RNA–Protein interactions for RNA: YNL218W

MGS1, Transcript of Protein with DNA-dependent ATPase and ssDNA annealing activities, yeast

Gene MGS1, Length 1,764 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MGS1	YNL218W	CCW12	Q12127	133 aa		3.91	□□□□□ -1.78
MGS1	YNL218W	FCY1	Q12178	158 aa		3.91	□□□□□ -1.78
MGS1	YNL218W	KRE1	P17260	313 aa		3.91	□□□□□ -1.78
MGS1	YNL218W	ATP15	P21306	62 aa		3.91	□□□□□ -1.78
MGS1	YNL218W	YFL041W-A	Q3E817	63 aa		3.91	□□□□□ -1.78
MGS1	YNL218W	Q0255	P03881	472 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MGS1	YNL218W	YDL022C-A	P0C5L6	82 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MGS1	YNL218W	YHR022C	P38763	256 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MGS1	YNL218W	YNL194C	P40169	301 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MGS1	YNL218W	ABF2	Q02486	183 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MGS1	YNL218W	SNA4	Q07549	140 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MGS1	YNL218W	YBR200W-A	Q3E755	54 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MGS1	YNL218W	TRP1	P00912	224 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MGS1	YNL218W	QCR8	P08525	94 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MGS1	YNL218W	RPL18A	P0CX49	186 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
MGS1	YNL218W	RPL18B	P0CX50	186 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
MGS1	YNL218W	YIR021W-A	Q3E739	70 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MGS1	YNL218W	YAL063C-A	Q3E791	96 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MGS1	YNL218W	UGX2	P32772	223 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MGS1	YNL218W	VTC1	P40046	129 aa	RIP-Chip data	3.89	□□□□□ -1.79	not detected
MGS1	YNL218W	SKI6	P46948	246 aa	Predicted RBP	3.89	□□□□□ -1.79
MGS1	YNL218W	COX12	Q01519	83 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MGS1	YNL218W	RPL28	P02406	149 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
MGS1	YNL218W	YJR146W	P47174	117 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MGS1	YNL218W	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.88	□□□□□ -1.79	not detected
MGS1	YNL218W	YNL146C-A	Q3E7Z1	64 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MGS1	YNL218W	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
MGS1	YNL218W	NRG2	P38082	220 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MGS1	YNL218W	SHU1	P38751	150 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MGS1	YNL218W	YIA6	P40556	373 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MGS1	YNL218W	YDL186W	P48568	277 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MGS1	YNL218W	YPL080C	Q02826	108 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MGS1	YNL218W	PPT2	Q12036	173 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MGS1	YNL218W	PRM7	Q12459	698 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MGS1	YNL218W	SPO24	Q3E752	67 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MGS1	YNL218W	DSE2	P38844	325 aa		3.86	□□□□□ -1.79
MGS1	YNL218W	YCH1	P42937	148 aa		3.86	□□□□□ -1.79
MGS1	YNL218W	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
MGS1	YNL218W	SIM1	P40472	476 aa		3.86	□□□□□ -1.79
MGS1	YNL218W	AIM19	P40502	157 aa		3.86	□□□□□ -1.79
MGS1	YNL218W	YAR029W	P39549	74 aa		3.85	□□□□□ -1.79
MGS1	YNL218W	HUR1	P45820	110 aa		3.85	□□□□□ -1.79
MGS1	YNL218W	YGR039W	P53225	103 aa		3.85	□□□□□ -1.79
MGS1	YNL218W	MRPS12	P53732	153 aa		3.85	□□□□□ -1.79
MGS1	YNL218W	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		3.85	□□□□□ -1.79
MGS1	YNL218W	SEN1	Q00416	2231 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
MGS1	YNL218W	PBI2	P0CT04	75 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
