RNA–Protein interactions for RNA: YML043C

RRN11, Transcript of Component of the core factor (CF) rDNA transcription factor complex, yeastyeast

Gene RRN11, Length 1,524 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRN11YML043C PET191Q02772 108 aa3.37□□□□□ -1.87
RRN11YML043C YDR246W-AQ3E763 66 aa3.37□□□□□ -1.87
RRN11YML043C HUG1Q6Q5K6 68 aa3.37□□□□□ -1.87
RRN11YML043C YLR365WQ7LIF2 110 aa3.37□□□□□ -1.87
RRN11YML043C NAG1Q8TGN9 163 aa3.37□□□□□ -1.87
RRN11YML043C YNL217WP40152 326 aa3.36□□□□□ -1.87
RRN11YML043C YFR035CP43608 114 aa3.36□□□□□ -1.87
RRN11YML043C KEG1P43614 200 aa3.36□□□□□ -1.87
RRN11YML043C ICY1Q04329 127 aa3.36□□□□□ -1.87
RRN11YML043C YOR268CQ08734 132 aa3.36□□□□□ -1.87
RRN11YML043C YLR112WQ12130 139 aa3.36□□□□□ -1.87
RRN11YML043C NCE102Q12207 173 aaRIP-Chip data3.36□□□□□ -1.87not detected
RRN11YML043C YHR173CP38864 112 aa3.35□□□□□ -1.87
RRN11YML043C PET8P38921 284 aa3.35□□□□□ -1.87
RRN11YML043C ICS3P47034 131 aa3.35□□□□□ -1.87
RRN11YML043C PPT2Q12036 173 aa3.35□□□□□ -1.87
RRN11YML043C YPR108W-AQ3E7B3 70 aa3.35□□□□□ -1.87
RRN11YML043C YDL022C-AP0C5L6 82 aa3.34□□□□□ -1.87
RRN11YML043C RPB9P27999 122 aa3.34□□□□□ -1.87
RRN11YML043C YKR045CP36138 183 aa3.34□□□□□ -1.87
RRN11YML043C YHR180WP38868 163 aa3.34□□□□□ -1.87
RRN11YML043C PAU7P39545 55 aa3.34□□□□□ -1.87
RRN11YML043C VTC1P40046 129 aaRIP-Chip data3.34□□□□□ -1.87not detected
RRN11YML043C TOS8P53147 276 aa3.34□□□□□ -1.87
RRN11YML043C YOL029CQ08187 201 aa3.34□□□□□ -1.87
RRN11YML043C TSC3Q3E790 80 aa3.34□□□□□ -1.87
RRN11YML043C RPS14AP06367 137 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.88
RRN11YML043C YHR214C-DP0CX93 97 aa3.34□□□□□ -1.88
RRN11YML043C SPS100P13130 326 aa3.34□□□□□ -1.88
RRN11YML043C CTR2P38865 189 aa3.34□□□□□ -1.88
RRN11YML043C YGR050CP53231 118 aa3.34□□□□□ -1.88
RRN11YML043C YMR181CQ03231 154 aa3.34□□□□□ -1.88
RRN11YML043C YMR295CQ03559 197 aa3.34□□□□□ -1.88
RRN11YML043C YOL160WQ08321 113 aa3.34□□□□□ -1.88
RRN11YML043C TIM22Q12328 207 aa3.34□□□□□ -1.88
RRN11YML043C YLR111WQ12528 110 aa3.34□□□□□ -1.88
RRN11YML043C YBR209WP38311 105 aa3.33□□□□□ -1.88
RRN11YML043C RSM18P40033 138 aa3.33□□□□□ -1.88
RRN11YML043C SPI1P40092 148 aa3.33□□□□□ -1.88
RRN11YML043C HUA1P40325 198 aa3.33□□□□□ -1.88
RRN11YML043C AIM19P40502 157 aa3.33□□□□□ -1.88
RRN11YML043C ECO1P43605 281 aa3.33□□□□□ -1.88
RRN11YML043C YGL193CP53097 103 aa3.33□□□□□ -1.88
RRN11YML043C YDR274CP87283 123 aa3.33□□□□□ -1.88
RRN11YML043C PBA1Q05778 276 aa3.33□□□□□ -1.88
RRN11YML043C HHF1P02309 103 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
RRN11YML043C YEL045CP32616 141 aa3.32□□□□□ -1.88
RRN11YML043C AIM4P38305 123 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
RRN11YML043C MTC6P38849 526 aa3.32□□□□□ -1.88
