RNA–Protein interactions for RNA: YOL005C

RPB11, Transcript of RNA polymerase II subunit B12.5, yeast

Gene RPB11, Length 363 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPB11	YOL005C	CSH1	P38287	376 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RPB11	YOL005C	SLM6	P38343	150 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RPB11	YOL005C	RPL14B	P38754	138 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
RPB11	YOL005C	YER134C	P40081	178 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RPB11	YOL005C	SWM2	P40342	146 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RPB11	YOL005C	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
RPB11	YOL005C	PLP1	Q04004	230 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RPB11	YOL005C	YMR082C	Q04276	118 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RPB11	YOL005C	AVO2	Q04749	426 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RPB11	YOL005C	LCL2	Q08045	131 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RPB11	YOL005C	YAR023C	D6VPM8	179 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RPB11	YOL005C	RPS11A	P0CX47	156 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
RPB11	YOL005C	RPS11B	P0CX48	156 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
RPB11	YOL005C	HSP12	P22943	109 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
RPB11	YOL005C	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
RPB11	YOL005C	IMP2	P46972	177 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RPB11	YOL005C	DAD4	P69851	72 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RPB11	YOL005C	TMA23	Q03525	211 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RPB11	YOL005C	RAV2	Q03956	351 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RPB11	YOL005C	FIT2	Q08906	153 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RPB11	YOL005C	YHR213W-A	Q8TGT4	77 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RPB11	YOL005C	AHT1	P29589	182 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RPB11	YOL005C	PAM17	P36147	197 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RPB11	YOL005C	EMC5	P40540	141 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RPB11	YOL005C	SKI6	P46948	246 aa	Predicted RBP	0.92	□□□□□ -2.26
RPB11	YOL005C	COA4	Q05809	96 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RPB11	YOL005C	NAT3	Q06504	195 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RPB11	YOL005C	DAD1	Q12248	94 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RPB11	YOL005C	YPR145C-A	Q2V2P0	78 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RPB11	YOL005C	YCR075W-A	Q3E830	75 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RPB11	YOL005C	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
RPB11	YOL005C	DDR48	P18899	430 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
RPB11	YOL005C	QCR9	P22289	66 aa		0.91	□□□□□ -2.26
RPB11	YOL005C	FPR2	P32472	135 aa		0.91	□□□□□ -2.26
RPB11	YOL005C	YHL018W	P38744	120 aa	Predicted RBP	0.91	□□□□□ -2.26
RPB11	YOL005C	YNL184C	P53876	108 aa		0.91	□□□□□ -2.26
RPB11	YOL005C	YLR042C	Q07990	161 aa		0.91	□□□□□ -2.26
RPB11	YOL005C	VAM10	Q08474	114 aa		0.91	□□□□□ -2.26
RPB11	YOL005C	CCW12	Q12127	133 aa		0.91	□□□□□ -2.26
RPB11	YOL005C	YCL001W-B	Q96VH2	84 aa		0.91	□□□□□ -2.26
RPB11	YOL005C	YDR034C-A	P0C289	58 aa		0.9	□□□□□ -2.27