MGS1	YNL218W	MID2	P36027	376 aa		3.84	□□□□□ -1.79
MGS1	YNL218W	MRPL24	P36525	258 aa	Predicted RBP	3.84	□□□□□ -1.79
MGS1	YNL218W	YLR042C	Q07990	161 aa		3.84	□□□□□ -1.79
MGS1	YNL218W	YBR209W	P38311	105 aa		3.84	□□□□□ -1.8
MGS1	YNL218W	YHL042W	P38729	150 aa		3.84	□□□□□ -1.8
MGS1	YNL218W	TOS8	P53147	276 aa		3.84	□□□□□ -1.8
MGS1	YNL218W	COF1	Q03048	143 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.8
MGS1	YNL218W	YPL278C	Q08990	100 aa		3.84	□□□□□ -1.8
MGS1	YNL218W	YOR011W-A	Q3E807	68 aa		3.84	□□□□□ -1.8
MGS1	YNL218W	YOL085C	Q99345	113 aa		3.84	□□□□□ -1.8
MGS1	YNL218W	ENV10	Q99382	181 aa		3.84	□□□□□ -1.8
MGS1	YNL218W	YHR139C-A	O13536	103 aa		3.83	□□□□□ -1.8
MGS1	YNL218W	TOA2	P32774	122 aa		3.83	□□□□□ -1.8
MGS1	YNL218W	YIR020C	P40575	100 aa		3.83	□□□□□ -1.8
MGS1	YNL218W	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
MGS1	YNL218W	YGL260W	P53056	76 aa		3.83	□□□□□ -1.8
MGS1	YNL218W	YNL190W	P53872	204 aa		3.83	□□□□□ -1.8
MGS1	YNL218W	PMP3	P87284	55 aa		3.83	□□□□□ -1.8
MGS1	YNL218W	PBA1	Q05778	276 aa		3.83	□□□□□ -1.8
MGS1	YNL218W	EMC6	Q12431	108 aa		3.83	□□□□□ -1.8
MGS1	YNL218W	YOR020W-A	Q3E824	90 aa		3.83	□□□□□ -1.8
MGS1	YNL218W	INO2	P26798	304 aa		3.82	□□□□□ -1.8
MGS1	YNL218W	YER135C	P40082	130 aa		3.82	□□□□□ -1.8
MGS1	YNL218W	YGR025W	P53216	100 aa		3.82	□□□□□ -1.8
MGS1	YNL218W	TIM10	P87108	93 aa		3.82	□□□□□ -1.8
MGS1	YNL218W	HOR7	Q05827	59 aa		3.82	□□□□□ -1.8
MGS1	YNL218W	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
MGS1	YNL218W	YEL008W	P40001	126 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MGS1	YNL218W	VPS55	P47111	140 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MGS1	YNL218W	RGM1	Q00453	211 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MGS1	YNL218W	YMR317W	Q04893	1140 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MGS1	YNL218W	SHH4	Q06236	168 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MGS1	YNL218W	YDR381C-A	Q3E6R5	114 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MGS1	YNL218W	MPC2	P38857	129 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MGS1	YNL218W	YIL059C	P40520	121 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MGS1	YNL218W	YML122C	Q03207	126 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MGS1	YNL218W	SPG4	Q04438	115 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MGS1	YNL218W	HFA1	P32874	2273 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MGS1	YNL218W	VMA11	P32842	164 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MGS1	YNL218W	MSA2	P36157	363 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MGS1	YNL218W	RRT13	P40042	185 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MGS1	YNL218W	CWP2	P43497	92 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MGS1	YNL218W	CAX4	P53223	239 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MGS1	YNL218W	MRPS8	Q03799	155 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MGS1	YNL218W	YMR244W	Q04018	355 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MGS1	YNL218W	SPS100	P13130	326 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MGS1	YNL218W	SVP26	P38869	228 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MGS1	YNL218W	YGL088W	P53151	121 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MGS1	YNL218W	SMP1	P38128	452 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MGS1	YNL218W	MIG3	P39943	394 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MGS1	YNL218W	RPR2	P40571	144 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MGS1	YNL218W	YPR013C	Q12145	317 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MGS1	YNL218W	YDR119W-A	Q2V2P9	66 aa		3.79	□□□□□ -1.8

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 29.6 ms