RNA–Protein interactions for RNA: YMR018W

YMR018W, Transcript of Putative protein of unknown function with similarity to human PEX5Rp, yeast

Gene YMR018W, Length 1,545 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YMR018W	YMR018W	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		2.64	□□□□□ -1.99
YMR018W	YMR018W	QCR9	P22289	66 aa		2.63	□□□□□ -1.99
YMR018W	YMR018W	ROX3	P25046	220 aa		2.63	□□□□□ -1.99
YMR018W	YMR018W	YSY6	P38374	65 aa		2.63	□□□□□ -1.99
YMR018W	YMR018W	SIM1	P40472	476 aa		2.63	□□□□□ -1.99
YMR018W	YMR018W	KEG1	P43614	200 aa		2.63	□□□□□ -1.99
YMR018W	YMR018W	ICS3	P47034	131 aa		2.63	□□□□□ -1.99
YMR018W	YMR018W	ICY1	Q04329	127 aa		2.63	□□□□□ -1.99
YMR018W	YMR018W	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	2.63	□□□□□ -1.99
YMR018W	YMR018W	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	2.63	□□□□□ -1.99
YMR018W	YMR018W	CSE2	P33308	149 aa		2.63	□□□□□ -1.99
YMR018W	YMR018W	RSM18	P40033	138 aa		2.63	□□□□□ -1.99
YMR018W	YMR018W	YPS5	P53057	165 aa		2.63	□□□□□ -1.99
YMR018W	YMR018W	YGR018C	P53211	109 aa		2.63	□□□□□ -1.99
YMR018W	YMR018W	NRM1	P53718	249 aa		2.63	□□□□□ -1.99
YMR018W	YMR018W	YDR274C	P87283	123 aa		2.63	□□□□□ -1.99
YMR018W	YMR018W	YMR181C	Q03231	154 aa		2.63	□□□□□ -1.99
YMR018W	YMR018W	YOR268C	Q08734	132 aa		2.63	□□□□□ -1.99
YMR018W	YMR018W	PPT2	Q12036	173 aa		2.63	□□□□□ -1.99
YMR018W	YMR018W	YML100W-A	Q8TGT0	57 aa		2.63	□□□□□ -1.99
YMR018W	YMR018W	HSP12	P22943	109 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
YMR018W	YMR018W	YHR173C	P38864	112 aa		2.62	□□□□□ -1.99
YMR018W	YMR018W	KRE9	P39005	276 aa		2.62	□□□□□ -1.99
YMR018W	YMR018W	YEL067C	P39978	195 aa		2.62	□□□□□ -1.99
YMR018W	YMR018W	SPI1	P40092	148 aa		2.62	□□□□□ -1.99
YMR018W	YMR018W	YNL217W	P40152	326 aa		2.62	□□□□□ -1.99
YMR018W	YMR018W	AIM19	P40502	157 aa		2.62	□□□□□ -1.99
YMR018W	YMR018W	YPI1	P43587	155 aa		2.62	□□□□□ -1.99
YMR018W	YMR018W	HUR1	P45820	110 aa		2.62	□□□□□ -1.99
YMR018W	YMR018W	MET31	Q03081	177 aa		2.62	□□□□□ -1.99
YMR018W	YMR018W	SPG4	Q04438	115 aa		2.62	□□□□□ -1.99
YMR018W	YMR018W	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
YMR018W	YMR018W	PFY1	P07274	126 aa		2.61	□□□□□ -1.99
YMR018W	YMR018W	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
YMR018W	YMR018W	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
YMR018W	YMR018W	CDC39	P25655	2108 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
YMR018W	YMR018W	ERG2	P32352	222 aa		2.61	□□□□□ -1.99
YMR018W	YMR018W	TIM12	P32830	109 aa		2.61	□□□□□ -1.99
YMR018W	YMR018W	DSE2	P38844	325 aa		2.61	□□□□□ -1.99
YMR018W	YMR018W	CTR2	P38865	189 aa		2.61	□□□□□ -1.99
YMR018W	YMR018W	YGR269W	P40326	108 aa		2.61	□□□□□ -1.99
YMR018W	YMR018W	YIL163C	P40448	117 aa		2.61	□□□□□ -1.99
YMR018W	YMR018W	PCP1	P53259	346 aa		2.61	□□□□□ -1.99
YMR018W	YMR018W	YNR077C	P53758	84 aa		2.61	□□□□□ -1.99
YMR018W	YMR018W	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	2.61	□□□□□ -1.99
YMR018W	YMR018W	YMR295C	Q03559	197 aa		2.61	□□□□□ -1.99
YMR018W	YMR018W	YHP1	Q04116	353 aa		2.61	□□□□□ -1.99
YMR018W	YMR018W	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	2.61	□□□□□ -1.99	not detected
YMR018W	YMR018W	YAL065C	O13511	128 aa		2.6	□□□□□ -1.99
YMR018W	YMR018W	LDB16	P25587	256 aa		2.6	□□□□□ -1.99
YMR018W	YMR018W	YHL005C	P38752	130 aa		2.6	□□□□□ -1.99
