RNA–Protein interactions for RNA: YBR049C

REB1, Transcript of RNA polymerase I enhancer binding protein, yeast

Gene REB1, Length 2,433 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
REB1	YBR049C	COX12	Q01519	83 aa		2.78	□□□□□ -1.96
REB1	YBR049C	TVP15	Q03860	143 aa		2.78	□□□□□ -1.96
REB1	YBR049C	LSM6	Q06406	86 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
REB1	YBR049C	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
REB1	YBR049C	URB1	P34241	1764 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
REB1	YBR049C	YBL059W	P34224	193 aa		2.78	□□□□□ -1.97
REB1	YBR049C	REE1	P40893	198 aa		2.78	□□□□□ -1.97
REB1	YBR049C	HUR1	P45820	110 aa		2.78	□□□□□ -1.97
REB1	YBR049C	PAU12	P53343	120 aa		2.78	□□□□□ -1.97
REB1	YBR049C	FSH2	Q05015	223 aa		2.78	□□□□□ -1.97
REB1	YBR049C	ATP20	Q12233	115 aa		2.78	□□□□□ -1.97
REB1	YBR049C	YBT1	P32386	1661 aa		2.77	□□□□□ -1.97
REB1	YBR049C	YER187W	P40102	141 aa		2.77	□□□□□ -1.97
REB1	YBR049C	CIS3	P47001	227 aa		2.77	□□□□□ -1.97
REB1	YBR049C	IML1	P47170	1584 aa		2.77	□□□□□ -1.97
REB1	YBR049C	IGO1	P53897	168 aa		2.77	□□□□□ -1.97
REB1	YBR049C	YAR023C	D6VPM8	179 aa		2.77	□□□□□ -1.97
REB1	YBR049C	CRH1	P53301	507 aa		2.77	□□□□□ -1.97
REB1	YBR049C	FKS1	P38631	1876 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
REB1	YBR049C	FKS3	Q04952	1785 aa		2.76	□□□□□ -1.97
REB1	YBR049C	FYV5	P25585	152 aa		2.76	□□□□□ -1.97
REB1	YBR049C	TVP23	P38962	199 aa		2.76	□□□□□ -1.97
REB1	YBR049C	RPL22B	P56628	122 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
REB1	YBR049C	PIR1	Q03178	341 aa		2.76	□□□□□ -1.97
REB1	YBR049C	EMI1	Q04406	187 aa		2.76	□□□□□ -1.97
REB1	YBR049C	YOR015W	Q12169	119 aa		2.76	□□□□□ -1.97
REB1	YBR049C	TIM22	Q12328	207 aa		2.76	□□□□□ -1.97
REB1	YBR049C	MOT1	P32333	1867 aa		2.76	□□□□□ -1.97
REB1	YBR049C	YML122C	Q03207	126 aa		2.76	□□□□□ -1.97
REB1	YBR049C	GCN1	P33892	2672 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
REB1	YBR049C	RPL26A	P05743	127 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
REB1	YBR049C	YLR156W	P0CE96	114 aa		2.75	□□□□□ -1.97
REB1	YBR049C	YLR159W	P0CE97	114 aa		2.75	□□□□□ -1.97
REB1	YBR049C	YLR161W	P0CE98	114 aa		2.75	□□□□□ -1.97
REB1	YBR049C	MSA2	P36157	363 aa		2.75	□□□□□ -1.97
REB1	YBR049C	PAU24	P38155	120 aa		2.75	□□□□□ -1.97
REB1	YBR049C	YHP1	Q04116	353 aa		2.75	□□□□□ -1.97
REB1	YBR049C	YHR214C-D	P0CX93	97 aa		2.74	□□□□□ -1.97
REB1	YBR049C	QCR10	P37299	77 aa		2.74	□□□□□ -1.97
REB1	YBR049C	KRE9	P39005	276 aa		2.74	□□□□□ -1.97
REB1	YBR049C	YGL260W	P53056	76 aa		2.74	□□□□□ -1.97
REB1	YBR049C	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
REB1	YBR049C	YPL278C	Q08990	100 aa		2.74	□□□□□ -1.97
REB1	YBR049C	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
REB1	YBR049C	YKL023C-A	Q2V2P3	75 aa		2.74	□□□□□ -1.97
REB1	YBR049C	RIM15	P43565	1770 aa		2.74	□□□□□ -1.97
REB1	YBR049C	DNF3	Q12674	1656 aa		2.74	□□□□□ -1.97
REB1	YBR049C	VMR1	P38735	1592 aa		2.74	□□□□□ -1.97