RRN11YML043C MPC2P38857 129 aa3.32□□□□□ -1.88
RRN11YML043C TIM17P39515 158 aa3.32□□□□□ -1.88
RRN11YML043C API2Q04413 109 aa3.32□□□□□ -1.88
RRN11YML043C YML100W-AQ8TGT0 57 aa3.32□□□□□ -1.88
RRN11YML043C HSP12P22943 109 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
RRN11YML043C HOT13P36078 116 aa3.31□□□□□ -1.88
RRN11YML043C YKR032WP36127 104 aa3.31□□□□□ -1.88
RRN11YML043C NCA3P46955 337 aa3.31□□□□□ -1.88
RRN11YML043C ERI1P62651 68 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
RRN11YML043C YDL009CQ12210 107 aa3.31□□□□□ -1.88
RRN11YML043C YOR192C-CQ3E736 78 aa3.31□□□□□ -1.88
RRN11YML043C RPL26AP05743 127 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
RRN11YML043C YNL208WP40159 199 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
RRN11YML043C TOM7P53507 60 aa3.3□□□□□ -1.88
RRN11YML043C YAL065CO13511 128 aa3.29□□□□□ -1.88
RRN11YML043C ARF2P19146 181 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RRN11YML043C YHR022CP38763 256 aa3.29□□□□□ -1.88
RRN11YML043C MIG3P39943 394 aa3.29□□□□□ -1.88
RRN11YML043C TDA2P40045 126 aa3.29□□□□□ -1.88
RRN11YML043C HUR1P45820 110 aa3.29□□□□□ -1.88
RRN11YML043C PCP1P53259 346 aa3.29□□□□□ -1.88
RRN11YML043C MGR2Q02889 113 aa3.29□□□□□ -1.88
RRN11YML043C FIT2Q08906 153 aa3.29□□□□□ -1.88
RRN11YML043C YOR314WQ12506 109 aa3.29□□□□□ -1.88
RRN11YML043C YOR381W-AQ3E804 55 aa3.29□□□□□ -1.88
RRN11YML043C YGR121W-AQ3E816 71 aa3.29□□□□□ -1.88
RRN11YML043C MDM35O60200 86 aa3.29□□□□□ -1.88
RRN11YML043C LDB16P25587 256 aa3.29□□□□□ -1.88
RRN11YML043C MSA2P36157 363 aa3.29□□□□□ -1.88
RRN11YML043C DCV1P43595 202 aa3.29□□□□□ -1.88
RRN11YML043C YLR162WQ06235 118 aa3.29□□□□□ -1.88
RRN11YML043C YOR343CQ12484 108 aa3.29□□□□□ -1.88
RRN11YML043C COA3Q3E7B2 85 aa3.29□□□□□ -1.88
RRN11YML043C YHR214C-EQ8TGK0 99 aa3.29□□□□□ -1.88
RRN11YML043C RPL15AP05748 204 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
RRN11YML043C AGA1P32323 725 aa3.28□□□□□ -1.88
RRN11YML043C YHL005CP38752 130 aa3.28□□□□□ -1.88
RRN11YML043C RPL15BP54780 204 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
RRN11YML043C YLR194CQ05777 254 aa3.28□□□□□ -1.88
RRN11YML043C ATP20Q12233 115 aa3.28□□□□□ -1.88
RRN11YML043C YLR285C-AQ3E771 56 aa3.28□□□□□ -1.88
RRN11YML043C HMRA2P0CY13 119 aa3.27□□□□□ -1.89
RRN11YML043C YAL064WP39711 94 aa3.27□□□□□ -1.89
RRN11YML043C IMP2P46972 177 aa3.27□□□□□ -1.89
RRN11YML043C YGL088WP53151 121 aa3.27□□□□□ -1.89
RRN11YML043C YOL118CQ08259 102 aa3.27□□□□□ -1.89
RRN11YML043C VPS68Q12016 184 aa3.27□□□□□ -1.89
RRN11YML043C CRC1Q12289 327 aa3.27□□□□□ -1.89
RRN11YML043C RNH203Q12338 110 aa3.27□□□□□ -1.89
RRN11YML043C YLR156WP0CE96 114 aa3.26□□□□□ -1.89
RRN11YML043C YLR159WP0CE97 114 aa3.26□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 28.9 ms