RNA–Protein interactions for RNA: YCL057W

PRD1, Transcript of Zinc metalloendopeptidase, yeastyeast

Gene PRD1, Length 2,139 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRD1YCL057W YBR209WP38311 105 aa3.41□□□□□ -1.86
PRD1YCL057W YHR022CP38763 256 aa3.41□□□□□ -1.86
PRD1YCL057W CAX4P53223 239 aa3.41□□□□□ -1.86
PRD1YCL057W COF1Q03048 143 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
PRD1YCL057W MIC12P38341 106 aa3.4□□□□□ -1.86
PRD1YCL057W RPL16BP26785 198 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
PRD1YCL057W VMA11P32842 164 aa3.4□□□□□ -1.87
PRD1YCL057W YMR244WQ04018 355 aa3.4□□□□□ -1.87
PRD1YCL057W ECM19Q06011 112 aa3.4□□□□□ -1.87
PRD1YCL057W YDR381C-AQ3E6R5 114 aa3.4□□□□□ -1.87
PRD1YCL057W CCW14O13547 238 aa3.39□□□□□ -1.87
PRD1YCL057W COX12Q01519 83 aa3.39□□□□□ -1.87
PRD1YCL057W YDR029WQ12111 104 aa3.39□□□□□ -1.87
PRD1YCL057W YOR034C-AQ3E735 80 aa3.39□□□□□ -1.87
PRD1YCL057W YOR011W-AQ3E807 68 aa3.39□□□□□ -1.87
PRD1YCL057W PEX17P40155 199 aa3.38□□□□□ -1.87
PRD1YCL057W YIL059CP40520 121 aa3.38□□□□□ -1.87
PRD1YCL057W YLR042CQ07990 161 aa3.38□□□□□ -1.87
PRD1YCL057W YPR013CQ12145 317 aa3.38□□□□□ -1.87
PRD1YCL057W YHL042WP38729 150 aa3.38□□□□□ -1.87
PRD1YCL057W SHU1P38751 150 aa3.38□□□□□ -1.87
PRD1YCL057W HUR1P45820 110 aa3.38□□□□□ -1.87
PRD1YCL057W YDL012CQ12489 107 aa3.38□□□□□ -1.87
PRD1YCL057W RPB9P27999 122 aa3.37□□□□□ -1.87
PRD1YCL057W YEL008WP40001 126 aa3.37□□□□□ -1.87
PRD1YCL057W CCW12Q12127 133 aa3.37□□□□□ -1.87
PRD1YCL057W GCN1P33892 2672 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
PRD1YCL057W MRPL24P36525 258 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
PRD1YCL057W YER135CP40082 130 aa3.36□□□□□ -1.87
PRD1YCL057W RAD6P06104 172 aa3.35□□□□□ -1.87
PRD1YCL057W YFR035CP43608 114 aa3.35□□□□□ -1.87
PRD1YCL057W ECM12O13529 151 aa3.35□□□□□ -1.87
PRD1YCL057W YER039C-AP0CD97 72 aa3.35□□□□□ -1.87
PRD1YCL057W YPL038W-AQ3E7B4 63 aa3.35□□□□□ -1.87
PRD1YCL057W MSA2P36157 363 aa3.34□□□□□ -1.87
PRD1YCL057W YHL018WP38744 120 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
PRD1YCL057W MPC2P38857 129 aa3.34□□□□□ -1.87
PRD1YCL057W SVP26P38869 228 aa3.34□□□□□ -1.87
PRD1YCL057W EMC6Q12431 108 aa3.34□□□□□ -1.87
PRD1YCL057W URA2P07259 2214 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
PRD1YCL057W QCR8P08525 94 aa3.34□□□□□ -1.88
PRD1YCL057W YNL194CP40169 301 aa3.34□□□□□ -1.88
PRD1YCL057W RGM1Q00453 211 aa3.34□□□□□ -1.88
PRD1YCL057W ARC15P40518 154 aaRIP-Chip data3.33□□□□□ -1.88not detected
PRD1YCL057W TOS8P53147 276 aa3.33□□□□□ -1.88
PRD1YCL057W YNL146C-AQ3E7Z1 64 aa3.33□□□□□ -1.88
PRD1YCL057W RPL2AP0CX45 254 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
PRD1YCL057W RPL2BP0CX46 254 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
PRD1YCL057W UBC5P15732 148 aa3.32□□□□□ -1.88