REB1	YBR049C	IMP2	P46972	177 aa		2.73	□□□□□ -1.97
REB1	YBR049C	YPL261C	Q08976	102 aa		2.73	□□□□□ -1.97
REB1	YBR049C	YLR146W-A	Q2V2P1	62 aa		2.73	□□□□□ -1.97
REB1	YBR049C	YOR020W-A	Q3E824	90 aa		2.73	□□□□□ -1.97
REB1	YBR049C	YEL073C	P39974	107 aa		2.73	□□□□□ -1.97
REB1	YBR049C	YMR230W-A	Q3E7B5	62 aa		2.73	□□□□□ -1.97
REB1	YBR049C	YOR381W-A	Q3E804	55 aa		2.73	□□□□□ -1.97
REB1	YBR049C	PFY1	P07274	126 aa		2.72	□□□□□ -1.97
REB1	YBR049C	RRT1	P38192	103 aa		2.72	□□□□□ -1.97
REB1	YBR049C	YIL014C-A	Q02598	104 aa		2.72	□□□□□ -1.97
REB1	YBR049C	RPS22B	Q3E7Y3	130 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
REB1	YBR049C	BUD3	P25558	1636 aa		2.72	□□□□□ -1.97
REB1	YBR049C	RPS19B	P07281	144 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
REB1	YBR049C	YBR209W	P38311	105 aa		2.72	□□□□□ -1.97
REB1	YBR049C	MPC3	P53311	146 aa		2.72	□□□□□ -1.97
REB1	YBR049C	LIP1	Q03579	150 aa		2.72	□□□□□ -1.97
REB1	YBR049C	SOM1	Q05676	74 aa		2.72	□□□□□ -1.97
REB1	YBR049C	SOD1	P00445	154 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
REB1	YBR049C	RPS22A	P0C0W1	130 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
REB1	YBR049C	DSE2	P38844	325 aa		2.71	□□□□□ -1.98
REB1	YBR049C	IRC23	Q08416	157 aa		2.71	□□□□□ -1.98
REB1	YBR049C	MHF2	Q3E829	80 aa		2.71	□□□□□ -1.98
REB1	YBR049C	APC1	P53886	1748 aa		2.71	□□□□□ -1.98
REB1	YBR049C	BRP1	P53194	125 aa		2.71	□□□□□ -1.98
REB1	YBR049C	MDN1	Q12019	4910 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
REB1	YBR049C	YSY6	P38374	65 aa		2.7	□□□□□ -1.98
REB1	YBR049C	CTR2	P38865	189 aa		2.7	□□□□□ -1.98
REB1	YBR049C	YHR180W	P38868	163 aa		2.7	□□□□□ -1.98
REB1	YBR049C	MIX17	Q03667	156 aa		2.7	□□□□□ -1.98
REB1	YBR049C	MIG3	P39943	394 aa		2.7	□□□□□ -1.98
REB1	YBR049C	YDL241W	Q07738	123 aa		2.7	□□□□□ -1.98
REB1	YBR049C	IRC19	Q07843	230 aa		2.7	□□□□□ -1.98
REB1	YBR049C	PAU1	P0CE88	120 aa		2.69	□□□□□ -1.98
REB1	YBR049C	PAU14	P0CE89	120 aa		2.69	□□□□□ -1.98
REB1	YBR049C	PAU6	P0CE90	120 aa		2.69	□□□□□ -1.98
REB1	YBR049C	PAU18	P0CE91	120 aa		2.69	□□□□□ -1.98
REB1	YBR049C	PAU8	P0CE92	120 aa		2.69	□□□□□ -1.98
REB1	YBR049C	PAU11	P0CE93	120 aa		2.69	□□□□□ -1.98
REB1	YBR049C	ERG2	P32352	222 aa		2.69	□□□□□ -1.98
REB1	YBR049C	PAU13	P38725	120 aa		2.69	□□□□□ -1.98
REB1	YBR049C	ERI1	P62651	68 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
REB1	YBR049C	RGM1	Q00453	211 aa		2.69	□□□□□ -1.98
REB1	YBR049C	PAU10	Q03050	120 aa		2.69	□□□□□ -1.98
REB1	YBR049C	MET31	Q03081	177 aa		2.69	□□□□□ -1.98
REB1	YBR049C	PAU20	Q08322	120 aa		2.69	□□□□□ -1.98
REB1	YBR049C	YOR343C	Q12484	108 aa		2.69	□□□□□ -1.98
REB1	YBR049C	PAU9	Q3E770	120 aa		2.69	□□□□□ -1.98
REB1	YBR049C	ROX3	P25046	220 aa		2.69	□□□□□ -1.98
REB1	YBR049C	UTH1	P36135	365 aa		2.69	□□□□□ -1.98
REB1	YBR049C	YHR173C	P38864	112 aa		2.69	□□□□□ -1.98
REB1	YBR049C	PMD1	P32634	1753 aa		2.69	□□□□□ -1.98
REB1	YBR049C	YHL005C	P38752	130 aa		2.68	□□□□□ -1.98

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