YMR018W	YMR018W	LST8	P41318	303 aa		2.6	□□□□□ -1.99
YMR018W	YMR018W	SPG1	P50088	95 aa		2.6	□□□□□ -1.99
YMR018W	YMR018W	YGL088W	P53151	121 aa		2.6	□□□□□ -1.99
YMR018W	YMR018W	YPL261C	Q08976	102 aa		2.6	□□□□□ -1.99
YMR018W	YMR018W	MDM35	O60200	86 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YMR018W	YMR018W	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
YMR018W	YMR018W	MRPL39	P36533	70 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YMR018W	YMR018W	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
YMR018W	YMR018W	MTC6	P38849	526 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YMR018W	YMR018W	MIG3	P39943	394 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YMR018W	YMR018W	YFL051C	P43552	160 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YMR018W	YMR018W	YGR050C	P53231	118 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YMR018W	YMR018W	SWS2	P53937	143 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YMR018W	YMR018W	ATP19	P81451	68 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YMR018W	YMR018W	YMR007W	Q03675	126 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YMR018W	YMR018W	PBA1	Q05778	276 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YMR018W	YMR018W	YOR343C	Q12484	108 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YMR018W	YMR018W	YGR121W-A	Q3E816	71 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YMR018W	YMR018W	RPL26A	P05743	127 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
YMR018W	YMR018W	TDA2	P40045	126 aa		2.58	□□□□□ -2
YMR018W	YMR018W	SLG1	P54867	378 aa		2.58	□□□□□ -2
YMR018W	YMR018W	YOR314W	Q12506	109 aa		2.58	□□□□□ -2
YMR018W	YMR018W	YKL097C	P34245	136 aa		2.58	□□□□□ -2
YMR018W	YMR018W	PET8	P38921	284 aa		2.58	□□□□□ -2
YMR018W	YMR018W	YAL064W	P39711	94 aa		2.58	□□□□□ -2
YMR018W	YMR018W	ERI1	P62651	68 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
YMR018W	YMR018W	YLR162W	Q06235	118 aa		2.58	□□□□□ -2
YMR018W	YMR018W	YDL022C-A	P0C5L6	82 aa		2.57	□□□□□ -2
YMR018W	YMR018W	IMP2	P46972	177 aa		2.57	□□□□□ -2
YMR018W	YMR018W	YOL118C	Q08259	102 aa		2.57	□□□□□ -2
YMR018W	YMR018W	DDR48	P18899	430 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
YMR018W	YMR018W	FYV5	P25585	152 aa		2.56	□□□□□ -2
YMR018W	YMR018W	AIM4	P38305	123 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
YMR018W	YMR018W	YHR022C	P38763	256 aa		2.56	□□□□□ -2
YMR018W	YMR018W	VTC1	P40046	129 aa	RIP-Chip data	2.56	□□□□□ -2	not detected
YMR018W	YMR018W	RPR2	P40571	144 aa		2.56	□□□□□ -2
YMR018W	YMR018W	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
YMR018W	YMR018W	TIM22	Q12328	207 aa		2.56	□□□□□ -2
YMR018W	YMR018W	YOR381W-A	Q3E804	55 aa		2.56	□□□□□ -2
YMR018W	YMR018W	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
YMR018W	YMR018W	YBR209W	P38311	105 aa		2.55	□□□□□ -2
YMR018W	YMR018W	MPC2	P38857	129 aa		2.55	□□□□□ -2
YMR018W	YMR018W	PAU7	P39545	55 aa		2.55	□□□□□ -2
YMR018W	YMR018W	YKL065W-A	Q2V2P2	73 aa		2.55	□□□□□ -2
YMR018W	YMR018W	YAL064W-B	O13512	126 aa		2.54	□□□□□ -2
YMR018W	YMR018W	AGA1	P32323	725 aa		2.54	□□□□□ -2
YMR018W	YMR018W	MSA2	P36157	363 aa		2.54	□□□□□ -2
YMR018W	YMR018W	SPG3	Q04398	127 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
YMR018W	YMR018W	YGR035W-A	Q45U48	73 aa		2.54	□□□□□ -2

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 63.7 ms