RPB11	YOL005C	YJL197C-A	P0C5P0	93 aa		0.9	□□□□□ -2.27
RPB11	YOL005C	YBR292C	P38357	123 aa		0.9	□□□□□ -2.27
RPB11	YOL005C	YHR173C	P38864	112 aa		0.9	□□□□□ -2.27
RPB11	YOL005C	GCV3	P39726	170 aa	Predicted RBP	0.9	□□□□□ -2.27
RPB11	YOL005C	YEL067C	P39978	195 aa		0.9	□□□□□ -2.27
RPB11	YOL005C	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
RPB11	YOL005C	ORM1	P53224	222 aa		0.9	□□□□□ -2.27
RPB11	YOL005C	YCL001W-A	P87012	153 aa		0.9	□□□□□ -2.27
RPB11	YOL005C	CWC27	Q02770	301 aa		0.9	□□□□□ -2.27
RPB11	YOL005C	YMR253C	Q04835	414 aa		0.9	□□□□□ -2.27
RPB11	YOL005C	WIP1	Q2V2P8	89 aa		0.9	□□□□□ -2.27
RPB11	YOL005C	PCC1	Q3E833	88 aa		0.9	□□□□□ -2.27
RPB11	YOL005C	RTC6	O14464	93 aa		0.89	□□□□□ -2.27
RPB11	YOL005C	COX8	P04039	78 aa		0.89	□□□□□ -2.27
RPB11	YOL005C	AQY2	P0CD90	149 aa		0.89	□□□□□ -2.27
RPB11	YOL005C	PAU1	P0CE88	120 aa		0.89	□□□□□ -2.27
RPB11	YOL005C	PAU14	P0CE89	120 aa		0.89	□□□□□ -2.27
RPB11	YOL005C	PAU6	P0CE90	120 aa		0.89	□□□□□ -2.27
RPB11	YOL005C	PAU18	P0CE91	120 aa		0.89	□□□□□ -2.27
RPB11	YOL005C	PAU8	P0CE92	120 aa		0.89	□□□□□ -2.27
RPB11	YOL005C	PAU11	P0CE93	120 aa		0.89	□□□□□ -2.27
RPB11	YOL005C	YCR023C	P25351	611 aa		0.89	□□□□□ -2.27
RPB11	YOL005C	SHG1	P38337	142 aa		0.89	□□□□□ -2.27
RPB11	YOL005C	PAU13	P38725	120 aa		0.89	□□□□□ -2.27
RPB11	YOL005C	RPB11	P38902	120 aa		0.89	□□□□□ -2.27
RPB11	YOL005C	YAL064W	P39711	94 aa		0.89	□□□□□ -2.27
RPB11	YOL005C	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
RPB11	YOL005C	SPC1	P46965	94 aa		0.89	□□□□□ -2.27
RPB11	YOL005C	SNN1	P48232	102 aa		0.89	□□□□□ -2.27
RPB11	YOL005C	RPL37A	P49166	88 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
RPB11	YOL005C	PAU4	P53427	120 aa		0.89	□□□□□ -2.27
RPB11	YOL005C	SNA2	P56508	79 aa		0.89	□□□□□ -2.27
RPB11	YOL005C	PAU10	Q03050	120 aa		0.89	□□□□□ -2.27
RPB11	YOL005C	SNO1	Q03144	224 aa		0.89	□□□□□ -2.27
RPB11	YOL005C	AIM34	Q03673	198 aa		0.89	□□□□□ -2.27
RPB11	YOL005C	YMR320W	Q04897	101 aa		0.89	□□□□□ -2.27
RPB11	YOL005C	PAU20	Q08322	120 aa		0.89	□□□□□ -2.27
RPB11	YOL005C	YOR105W	Q08504	108 aa		0.89	□□□□□ -2.27
RPB11	YOL005C	COX19	Q3E731	98 aa		0.89	□□□□□ -2.27
RPB11	YOL005C	YBR200W-A	Q3E755	54 aa		0.89	□□□□□ -2.27
RPB11	YOL005C	PAU9	Q3E770	120 aa		0.89	□□□□□ -2.27
RPB11	YOL005C	YLR342W-A	Q3E810	57 aa		0.89	□□□□□ -2.27
RPB11	YOL005C	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		0.89	□□□□□ -2.27
RPB11	YOL005C	YLL066W-B	Q8TGJ7	56 aa		0.89	□□□□□ -2.27
RPB11	YOL005C	FMP49	A0A023PZB3	126 aa		0.88	□□□□□ -2.27
RPB11	YOL005C	TIR1	P10863	254 aa		0.88	□□□□□ -2.27
RPB11	YOL005C	MRPL31	P14063	131 aa	Predicted RBP	0.88	□□□□□ -2.27
RPB11	YOL005C	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27
RPB11	YOL005C	AME1	P38313	324 aa		0.88	□□□□□ -2.27
RPB11	YOL005C	YHR140W	P38842	239 aa		0.88	□□□□□ -2.27
RPB11	YOL005C	SPI1	P40092	148 aa		0.88	□□□□□ -2.27
RPB11	YOL005C	DCV1	P43595	202 aa		0.88	□□□□□ -2.27
RPB11	YOL005C	UBC12	P52491	188 aa		0.88	□□□□□ -2.27
RPB11	YOL005C	SBH1	P52870	82 aa		0.88	□□□□□ -2.27
RPB11	YOL005C	PMP3	P87284	55 aa		0.88	□□□□□ -2.27
RPB11	YOL005C	YDR366C	P87287	132 aa		0.88	□□□□□ -2.27
RPB11	YOL005C	UPS3	Q04006	179 aa		0.88	□□□□□ -2.27
RPB11	YOL005C	TVP18	Q04767	167 aa		0.88	□□□□□ -2.27
RPB11	YOL005C	YGR240C-A	Q3E786	66 aa		0.88	□□□□□ -2.27

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