1	YPL147W	POR2	P40478	281 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PXA1	YPL147W	COX23	P38824	151 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PXA1	YPL147W	RPL26B	P53221	127 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
PXA1	YPL147W	YCR095W-A	Q3E787	52 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PXA1	YPL147W	YBR027C	P38220	110 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PXA1	YPL147W	REE1	P40893	198 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PXA1	YPL147W	YER078W-A	Q3E7A2	54 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PXA1	YPL147W	MRPL38	P35996	138 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
PXA1	YPL147W	PAU7	P39545	55 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PXA1	YPL147W	YFL012W	P43580	148 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PXA1	YPL147W	QCR8	P08525	94 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PXA1	YPL147W	YHR032W-A	P0C5N6	59 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PXA1	YPL147W	YBL071C	P38185	102 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PXA1	YPL147W	DSE2	P38844	325 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PXA1	YPL147W	CSF1	Q12150	2958 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PXA1	YPL147W	COX9	P07255	59 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PXA1	YPL147W	AGA2	P32781	87 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PXA1	YPL147W	SNA2	P56508	79 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PXA1	YPL147W	YLR194C	Q05777	254 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PXA1	YPL147W	MEC1	P38111	2368 aa		3.52	□□□□□ -1.85
PXA1	YPL147W	IGD1	P43598	195 aa		3.52	□□□□□ -1.85
PXA1	YPL147W	CYR1	P08678	2026 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
PXA1	YPL147W	YLR111W	Q12528	110 aa		3.52	□□□□□ -1.85
PXA1	YPL147W	YKL018C-A	Q3E7A7	99 aa		3.51	□□□□□ -1.85
PXA1	YPL147W	VPS68	Q12016	184 aa		3.51	□□□□□ -1.85
PXA1	YPL147W	SEC16	P48415	2195 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
PXA1	YPL147W	YKR032W	P36127	104 aa		3.5	□□□□□ -1.85
PXA1	YPL147W	BSC4	P53841	131 aa		3.5	□□□□□ -1.85
PXA1	YPL147W	CCW14	O13547	238 aa		3.49	□□□□□ -1.85
PXA1	YPL147W	YMR254C	Q04838	102 aa		3.49	□□□□□ -1.85

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 311.5 ms