RNA–Protein interactions for RNA: YKL038W

RGT1, Transcript of Glucose-responsive transcription factor, yeast

Gene RGT1, Length 3,513 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RGT1	YKL038W	URA2	P07259	2214 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
RGT1	YKL038W	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
RGT1	YKL038W	YHR022C	P38763	256 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RGT1	YKL038W	YHR213W	P0CI67	198 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RGT1	YKL038W	MDM35	O60200	86 aa		4.15	□□□□□ -1.74
RGT1	YKL038W	SPI1	P40092	148 aa		4.15	□□□□□ -1.74
RGT1	YKL038W	IRC21	Q04772	201 aa		4.15	□□□□□ -1.74
RGT1	YKL038W	RNH203	Q12338	110 aa		4.15	□□□□□ -1.74
RGT1	YKL038W	SPS100	P13130	326 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RGT1	YKL038W	YNL046W	P53956	172 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RGT1	YKL038W	IRA2	P19158	3079 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RGT1	YKL038W	RPL26A	P05743	127 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
RGT1	YKL038W	RPL26B	P53221	127 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
RGT1	YKL038W	YDR246W-A	Q3E763	66 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RGT1	YKL038W	YFL015C	P43578	164 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RGT1	YKL038W	TDA2	P40045	126 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RGT1	YKL038W	GAT4	P40569	121 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RGT1	YKL038W	YDR274C	P87283	123 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RGT1	YKL038W	VPS13	Q07878	3144 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RGT1	YKL038W	RSM18	P40033	138 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RGT1	YKL038W	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
RGT1	YKL038W	MIG3	P39943	394 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RGT1	YKL038W	IMP2	P46972	177 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RGT1	YKL038W	MRPS12	P53732	153 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RGT1	YKL038W	TOS8	P53147	276 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RGT1	YKL038W	YLR342W-A	Q3E810	57 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RGT1	YKL038W	MSA2	P36157	363 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RGT1	YKL038W	NOP10	Q6Q547	58 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
RGT1	YKL038W	RRT1	P38192	103 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RGT1	YKL038W	YJR107C-A	P0CT86	78 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RGT1	YKL038W	SHU1	P38751	150 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RGT1	YKL038W	CTR2	P38865	189 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RGT1	YKL038W	YOL085C	Q99345	113 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RGT1	YKL038W	HOT13	P36078	116 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RGT1	YKL038W	YIR020C	P40575	100 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RGT1	YKL038W	YGR025W	P53216	100 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RGT1	YKL038W	PEX17	P40155	199 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RGT1	YKL038W	YHL005C	P38752	130 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RGT1	YKL038W	YOL160W	Q08321	113 aa		4.09	□□□□□ -1.76
RGT1	YKL038W	YAL064W	P39711	94 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RGT1	YKL038W	ARC15	P40518	154 aa	RIP-Chip data	4.08	□□□□□ -1.76	not detected
RGT1	YKL038W	CRC1	Q12289	327 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RGT1	YKL038W	CCW14	O13547	238 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RGT1	YKL038W	RPB9	P27999	122 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RGT1	YKL038W	YKR045C	P36138	183 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RGT1	YKL038W	YMR122C	Q03879	124 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RGT1	YKL038W	SPG4	Q04438	115 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RGT1	YKL038W	RPS23A	P0CX29	145 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RGT1	YKL038W	RPS23B	P0CX30	145 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RGT1	YKL038W	YJL027C	P47063	138 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RGT1	YKL038W	RGM1	Q00453	211 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RGT1	YKL038W	OST5	Q92316	86 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RGT1	YKL038W	YKR073C	P36153	106 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RGT1	YKL038W	SED1	Q01589	338 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RGT1	YKL038W	YJR146W	P47174	117 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RGT1	YKL038W	SRL1	Q08673	210 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RGT1	YKL038W	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RGT1	YKL038W	PGU1	P47180	361 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RGT1	YKL038W	YDL009C	Q12210	107 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RGT1	YKL038W	YLR122C	Q12312	125 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RGT1	YKL038W	RPS30A	P0CX33	63 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RGT1	YKL038W	RPS30B	P0CX34	63 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RGT1	YKL038W	YER084W	P40057	128 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RGT1	YKL038W	YFR035C	P43608	114 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RGT1	YKL038W	YAL065C	O13511	128 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RGT1	YKL038W	MPC3	P53311	146 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RGT1	YKL038W	YOR314W	Q12506	109 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RGT1	YKL038W	SPO24	Q3E752	67 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RGT1	YKL038W	YOR020W-A	Q3E824	90 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RGT1	YKL038W	YER135C	P40082	130 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RGT1	YKL038W	YIL102C	P40488	101 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RGT1	YKL038W	RPL39	P04650	51 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RGT1	YKL038W	YPR153W	Q06537	140 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RGT1	YKL038W	YGR121W-A	Q3E816	71 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RGT1	YKL038W	YBR144C	P34215	104 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RGT1	YKL038W	YLR162W	Q06235	118 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RGT1	YKL038W	DDR48	P18899	430 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
RGT1	YKL038W	UTH1	P36135	365 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RGT1	YKL038W	QCR8	P08525	94 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RGT1	YKL038W	YEL008W	P40001	126 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RGT1	YKL038W	COX17	Q12287	69 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RGT1	YKL038W	YML100W-A	Q8TGT0	57 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RGT1	YKL038W	YER188C-A	P0C0V2	99 aa		4.01	□□□□□ -1.77
RGT1	YKL038W	YOR032W-A	Q8TGS1	66 aa		4.01	□□□□□ -1.77
RGT1	YKL038W	MRPL38	P35996	138 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
RGT1	YKL038W	YMR105W-A	Q8TGS8	64 aa		4.01	□□□□□ -1.77
RGT1	YKL038W	YEL045C	P32616	141 aa		4	□□□□□ -1.77
RGT1	YKL038W	TSC3	Q3E790	80 aa		4	□□□□□ -1.77
RGT1	YKL038W	RPL36B	O14455	100 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
RGT1	YKL038W	RPL36A	P05745	100 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
RGT1	YKL038W	POR2	P40478	281 aa		4	□□□□□ -1.77
RGT1	YKL038W	ATP18	P81450	59 aa		4	□□□□□ -1.77
RGT1	YKL038W	YBR200W-A	Q3E755	54 aa		4	□□□□□ -1.77
RGT1	YKL038W	SIP18	P50263	79 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RGT1	YKL038W	YGR035W-A	Q45U48	73 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RGT1	YKL038W	YIL086C	P40503	102 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RGT1	YKL038W	YDR010C	Q12426	110 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RGT1	YKL038W	SPC1	P46965	94 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RGT1	YKL038W	YOR011W-A	Q3E807	68 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RGT1	YKL038W	YOL166W-A	Q8TGJ1	51 aa		3.98	□□□□□ -1.77

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