PRD1YCL057W SMD1Q02260 146 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
PRD1YCL057W YMR295CQ03559 197 aa3.32□□□□□ -1.88
PRD1YCL057W SPT4P32914 102 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
PRD1YCL057W TOM6P33448 61 aa3.31□□□□□ -1.88
PRD1YCL057W YSY6P38374 65 aa3.31□□□□□ -1.88
PRD1YCL057W TOR2P32600 2474 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
PRD1YCL057W SBH2P52871 88 aa3.31□□□□□ -1.88
PRD1YCL057W SHH4Q06236 168 aa3.31□□□□□ -1.88
PRD1YCL057W YLR285C-AQ3E771 56 aa3.31□□□□□ -1.88
PRD1YCL057W YBR219CP38317 127 aa3.3□□□□□ -1.88
PRD1YCL057W EDC1P53080 175 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
PRD1YCL057W TEL1P38110 2787 aa3.29□□□□□ -1.88
PRD1YCL057W YCR050CP25630 102 aa3.29□□□□□ -1.88
PRD1YCL057W YIR020CP40575 100 aa3.29□□□□□ -1.88
PRD1YCL057W MRPS8Q03799 155 aa3.29□□□□□ -1.88
PRD1YCL057W YJR107C-AP0CT86 78 aa3.29□□□□□ -1.88
PRD1YCL057W EDC2P40023 145 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PRD1YCL057W IRC21Q04772 201 aa3.29□□□□□ -1.88
PRD1YCL057W PMP3P87284 55 aa3.28□□□□□ -1.88
PRD1YCL057W YPL278CQ08990 100 aa3.28□□□□□ -1.88
PRD1YCL057W YLL006W-AQ3E814 58 aa3.28□□□□□ -1.88
PRD1YCL057W TAR1Q8TGM6 124 aa3.28□□□□□ -1.88
PRD1YCL057W YLR236CA0A023PZG4 107 aa3.28□□□□□ -1.89
PRD1YCL057W YLR156WP0CE96 114 aa3.28□□□□□ -1.89
PRD1YCL057W YLR159WP0CE97 114 aa3.28□□□□□ -1.89
PRD1YCL057W YLR161WP0CE98 114 aa3.28□□□□□ -1.89
PRD1YCL057W YER187WP40102 141 aa3.28□□□□□ -1.89
PRD1YCL057W MPC3P53311 146 aa3.28□□□□□ -1.89
PRD1YCL057W HOR7Q05827 59 aa3.28□□□□□ -1.89
PRD1YCL057W VAM10Q08474 114 aa3.28□□□□□ -1.89
PRD1YCL057W YRA2P36036 203 aaKnown RBP RIP-Chip data3.26□□□□□ -1.89not detected
PRD1YCL057W YOR020W-AQ3E824 90 aa3.26□□□□□ -1.89
PRD1YCL057W RPS11AP0CX47 156 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
PRD1YCL057W RPS11BP0CX48 156 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
PRD1YCL057W SPG4Q04438 115 aa3.26□□□□□ -1.89
PRD1YCL057W RPL38P49167 78 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
PRD1YCL057W SBH1P52870 82 aa3.25□□□□□ -1.89
PRD1YCL057W YDR246W-AQ3E763 66 aa3.25□□□□□ -1.89
PRD1YCL057W ATP18P81450 59 aa3.24□□□□□ -1.89
PRD1YCL057W ALG13P53178 202 aa3.23□□□□□ -1.89
PRD1YCL057W PRP8P33334 2413 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
PRD1YCL057W ATP20Q12233 115 aa3.23□□□□□ -1.89
PRD1YCL057W YMR175W-AQ3E766 64 aa3.23□□□□□ -1.89
PRD1YCL057W YBR056W-AI2HB52 66 aa3.22□□□□□ -1.89
PRD1YCL057W YFR009W-AP0C5M9 85 aa3.22□□□□□ -1.89
PRD1YCL057W BET1P22804 142 aa3.22□□□□□ -1.89
PRD1YCL057W YAR029WP39549 74 aa3.22□□□□□ -1.89
PRD1YCL057W YAL065CO13511 128 aa3.22□□□□□ -1.89
PRD1YCL057W AIM4P38305 123 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
PRD1YCL057W GAT4P40569 121 aa3.22□□□□□ -1.89
PRD1YCL057W RSM18P40033 138 aa3.21□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 18.3 ms