RNA–Protein interactions for RNA: YBR273C

UBX7, Transcript of UBX (ubiquitin regulatory X) domain-containing protein, yeast

Gene UBX7, Length 1,311 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UBX7	YBR273C	DSE2	P38844	325 aa		3.63	□□□□□ -1.83
UBX7	YBR273C	KRE9	P39005	276 aa		3.63	□□□□□ -1.83
UBX7	YBR273C	COX14	P39103	70 aa		3.63	□□□□□ -1.83
UBX7	YBR273C	AIM19	P40502	157 aa		3.63	□□□□□ -1.83
UBX7	YBR273C	RPR2	P40571	144 aa		3.63	□□□□□ -1.83
UBX7	YBR273C	CWP2	P43497	92 aa		3.63	□□□□□ -1.83
UBX7	YBR273C	SKI6	P46948	246 aa	Predicted RBP	3.63	□□□□□ -1.83
UBX7	YBR273C	COX12	Q01519	83 aa		3.63	□□□□□ -1.83
UBX7	YBR273C	YGR240C-A	Q3E786	66 aa		3.63	□□□□□ -1.83
UBX7	YBR273C	YAL063C-A	Q3E791	96 aa		3.63	□□□□□ -1.83
UBX7	YBR273C	YMR122W-A	Q3E842	84 aa		3.63	□□□□□ -1.83
UBX7	YBR273C	YBR144C	P34215	104 aa		3.62	□□□□□ -1.83
UBX7	YBR273C	UBC11	P52492	156 aa		3.62	□□□□□ -1.83
UBX7	YBR273C	YMR295C	Q03559	197 aa		3.62	□□□□□ -1.83
UBX7	YBR273C	RPL43A	P0CX25	92 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
UBX7	YBR273C	RPL43B	P0CX26	92 aa		3.61	□□□□□ -1.83
UBX7	YBR273C	YHR212W-A	P0CX91	67 aa		3.61	□□□□□ -1.83
UBX7	YBR273C	SVP26	P38869	228 aa		3.61	□□□□□ -1.83
UBX7	YBR273C	YAR1	P46683	200 aa		3.61	□□□□□ -1.83
UBX7	YBR273C	VAM10	Q08474	114 aa		3.61	□□□□□ -1.83
UBX7	YBR273C	ENV10	Q99382	181 aa		3.61	□□□□□ -1.83
UBX7	YBR273C	PRP8	P33334	2413 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
UBX7	YBR273C	MSN1	P22148	382 aa		3.6	□□□□□ -1.83
UBX7	YBR273C	MSA2	P36157	363 aa		3.6	□□□□□ -1.83
UBX7	YBR273C	YNL184C	P53876	108 aa		3.6	□□□□□ -1.83
UBX7	YBR273C	YDR381C-A	Q3E6R5	114 aa		3.6	□□□□□ -1.83
UBX7	YBR273C	PBI2	P0CT04	75 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
UBX7	YBR273C	YBR219C	P38317	127 aa		3.59	□□□□□ -1.83
UBX7	YBR273C	ERG28	P40030	148 aa		3.59	□□□□□ -1.83
UBX7	YBR273C	YDR274C	P87283	123 aa		3.59	□□□□□ -1.83
UBX7	YBR273C	PBA1	Q05778	276 aa		3.59	□□□□□ -1.83
UBX7	YBR273C	YMR175W-A	Q3E766	64 aa		3.59	□□□□□ -1.83
UBX7	YBR273C	YDL241W	Q07738	123 aa		3.58	□□□□□ -1.84
UBX7	YBR273C	YLL006W-A	Q3E814	58 aa		3.58	□□□□□ -1.84
UBX7	YBR273C	YLR236C	A0A023PZG4	107 aa		3.57	□□□□□ -1.84
UBX7	YBR273C	YPR010C-A	A5Z2X5	72 aa		3.57	□□□□□ -1.84
UBX7	YBR273C	YHR139C-A	O13536	103 aa		3.57	□□□□□ -1.84
UBX7	YBR273C	YOR304C-A	O14468	76 aa		3.57	□□□□□ -1.84
UBX7	YBR273C	YDL186W	P48568	277 aa		3.57	□□□□□ -1.84
UBX7	YBR273C	MEC1	P38111	2368 aa		3.56	□□□□□ -1.84
UBX7	YBR273C	YAL065C	O13511	128 aa		3.56	□□□□□ -1.84
UBX7	YBR273C	RAD6	P06104	172 aa		3.56	□□□□□ -1.84
UBX7	YBR273C	RDS3	Q06835	107 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
UBX7	YBR273C	CRC1	Q12289	327 aa		3.56	□□□□□ -1.84
UBX7	YBR273C	YPL229W	Q99395	206 aa		3.56	□□□□□ -1.84
UBX7	YBR273C	RPL29	P05747	59 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
UBX7	YBR273C	KNH1	P50112	268 aa		3.55	□□□□□ -1.84
UBX7	YBR273C	SHH4	Q06236	168 aa		3.55	□□□□□ -1.84
UBX7	YBR273C	EMC6	Q12431	108 aa		3.55	□□□□□ -1.84
