RNA–Protein interactions for RNA: YJL033W

HCA4, Transcript of DEAD box RNA helicase, yeastyeast

Gene HCA4, Length 2,313 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HCA4YJL033W GPI19Q04082 140 aa3.02□□□□□ -1.93
HCA4YJL033W UPS1Q05776 175 aa3.02□□□□□ -1.93
HCA4YJL033W ROX3P25046 220 aa3.02□□□□□ -1.93
HCA4YJL033W YKL070WP36087 169 aa3.02□□□□□ -1.93
HCA4YJL033W YHL042WP38729 150 aa3.02□□□□□ -1.93
HCA4YJL033W WWM1P43582 211 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
HCA4YJL033W AIM11P87275 137 aa3.02□□□□□ -1.93
HCA4YJL033W YMR181CQ03231 154 aa3.02□□□□□ -1.93
HCA4YJL033W YLR042CQ07990 161 aa3.02□□□□□ -1.93
HCA4YJL033W YHR139C-AO13536 103 aa3.01□□□□□ -1.93
HCA4YJL033W RPL2AP0CX45 254 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
HCA4YJL033W RPL2BP0CX46 254 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
HCA4YJL033W HSP12P22943 109 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
HCA4YJL033W ECO1P43605 281 aa3.01□□□□□ -1.93
HCA4YJL033W YNR077CP53758 84 aa3.01□□□□□ -1.93
HCA4YJL033W TEL1P38110 2787 aa3.01□□□□□ -1.93
HCA4YJL033W YDL022C-AP0C5L6 82 aa3.01□□□□□ -1.93
HCA4YJL033W YCR050CP25630 102 aa3.01□□□□□ -1.93
HCA4YJL033W INO2P26798 304 aa3.01□□□□□ -1.93
HCA4YJL033W YKR032WP36127 104 aa3.01□□□□□ -1.93
HCA4YJL033W COX12Q01519 83 aa3.01□□□□□ -1.93
HCA4YJL033W YMR320WQ04897 101 aa3.01□□□□□ -1.93
HCA4YJL033W SEN1Q00416 2231 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
HCA4YJL033W VHS2P40463 436 aa3□□□□□ -1.93
HCA4YJL033W YIL029CP40538 142 aa3□□□□□ -1.93
HCA4YJL033W UBC13P52490 153 aa3□□□□□ -1.93
HCA4YJL033W FIT2Q08906 153 aa3□□□□□ -1.93
HCA4YJL033W Q0255P03881 472 aa2.99□□□□□ -1.93
HCA4YJL033W TOM6P33448 61 aa2.99□□□□□ -1.93
HCA4YJL033W SMP1P38128 452 aa2.99□□□□□ -1.93
HCA4YJL033W YER084WP40057 128 aa2.99□□□□□ -1.93
HCA4YJL033W YPL261CQ08976 102 aa2.99□□□□□ -1.93
HCA4YJL033W YOR029WQ12243 111 aa2.99□□□□□ -1.93
HCA4YJL033W BOL1Q3E793 110 aa2.99□□□□□ -1.93
HCA4YJL033W YPL038W-AQ3E7B4 63 aa2.99□□□□□ -1.93
HCA4YJL033W TOM40P23644 387 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
HCA4YJL033W VTC1P40046 129 aaRIP-Chip data2.99□□□□□ -1.93not detected
HCA4YJL033W NCA3P46955 337 aa2.99□□□□□ -1.93
HCA4YJL033W NIP7Q08962 181 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
HCA4YJL033W TRP1P00912 224 aa2.98□□□□□ -1.93
HCA4YJL033W YNL217WP40152 326 aa2.98□□□□□ -1.93
HCA4YJL033W YIA6P40556 373 aa2.98□□□□□ -1.93
HCA4YJL033W MST27P53176 234 aa2.98□□□□□ -1.93
HCA4YJL033W KTI11Q3E840 82 aa2.98□□□□□ -1.93
HCA4YJL033W LDB16P25587 256 aa2.98□□□□□ -1.93
HCA4YJL033W FPR2P32472 135 aa2.98□□□□□ -1.93
HCA4YJL033W YMR141CP40211 102 aa2.98□□□□□ -1.93
HCA4YJL033W YFL051CP43552 160 aa2.98□□□□□ -1.93
HCA4YJL033W YDR209CQ03480 137 aa2.98□□□□□ -1.93
