RNA–Protein interactions for RNA: YGR129W

SYF2, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF2, Length 648 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF2	YGR129W	SHU1	P38751	150 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SYF2	YGR129W	ATP16	Q12165	160 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SYF2	YGR129W	YOP1	Q12402	180 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SYF2	YGR129W	COA3	Q3E7B2	85 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SYF2	YGR129W	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SYF2	YGR129W	MBF1	O14467	151 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
SYF2	YGR129W	NTF2	P33331	125 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
SYF2	YGR129W	COX10	P21592	462 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SYF2	YGR129W	ERV14	P53173	138 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SYF2	YGR129W	YCR024C-B	Q3E7Z8	88 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SYF2	YGR129W	HAP3	P13434	144 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SYF2	YGR129W	YHL018W	P38744	120 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
SYF2	YGR129W	UBC12	P52491	188 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SYF2	YGR129W	YPL257W	Q08974	193 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SYF2	YGR129W	RPS22B	Q3E7Y3	130 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SYF2	YGR129W	RPL29	P05747	59 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SYF2	YGR129W	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SYF2	YGR129W	YML079W	Q03629	201 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SYF2	YGR129W	YLL006W-A	Q3E814	58 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SYF2	YGR129W	YNL190W	P53872	204 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SYF2	YGR129W	SRB6	P32570	121 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SYF2	YGR129W	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SYF2	YGR129W	ATP14	Q12349	124 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SYF2	YGR129W	YNL042W-B	Q3E7Z2	85 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SYF2	YGR129W	QCR8	P08525	94 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SYF2	YGR129W	YNL122C	P53921	115 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SYF2	YGR129W	FMP16	Q12497	93 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SYF2	YGR129W	RPL18A	P0CX49	186 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SYF2	YGR129W	RPL18B	P0CX50	186 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SYF2	YGR129W	UGX2	P32772	223 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SYF2	YGR129W	YBR027C	P38220	110 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SYF2	YGR129W	YHL005C	P38752	130 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SYF2	YGR129W	PEX17	P40155	199 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SYF2	YGR129W	YPL073C	P40323	161 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SYF2	YGR129W	AIM11	P87275	137 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SYF2	YGR129W	YOR020W-A	Q3E824	90 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SYF2	YGR129W	BSC4	P53841	131 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SYF2	YGR129W	YEL045C	P32616	141 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SYF2	YGR129W	HPA2	Q06592	156 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SYF2	YGR129W	HTL1	Q9URQ5	78 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SYF2	YGR129W	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
SYF2	YGR129W	UIP3	P39547	235 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SYF2	YGR129W	YGL118C	P53132	145 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SYF2	YGR129W	YMR103C	Q04436	120 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SYF2	YGR129W	RPL26A	P05743	127 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
SYF2	YGR129W	MRPL11	P36521	249 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
SYF2	YGR129W	VMA21	P41806	77 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SYF2	YGR129W	RPL26B	P53221	127 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
SYF2	YGR129W	MRPS12	P53732	153 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SYF2	YGR129W	YHR007C-A	Q07074	71 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SYF2	YGR129W	YBR230W-A	Q3E762	66 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SYF2	YGR129W	YDL022C-A	P0C5L6	82 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SYF2	YGR129W	YJL127C-B	Q3E828	52 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SYF2	YGR129W	YCR007C	P25354	239 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SYF2	YGR129W	COX7	P10174	60 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SYF2	YGR129W	ATG8	P38182	117 aa	RIP-Chip data	3.04	□□□□□ -1.92	not detected
SYF2	YGR129W	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
SYF2	YGR129W	POP3	P53833	195 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
SYF2	YGR129W	YOR072W	Q08486	104 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SYF2	YGR129W	YPL261C	Q08976	102 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SYF2	YGR129W	RPL28	P02406	149 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
SYF2	YGR129W	YLR236C	A0A023PZG4	107 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SYF2	YGR129W	FYV5	P25585	152 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SYF2	YGR129W	YKR041W	P36134	250 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SYF2	YGR129W	ICY1	Q04329	127 aa		3	□□□□□ -1.93
SYF2	YGR129W	ATP5	P09457	212 aa		2.99	□□□□□ -1.93
SYF2	YGR129W	MSA2	P36157	363 aa		2.99	□□□□□ -1.93
SYF2	YGR129W	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
SYF2	YGR129W	RGM1	Q00453	211 aa		2.99	□□□□□ -1.93
SYF2	YGR129W	CYT2	Q00873	224 aa		2.99	□□□□□ -1.93
SYF2	YGR129W	IRC21	Q04772	201 aa		2.99	□□□□□ -1.93
SYF2	YGR129W	FYV12	Q08559	129 aa		2.99	□□□□□ -1.93
SYF2	YGR129W	PAU17	Q12370	124 aa		2.99	□□□□□ -1.93
SYF2	YGR129W	YNL184C	P53876	108 aa		2.98	□□□□□ -1.93
SYF2	YGR129W	RPL36B	O14455	100 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
SYF2	YGR129W	YEL067C	P39978	195 aa		2.96	□□□□□ -1.94
SYF2	YGR129W	YER134C	P40081	178 aa		2.96	□□□□□ -1.94
SYF2	YGR129W	YHR139C-A	O13536	103 aa		2.95	□□□□□ -1.94
SYF2	YGR129W	BET1	P22804	142 aa		2.95	□□□□□ -1.94
SYF2	YGR129W	Q0017	Q9ZZX8	53 aa		2.94	□□□□□ -1.94
SYF2	YGR129W	YIA6	P40556	373 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SYF2	YGR129W	HHO1	P53551	258 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SYF2	YGR129W	MID2	P36027	376 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SYF2	YGR129W	NSE4	P43124	402 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SYF2	YGR129W	YDR210W	Q03482	75 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SYF2	YGR129W	IGO2	Q9P305	131 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SYF2	YGR129W	RPS29A	P41057	56 aa	Known RBP	2.9	□□□□□ -1.95
SYF2	YGR129W	YNR077C	P53758	84 aa		2.9	□□□□□ -1.95
SYF2	YGR129W	YLR157W-D	P0CE99	70 aa		2.89	□□□□□ -1.95
SYF2	YGR129W	RSM18	P40033	138 aa		2.88	□□□□□ -1.95
SYF2	YGR129W	YOL097W-A	Q3E7Y9	61 aa		2.88	□□□□□ -1.95
SYF2	YGR129W	SFT1	P43682	97 aa		2.87	□□□□□ -1.95
SYF2	YGR129W	YJR128W	P47162	119 aa		2.87	□□□□□ -1.95
SYF2	YGR129W	YDL157C	Q12082	118 aa		2.87	□□□□□ -1.95
SYF2	YGR129W	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	2.87	□□□□□ -1.95
SYF2	YGR129W	YOR034C-A	Q3E735	80 aa		2.87	□□□□□ -1.95
SYF2	YGR129W	PAU23	Q07987	124 aa		2.86	□□□□□ -1.95
SYF2	YGR129W	FYV7	Q12247	151 aa		2.86	□□□□□ -1.95
SYF2	YGR129W	FUN14	P18411	198 aa		2.85	□□□□□ -1.95
SYF2	YGR129W	YFR057W	P43625	151 aa		2.85	□□□□□ -1.95

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