UBX7	YBR273C	YJR107C-A	P0CT86	78 aa		3.54	□□□□□ -1.84
UBX7	YBR273C	YCR001W	P25347	104 aa		3.54	□□□□□ -1.84
UBX7	YBR273C	YHL042W	P38729	150 aa		3.54	□□□□□ -1.84
UBX7	YBR273C	COF1	Q03048	143 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
UBX7	YBR273C	ICY1	Q04329	127 aa		3.54	□□□□□ -1.84
UBX7	YBR273C	IRC21	Q04772	201 aa		3.54	□□□□□ -1.84
UBX7	YBR273C	YDR119W-A	Q2V2P9	66 aa		3.54	□□□□□ -1.84
UBX7	YBR273C	YGR035W-A	Q45U48	73 aa		3.54	□□□□□ -1.84
UBX7	YBR273C	RPC10	P40422	70 aa		3.53	□□□□□ -1.84
UBX7	YBR273C	HAL1	Q01766	294 aa		3.53	□□□□□ -1.84
UBX7	YBR273C	CUP1-1	P0CX80	61 aa		3.52	□□□□□ -1.85
UBX7	YBR273C	CUP1-2	P0CX81	61 aa		3.52	□□□□□ -1.85
UBX7	YBR273C	SMP1	P38128	452 aa		3.52	□□□□□ -1.85
UBX7	YBR273C	YGR039W	P53225	103 aa		3.52	□□□□□ -1.85
UBX7	YBR273C	SGF11	Q03067	99 aa		3.52	□□□□□ -1.85
UBX7	YBR273C	YOR034C-A	Q3E735	80 aa		3.52	□□□□□ -1.85
UBX7	YBR273C	YIR021W-A	Q3E739	70 aa		3.52	□□□□□ -1.85
UBX7	YBR273C	RPL26A	P05743	127 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
UBX7	YBR273C	YSY6	P38374	65 aa		3.51	□□□□□ -1.85
UBX7	YBR273C	MVB12	P42939	101 aa		3.51	□□□□□ -1.85
UBX7	YBR273C	SPC1	P46965	94 aa		3.51	□□□□□ -1.85
UBX7	YBR273C	RPL26B	P53221	127 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
UBX7	YBR273C	YPL038W-A	Q3E7B4	63 aa		3.51	□□□□□ -1.85
UBX7	YBR273C	RPL33A	P05744	107 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
UBX7	YBR273C	RPL33B	P41056	107 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
UBX7	YBR273C	YFL019C	P43576	117 aa		3.5	□□□□□ -1.85
UBX7	YBR273C	RSM19	P53733	91 aa	Predicted RBP	3.5	□□□□□ -1.85
UBX7	YBR273C	ATP18	P81450	59 aa		3.5	□□□□□ -1.85
UBX7	YBR273C	YPL080C	Q02826	108 aa		3.5	□□□□□ -1.85
UBX7	YBR273C	YMR320W	Q04897	101 aa		3.5	□□□□□ -1.85
UBX7	YBR273C	TSC3	Q3E790	80 aa		3.5	□□□□□ -1.85
UBX7	YBR273C	YBL039W-B	P0C268	59 aa		3.49	□□□□□ -1.85
UBX7	YBR273C	AQY2	P0CD90	149 aa		3.49	□□□□□ -1.85
UBX7	YBR273C	GAT4	P40569	121 aa		3.49	□□□□□ -1.85
UBX7	YBR273C	MPC3	P53311	146 aa		3.49	□□□□□ -1.85
UBX7	YBR273C	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	3.49	□□□□□ -1.85
UBX7	YBR273C	TOM6	P33448	61 aa		3.48	□□□□□ -1.85
UBX7	YBR273C	SFT1	P43682	97 aa		3.48	□□□□□ -1.85
UBX7	YBR273C	UBC4	P15731	148 aa		3.47	□□□□□ -1.85
UBX7	YBR273C	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		3.47	□□□□□ -1.85
UBX7	YBR273C	YAL064W	P39711	94 aa		3.46	□□□□□ -1.85
UBX7	YBR273C	YLR281C	Q05863	155 aa		3.46	□□□□□ -1.85
UBX7	YBR273C	YDR029W	Q12111	104 aa		3.46	□□□□□ -1.85
UBX7	YBR273C	YLR285C-A	Q3E771	56 aa		3.46	□□□□□ -1.85
UBX7	YBR273C	STF1	P01098	86 aa		3.45	□□□□□ -1.86
UBX7	YBR273C	YCL042W	P25572	119 aa		3.45	□□□□□ -1.86
UBX7	YBR273C	FYV5	P25585	152 aa		3.45	□□□□□ -1.86
UBX7	YBR273C	RTC6	O14464	93 aa		3.44	□□□□□ -1.86
UBX7	YBR273C	YFR009W-A	P0C5M9	85 aa		3.44	□□□□□ -1.86
UBX7	YBR273C	YHL018W	P38744	120 aa	Predicted RBP	3.44	□□□□□ -1.86
UBX7	YBR273C	TDA2	P40045	126 aa		3.44	□□□□□ -1.86

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