HCA4YJL033W IGO2Q9P305 131 aa2.98□□□□□ -1.93
HCA4YJL033W RPL39P04650 51 aa2.97□□□□□ -1.93
HCA4YJL033W HMRA2P0CY13 119 aa2.97□□□□□ -1.93
HCA4YJL033W YEL045CP32616 141 aa2.97□□□□□ -1.93
HCA4YJL033W HSK3P69852 69 aa2.97□□□□□ -1.93
HCA4YJL033W TIM22Q12328 207 aa2.97□□□□□ -1.93
HCA4YJL033W PBI2P0CT04 75 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
HCA4YJL033W YHL018WP38744 120 aaPredicted RBP2.97□□□□□ -1.93
HCA4YJL033W RRT13P40042 185 aa2.97□□□□□ -1.93
HCA4YJL033W DAD4P69851 72 aa2.97□□□□□ -1.93
HCA4YJL033W YGL258W-AQ3E740 77 aa2.97□□□□□ -1.93
HCA4YJL033W VPS63O13549 108 aa2.96□□□□□ -1.94
HCA4YJL033W YRA2P36036 203 aaKnown RBP RIP-Chip data2.96□□□□□ -1.94not detected
HCA4YJL033W CTR2P38865 189 aa2.96□□□□□ -1.94
HCA4YJL033W YNL194CP40169 301 aa2.96□□□□□ -1.94
HCA4YJL033W YLR412C-AQ3E742 68 aa2.96□□□□□ -1.94
HCA4YJL033W YKL183C-AQ3E765 70 aa2.96□□□□□ -1.94
HCA4YJL033W GCN1P33892 2672 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
HCA4YJL033W RPS8AP0CX39 200 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
HCA4YJL033W RPS8BP0CX40 200 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
HCA4YJL033W MGR2Q02889 113 aa2.96□□□□□ -1.94
HCA4YJL033W IRC23Q08416 157 aa2.96□□□□□ -1.94
HCA4YJL033W YDR381C-AQ3E6R5 114 aa2.96□□□□□ -1.94
HCA4YJL033W KSH1Q8TGJ3 72 aa2.96□□□□□ -1.94
HCA4YJL033W SVP26P38869 228 aa2.95□□□□□ -1.94
HCA4YJL033W SFT1P43682 97 aa2.95□□□□□ -1.94
HCA4YJL033W COA3Q3E7B2 85 aa2.95□□□□□ -1.94
HCA4YJL033W PRP8P33334 2413 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
HCA4YJL033W IES6P32617 166 aa2.94□□□□□ -1.94
HCA4YJL033W GLE2P40066 365 aa2.94□□□□□ -1.94
HCA4YJL033W AIM19P40502 157 aa2.94□□□□□ -1.94
HCA4YJL033W PIR5P46999 287 aa2.94□□□□□ -1.94
HCA4YJL033W RPL18AP0CX49 186 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
HCA4YJL033W RPL18BP0CX50 186 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
HCA4YJL033W YMR175W-AQ3E766 64 aa2.94□□□□□ -1.94
HCA4YJL033W YBR209WP38311 105 aa2.93□□□□□ -1.94
HCA4YJL033W SIP18P50263 79 aa2.93□□□□□ -1.94
HCA4YJL033W YGR219WP53307 113 aa2.93□□□□□ -1.94
HCA4YJL033W YLR194CQ05777 254 aa2.93□□□□□ -1.94
HCA4YJL033W SHH4Q06236 168 aa2.93□□□□□ -1.94
HCA4YJL033W RRS1Q08746 203 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
HCA4YJL033W PRM7Q12459 698 aa2.93□□□□□ -1.94
HCA4YJL033W BPH1P25356 2167 aa2.93□□□□□ -1.94
HCA4YJL033W YMR31P19955 123 aa2.93□□□□□ -1.94
HCA4YJL033W BET1P22804 142 aa2.93□□□□□ -1.94
HCA4YJL033W YSY6P38374 65 aa2.93□□□□□ -1.94
HCA4YJL033W SIM1P40472 476 aa2.93□□□□□ -1.94
HCA4YJL033W YNL190WP53872 204 aa2.93□□□□□ -1.94
HCA4YJL033W GAT3Q07928 141 aa2.93□□□□□ -1.94
HCA4YJL033W YBR056W-AI2HB52 66 aa2.92□□□□□ -1.94
HCA4YJL033W PFY1P07274 126 aa2.92□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 20.7 ms